| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,307,218 | A→G | 6.2% | Y134H (TAC→CAC) | livK ← | branched‑chain amino acids ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,307,218 | 0 | A | G | 6.2% | 186.1 / 2.5 | 64 | Y134H (TAC→CAC) | livK | branched‑chain amino acids ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/29); new base G (2/2); total (33/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
CTTGACGGCGGTGGCGATGCCTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGG > NC_002947/1307072‑1307364 | cTTGACGGCGGTGGCGATGCCTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTa < 5:242972/147‑1 (MQ=255)cTTGACGGCGGTGGCGATGCCTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGc > 8:9640/1‑149 (MQ=255) ttGACGGCGGTGGCGATGCCTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGc > 1:172052/1‑148 (MQ=255) cggcggTGGCGATGCCTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACgg > 8:179744/1‑149 (MQ=255) gTGGCGATGCCTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGt > 6:165866/1‑149 (MQ=255) tGGCGATGCCTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTg < 3:214557/149‑1 (MQ=255) ctGCCTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTc < 6:243466/148‑1 (MQ=255) ccTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCg < 7:9640/148‑1 (MQ=255) cTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGt < 3:88781/149‑1 (MQ=255) ttCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGt > 5:207474/1‑148 (MQ=255) ctgctgCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCTGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTggcgg > 4:143275/1‑149 (MQ=255) ctTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCgggg > 7:174770/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTGGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGtgatca > 4:92242/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGtgatca < 6:207474/149‑1 (MQ=255) tGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGtgatcat < 6:85243/149‑1 (MQ=255) ggACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCgggg < 5:40774/138‑1 (MQ=255) ggACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCgggg > 6:40774/1‑138 (MQ=255) ggACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGtgatcatgatc < 3:291057/149‑1 (MQ=255) ggACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGtgatcatgat > 2:111395/1‑148 (MQ=255) cAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCt > 4:269932/1‑149 (MQ=255) aaCGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGAttt > 8:166253/1‑110 (MQ=255) aaCGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGAttt < 7:166253/110‑1 (MQ=255) ccTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGGCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTcc < 1:184795/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCt > 2:62962/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCt > 7:264890/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCAAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCt > 2:231602/1‑149 (MQ=255) tCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCg > 3:214475/1‑149 (MQ=255) cGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTc < 5:165866/147‑1 (MQ=255) ggCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑Ta < 8:264890/149‑1 (MQ=255) acttGGTCGGCGATTTAGTTTCCGTCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCTGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGt < 2:172052/145‑1 (MQ=255) aCGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTGGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGt < 3:92242/148‑1 (MQ=255) aCGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTc < 5:322712/149‑1 (MQ=255) aCGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCCGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTc > 5:283161/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTc < 7:7987/136‑1 (MQ=255) ggTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTc > 8:7987/1‑136 (MQ=255) tCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCTGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACgc < 3:143275/149‑1 (MQ=255) ggCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACgctg > 3:127748/1‑149 (MQ=255) gATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACgctggc < 5:175614/148‑1 (MQ=255) gATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACgctggc > 6:175614/1‑148 (MQ=255) tGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTTATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGctggctgg < 1:231602/149‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCGGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGtg > 1:21304/1‑149 (MQ=255) aGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTGGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTc < 5:327536/133‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTGGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTc > 6:327536/1‑133 (MQ=255) gCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGtggag < 5:281735/148‑1 (MQ=255) ccGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCTGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGtggagct < 8:223011/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGtggagct < 1:111395/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCGGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGtggagctgg < 2:21304/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGtggagctgg < 8:174770/149‑1 (MQ=255) aGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGtggagctggag > 7:109498/1‑148 (MQ=255) ggggCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCGCTAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGc < 1:64284/148‑1 (MQ=255) gggCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGcc > 8:171452/1‑148 (MQ=255) gCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGA‑TTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑tcg > 4:69902/1‑91 (MQ=255) cGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGtt > 8:271402/1‑149 (MQ=255) ggAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGt < 7:210836/120‑1 (MQ=255) ggAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGt > 8:210836/1‑120 (MQ=255) gAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGa > 6:198442/1‑149 (MQ=255) aaaTCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGAc < 5:261493/148‑1 (MQ=255) aaaTCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGAc > 6:261493/1‑148 (MQ=255) tCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACt > 3:49963/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACtt > 3:270679/1‑149 (MQ=255) aGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACttt < 7:179744/149‑1 (MQ=255) aGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCGGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACttt < 1:62962/149‑1 (MQ=255) ttGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCGGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTAGACGCCGTCGATGCCCACTttgtt > 4:201344/1‑149 (MQ=255) gTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTgg > 2:83934/1‑149 (MQ=255) tAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTgg < 7:171452/148‑1 (MQ=255) | CTTGACGGCGGTGGCGATGCCTTCACCGTACTGCTGCTTGTCGTGCAGGACGGCAACGACCTTCGGCTTGACGTGGTCGGCGATGTAGTTGCCGGCAGCCGGGCCCTGGGCGCTGTCCAGGCCGATGGTGCGGAAAATCAGCTTGTAGCCACGGGCGGTGATTTCCGGTGAGGTGGCGGCCGGGGTGATCATGATCACGCCTTCGTCCTCG‑TAGATGTCGGACGCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGG > NC_002947/1307072‑1307364 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |