Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,027,999 | G→C | 6.3% | D247E (GAC→GAG) | dppA‑III ← | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,027,999 | 0 | G | C | 6.3% | 202.5 / 3.5 | 63 | D247E (GAC→GAG) | dppA‑III | dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/29); new base C (2/2); total (32/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.40e-01 |
GGCGATATAGCCGAGGTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTGGTTGATGTCGG > NC_002947/1027858‑1028147 | ggCGATATAGCCGAGGTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGACGCCTCggtgc < 1:179088/149‑2 (MQ=255) ataGCCGAGGTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGTTTCTTGTCGGCTTTTAGCTGCTCGATGTGGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATg < 1:182311/148‑1 (MQ=255) taGCCGAGGTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGc < 3:153124/149‑1 (MQ=255) ccGAGGTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCaaa < 4:219501/149‑1 (MQ=255) ccGAGGTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCa > 8:93934/1‑147 (MQ=255) ccGAGGTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGCGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCa > 8:262850/1‑147 (MQ=255) ctaGGTTGACAACTGCATGCTTCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGTCTTTTAGAGGATCTATGTCGGCCGTGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGAACTCTTTCTTCTTGAGCTTCTTCATGCTCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCaaa < 4:77702/146‑1 (MQ=255) cGAGGTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGGAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑g < 7:43806/149‑1 (MQ=255) gTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GAt > 8:265254/1‑147 (MQ=255) gTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCa > 4:202146/1‑149 (MQ=255) ttGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAg < 5:291930/149‑1 (MQ=255) aaaCCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGTGTGACCTGGCACTCTTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGtt < 3:202146/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTc < 2:191434/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATc < 5:325799/149‑1 (MQ=255) ctgctgCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCt > 3:17340/1‑149 (MQ=255) gctgcGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCtt > 2:307388/1‑148 (MQ=255) gctgcGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCtt > 5:198951/1‑148 (MQ=255) ctgcGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTc < 5:213671/148‑1 (MQ=255) ctgcGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGCGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTc < 7:262850/148‑1 (MQ=255) gCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACTTCCTCGGGc > 2:330404/1‑149 (MQ=255) ggTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGc < 6:198951/149‑1 (MQ=255) tCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTc > 5:160021/1‑149 (MQ=255) ggCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTcc < 4:17340/148‑1 (MQ=255) ggCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCt > 3:94446/1‑149 (MQ=255) cTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCttg < 7:93934/149‑1 (MQ=255) ttttAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCttgt > 5:197082/1‑149 (MQ=255) ttttAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCttgt > 1:99801/1‑149 (MQ=255) ttttAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGCGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCttgt > 1:45544/1‑149 (MQ=255) aGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGcc > 4:153992/1‑149 (MQ=255) gCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGcc < 6:160021/148‑1 (MQ=255) gATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGc < 2:329077/149‑1 (MQ=255) ggCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTcc < 1:246462/127‑1 (MQ=255) ggCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCt > 8:225441/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTgc < 1:307388/149‑1 (MQ=255) ggCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATGAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGcgcg > 5:126770/1‑149 (MQ=255) gTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTcc < 7:265254/149‑1 (MQ=255) tGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCTTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCt < 6:197082/149‑1 (MQ=255) tGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCt > 6:247374/1‑149 (MQ=255) ggAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGTTCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTc < 5:291741/149‑1 (MQ=255) aCAGGGTGACCTGGCACTCGTTGTTATTGAGCATCTGCATGCGCACAGAGGCGTCGGTGGTGATGGAAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCATTGTAGCCATTGAAGCGGATCTgc > 7:50045/1‑137 (MQ=255) aCAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTgc < 8:50045/137‑1 (MQ=255) gACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGc < 7:225441/149‑1 (MQ=255) cTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTg > 3:231811/1‑148 (MQ=255) aCTCGTTCTTCTTTAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTG‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTTGTCCTTGTGGCCCTTGAAGCGGCTCTGCGGGTCGTTCTGGTATTTGCTGAacac > 8:90985/1‑148 (MQ=255) aCTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGTGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTTGGACGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAacac > 1:98791/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCt < 4:24114/138‑1 (MQ=255) gTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCt > 3:24114/1‑138 (MQ=255) ttcttGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTTGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCTGATCTGCGGGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGcc < 1:330404/149‑1 (MQ=255) gAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCATTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGc > 1:107919/1‑149 (MQ=255) ttCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGAt > 4:5809/1‑149 (MQ=255) cTGCATGCGCACCGTGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATc < 2:98791/148‑1 (MQ=255) cATGCGCACCGAGGCGTTGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCt > 7:37102/1‑149 (MQ=255) cATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCt > 3:138652/1‑149 (MQ=255) tGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTc < 3:5809/149‑1 (MQ=255) gcgcACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCt > 5:183850/1‑149 (MQ=255) cgcACCGAGGCGGCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCCGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTg < 4:208259/149‑1 (MQ=255) accACCGACGCCTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTg > 1:67957/3‑149 (MQ=255) ccACCGACGCCTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTgg > 4:53055/2‑149 (MQ=255) cACCGACGCCTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTGGt < 2:67957/149‑1 (MQ=255) aCCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAAGGATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTACTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTGGt > 1:3667/1‑149 (MQ=255) aCCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTGGtt > 2:99940/1‑149 (MQ=255) cGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGAATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCtcg > 1:296349/1‑143 (MQ=255) gAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGTGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTGGTTGAt < 1:99940/149‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTAttt > 2:325083/1‑102 (MQ=255) gTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTAttt < 1:325083/102‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTGAAGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTGGTTGATGTcgg > 2:144738/1‑149 (MQ=255) | GGCGATATAGCCGAGGTTGAAACCGGCCTGCTGCGGCATTTGCAGGTTCTTGTCGGCTTTTAGCGGCTCGATGTCGGCCGGGCGTGGGAACAGGGTGACCTGGCACTCGTTCTTCTTGAGCTTCTGCATGCGCACCGAGGCGTCGGTGGTGATGGCAAA‑GATCAGGTT‑GTCGATCTTCACGTCCTCGGGCTGCCAGTAGTCCTTGTTGCCCTTGAAGCGGATCTGCGCGTCCTTCTGGTATTTGCTGAACACGAACGGGCCGGTGCCGATCGGCTTCTGGTTGATGTCGG > NC_002947/1027858‑1028147 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |