| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,087,118 | G→A | 100% | A214T (GCC→ACC) | oruR → | ornithine utilization transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,087,118 | 0 | G | A | 100.0% | 246.5 / NA | 75 | A214T (GCC→ACC) | oruR | ornithine utilization transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/39); total (36/39) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CCGAGTTCTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCGCCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTCGCCAGGCATGGCTGGGACGGA > NC_002947/6086972‑6087262 | ccGAGTTCTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCgccacc > 6:25892/1‑149 (MQ=255) cGAGTTCTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCgccacc > 3:22060/1‑148 (MQ=255) cGAGTTCTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCgccacc > 2:251399/1‑148 (MQ=255) cGAGTTCTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGccaccg < 1:171706/149‑1 (MQ=255) ttCTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGa < 3:169038/149‑1 (MQ=255) ttCTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGa < 1:74337/149‑1 (MQ=255) cTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGAc > 8:78835/1‑148 (MQ=255) cTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGAc < 7:78835/148‑1 (MQ=255) ccTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACa < 5:25892/146‑1 (MQ=255) gtgtCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGa < 2:160146/140‑1 (MQ=255) gtgtCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGa > 1:160146/1‑140 (MQ=255) gtgtCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAAtgcc < 2:276598/147‑1 (MQ=255) tCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAAtgcctttgc > 1:62887/1‑149 (MQ=255) tCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAAtgcctttgc < 5:321904/149‑1 (MQ=255) aaaGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCg > 1:76845/1‑148 (MQ=255) aTCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGc < 7:107591/148‑1 (MQ=255) tCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAAtgccttt > 7:207848/1‑134 (MQ=255) tCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAAtgccttt < 8:207848/134‑1 (MQ=255) tCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGa > 1:256853/1‑149 (MQ=255) tgatgaCCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGATTCGAACACCCTCGCCATGCTTACCACGCGCTCTATGACGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGACTTTGCATTCGAACGGCTATGGc > 6:151705/1‑149 (MQ=255) tgaCCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTgg < 4:22060/149‑1 (MQ=255) gaCCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGa > 3:180579/1‑149 (MQ=255) aCCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGat < 2:256853/149‑1 (MQ=255) ccTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTc > 5:60590/1‑130 (MQ=255) ccTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTc < 6:60590/130‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTc > 5:100271/1‑127 (MQ=255) gCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTc < 6:100271/127‑1 (MQ=255) cTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATAtgcc > 8:75623/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATAtgc < 5:287893/148‑1 (MQ=255) ttGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTGTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGACCGGCGAGGGCTGGATAtgcc > 6:225753/1‑148 (MQ=255) ccGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGa < 7:75623/149‑1 (MQ=255) ctTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTTGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGAt < 5:225753/149‑1 (MQ=255) ctTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGAt > 1:252166/1‑149 (MQ=255) gcgcACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACt < 2:76845/149‑1 (MQ=255) gcgcACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACt > 2:26477/1‑149 (MQ=255) cTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAg < 5:151705/149‑1 (MQ=255) ttCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGa < 1:227330/77‑1 (MQ=255) ttCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGa > 2:227330/1‑77 (MQ=255) ttCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGc > 3:25285/1‑149 (MQ=255) gAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGCCCCGATTACTCACAAAGCCAt > 5:217276/1‑149 (MQ=255) acacCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGGTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATga < 1:26477/149‑1 (MQ=255) ccTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATgagcga < 5:133870/149‑1 (MQ=255) ccTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATgagc > 3:321223/1‑147 (MQ=255) ccTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATgagc > 6:133870/1‑147 (MQ=255) gCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATgagcgagc < 2:62887/147‑1 (MQ=255) cccTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCt > 5:189687/1‑149 (MQ=255) ggTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTAc > 6:307368/1‑122 (MQ=255) gTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCgg > 5:245459/1‑149 (MQ=255) ccACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGagcgagcg > 6:26206/1‑138 (MQ=255) ccACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGagcgagcg < 5:26206/138‑1 (MQ=255) cACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTgg < 5:334428/103‑1 (MQ=255) cACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTgg > 6:334428/1‑103 (MQ=255) cACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACaaa > 7:237950/1‑123 (MQ=255) cACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACaaa < 8:237950/123‑1 (MQ=255) cACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGACCGATCGGTTTCGCCACCGAGGAAAATGCCTTTGCGTAAGAACGGCGATGGCTGGAGATGACGCTGCCGCTGGCCGAACCGATTACTCGAAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGgagcgt > 5:326483/1‑147 (MQ=255) gcgcTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCAGAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGaa < 2:252166/149‑1 (MQ=255) tctATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGc < 8:234109/75‑1 (MQ=255) tctATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGc > 7:234109/1‑75 (MQ=255) tctATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCtt > 6:281760/1‑149 (MQ=255) ctATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGGTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCTGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTg < 6:294399/149‑1 (MQ=255) tGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGaa < 8:264064/148‑1 (MQ=255) ccGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAAtt > 2:244021/1‑148 (MQ=255) cGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCa > 7:228844/1‑149 (MQ=255) ggAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCAc < 4:180579/149‑1 (MQ=255) ggAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCAc < 6:189687/149‑1 (MQ=255) gAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCAcc > 3:103332/1‑149 (MQ=255) aGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGAGCCTGAACCTTGAATTCAc < 8:228844/147‑1 (MQ=255) cTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTc < 6:245459/149‑1 (MQ=255) cTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTc < 1:251399/149‑1 (MQ=255) tttCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCg < 4:161073/145‑1 (MQ=255) tttCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCg > 3:161073/1‑145 (MQ=255) tttCAATGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTCg > 4:298372/1‑149 (MQ=255) aaTGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAAcc < 6:228586/129‑1 (MQ=255) aaTGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAAcc > 5:228586/1‑129 (MQ=255) tGCCCGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTCGCCAGGc < 3:103322/149‑1 (MQ=255) cccGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGTACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAGTTCACCGGTCGCCAGGCAt < 5:281760/149‑1 (MQ=255) cGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTCGCCAGGc > 6:269825/1‑145 (MQ=255) cGATCGGTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTCGCCAGGc < 5:269825/145‑1 (MQ=255) gTTTCGCCACCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTCGCCAGGCATGGCTGGGa > 6:23814/1‑149 (MQ=255) gccaccGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTCGCCAGGCATGGCTGGGACGGa < 4:321223/148‑1 (MQ=255) | CCGAGTTCTGCCTGGTGTCGCTGAAAGTCATCTGTGATGACCTGCTTGGCCGGCCGTTGCCGCTGCTTGGCGCACGCTTCGAACACCCTCGCCCTGGTTACCACGCGCTCTATGCCGGAGCCTTTCAATGCCCGATCGGTTTCGCCGCCGAGGACAATGCCTTTGCCTTCGAACGGCGATGGCTGGATATGCCGCTGCCGCTGGCCGACCCGATTACTCACAAAGCCATGAGCGAGCGCTGCCGGCGCCTGAACCTTGAATTCACCGGTCGCCAGGCATGGCTGGGACGGA > NC_002947/6086972‑6087262 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |