| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 965,828 | C→T | 100% | A297T (GCC→ACC) | PP_0828 ← | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 965,828 | 0 | C | T | 94.5% | 216.7 / 2.0 | 74 | A297T (GCC→ACC) | PP_0828 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/3); new base T (34/35); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CAGGAGGCCCAGGCCAGCACGGTGATCATCGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGCGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGCCGATCCGCTCGATGGC > NC_002947/965685‑965969 | cAGGAGGCCCAGGCCAGCACGGTGATCATCGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTa > 6:46429/1‑149 (MQ=255) aggaggCCCAGCCCAGCACGCTGATCATCGGTATGCTGGTGTTGCTGTTGCTGCTGGATGTGTCGAGTGATGTGTAGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGCGCTGCAAAGCAGCCCCCACATCTCTCAGGTGTCTa > 1:47780/1‑148 (MQ=255) ccAGGCCAGCACGGTGATCATCGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGCGTCTACAGCCTCg > 8:179257/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCAGCACGGTGATCATCGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATATGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCg > 1:38167/1‑149 (MQ=255) cAGCACGGTGATCATCGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCacac > 3:89914/1‑149 (MQ=255) cGGTGATCATCGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTgcgc > 7:119096/1‑149 (MQ=255) cGGTGATCATCGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTgcgc < 3:106028/149‑1 (MQ=255) atcatcGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTcc < 7:54149/148‑1 (MQ=255) atcGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCt < 7:70370/149‑1 (MQ=255) ggTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCTAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGc < 4:89914/148‑1 (MQ=255) gTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCAt > 3:12733/1‑149 (MQ=255) tGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGa > 1:154853/1‑149 (MQ=255) gtgttggtgttgCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGCGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCa < 4:308307/149‑1 (MQ=255) gttggtgttgCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAgg > 3:270800/1‑149 (MQ=255) ttggtgttgCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAgg < 5:269711/148‑1 (MQ=255) ttggtgttgCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGt > 4:73450/1‑149 (MQ=255) ttgctgttgctgGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCACGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTATCAGGTGTCTACCTCCTCGGCACCCTGAGCCTCCAGCTGCATCGACTCCAGGt > 6:36316/1‑149 (MQ=255) gtgttgCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTgc > 6:18622/1‑149 (MQ=255) gtgttgCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTgc < 8:148802/149‑1 (MQ=255) tgttgCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTgcg > 8:22985/1‑149 (MQ=255) ttgCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCt < 5:18622/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTc > 4:320170/1‑148 (MQ=255) gCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTc < 7:230114/148‑1 (MQ=255) gATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGtc < 1:139315/148‑1 (MQ=255) gATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGtc < 5:134409/148‑1 (MQ=255) aTGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGtctc < 5:207873/149‑1 (MQ=255) aTGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGtctc < 4:270800/149‑1 (MQ=255) tgtCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCa > 3:6421/1‑149 (MQ=255) gAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATg > 3:175766/1‑149 (MQ=255) gAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATg < 2:38167/149‑1 (MQ=255) gAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATg < 5:46429/149‑1 (MQ=255) gTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATgg > 3:268112/1‑148 (MQ=255) aTGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATc > 3:181173/1‑149 (MQ=255) gtgtTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCa > 3:116923/1‑149 (MQ=255) tgtTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGGGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCAt < 8:11722/149‑1 (MQ=255) ttGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATc < 8:119096/148‑1 (MQ=255) ttGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATc < 4:175766/148‑1 (MQ=255) ttGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCt > 3:190816/1‑149 (MQ=255) tGCGTCCGCTCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCCGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCCCTCGTTCGTCTCGCATTTGGTATCCATCt < 6:145005/148‑1 (MQ=255) gTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGAt > 6:244419/1‑149 (MQ=255) aGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCt > 6:293829/1‑148 (MQ=255) gcgcTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGa < 4:12733/149‑1 (MQ=255) gcgcTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGa < 4:116923/149‑1 (MQ=255) cgcTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCACCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGAt > 3:278920/1‑149 (MQ=255) cgcTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGCGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGAt < 3:138739/149‑1 (MQ=255) gcTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATg < 7:10596/149‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCTGTCGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGTCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCTGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCt < 5:36316/147‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCt < 4:6421/147‑1 (MQ=255) gTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGc < 4:190816/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCACCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGctg < 4:278920/149‑1 (MQ=255) cGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATc > 8:291886/1‑136 (MQ=255) cGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATc < 7:291886/136‑1 (MQ=255) gggCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGctgaa > 6:170339/1‑149 (MQ=255) gggCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGctgaa < 8:100238/149‑1 (MQ=255) ggCCTGACGGAAATCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGctgaac < 7:22985/149‑1 (MQ=255) ggAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACgg > 4:282395/1‑149 (MQ=255) ggAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACgg > 5:191984/1‑149 (MQ=255) gggCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGc > 5:152586/1‑147 (MQ=255) gggCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCaa < 3:282395/149‑1 (MQ=255) gggCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCaa < 2:154853/149‑1 (MQ=255) cAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGt < 6:152586/149‑1 (MQ=255) aaGCAGCCCCGACATCTCTCAGGCGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGc < 7:179257/149‑1 (MQ=255) gcagcCCCGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGCCg < 3:73450/149‑1 (MQ=255) cccGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATCGTATCCATCTGGATCGGAAGCTCGCTGAACCTGAACGGTCTCTGCAAGTCCGTGCCGATcct > 5:198500/1‑148 (MQ=255) ccGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGCCGATCCGc < 5:293829/149‑1 (MQ=255) ccGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGCCGATCCGc > 4:179399/1‑149 (MQ=255) ccGACATCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGCCGATCCGc > 3:81519/1‑149 (MQ=255) aTCTCTCAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCGTGGTTGCGCGCGATCGTGTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGCCTATCCGCTCGAt < 2:47780/149‑1 (MQ=255) ctctcAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGctgaac < 7:288881/109‑1 (MQ=255) ctctcAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGctgaac > 8:288881/1‑109 (MQ=255) tctcAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGCCGATCCGCTCGATGGc > 5:229447/1‑149 (MQ=255) tctcAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGCCGATCCGCTCGATGGc > 3:203912/1‑149 (MQ=255) tcAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACggg < 5:172181/115‑1 (MQ=255) tcAGGTGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACggg > 6:172181/1‑115 (MQ=255) | CAGGAGGCCCAGGCCAGCACGGTGATCATCGGTATGCTGGTGTTGGTGTTGCTGGTGGATGTGTCGAGTGATGTGTTGCGTCAGCGCTACGTGCGGGCCTGACGGAAAGCCCGGGCTGCAAAGCAGCCCCGACATCTCTCAGGCGTCTACAGCCTCGGCACACTGCGCCTCCCGCTGCATCGACTCCAGGTTGCGCTCGATCGTCTCGCATATGGTATCCATCTGGATCTGATGCTCGCTGAACCTGAACGGGCTCTGCAAGTCCGTGCCGATCCGCTCGATGGC > NC_002947/965685‑965969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |