Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,387,895 | G→A | 5.7% | intergenic (+121/+1) | PP_1208 → / ← PP_1209 | SlyX family protein/cold‑shock protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,387,895 | 0 | G | A | 5.7% | 213.6 / 2.2 | 70 | intergenic (+121/+1) | PP_1208/PP_1209 | SlyX family protein/cold‑shock protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/28); new base A (2/2); total (40/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 |
GAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGCCCGAAAGTGCACGAAGATGTCATCG > NC_002947/1387751‑1388037 | gagGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCaa < 5:182915/149‑1 (MQ=255) gccatccgcggtgagggccaccgcattctggtcgaaggccagcgcgtggagttttcggtgatgcaccgcgacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAAcggc > 6:55084‑M1/110‑149 (MQ=255) cccGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCCCAGGTATGATGCTGCGTGCAGGTGCAGCCCGGCCGTTGTGGCCGGGGGTTTGCCGTTGATAGCTAG‑GGCCGGAACGCCGTTGGTAAAcggcg > 8:308043/1‑149 (MQ=255) ccGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAAcggcgg < 6:77063/149‑1 (MQ=255) gCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGACCAAcggctgac < 7:174496/149‑5 (MQ=255) gCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGACCAAcggctgac < 2:96596/149‑5 (MQ=255) cATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGc > 6:77001/1‑148 (MQ=255) attGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCa > 5:143380/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCAc > 1:306720/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCAc > 2:250768/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCAc < 6:143380/149‑1 (MQ=255) aGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACt > 6:281090/1‑138 (MQ=255) aGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACt < 5:281090/138‑1 (MQ=255) aGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTc > 3:264264/1‑149 (MQ=255) gttCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTc < 5:77001/148‑1 (MQ=255) ttCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCgg > 4:151998/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCt > 7:42261/1‑149 (MQ=255) aGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTg < 2:232082/149‑1 (MQ=255) gctgctATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACCGCAACCACGTCTTCGGCCTGCa < 7:50729/149‑1 (MQ=255) ctgctATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAg > 2:303615/1‑149 (MQ=255) ctATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAgg < 3:151998/147‑1 (MQ=255) tATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGccc > 5:146063/1‑149 (MQ=255) tATCGCCGGCAACCCATGCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGccc < 7:308043/149‑1 (MQ=255) ggCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTcgc < 8:26266/149‑1 (MQ=255) ggCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTcgc > 8:269213/1‑149 (MQ=255) cAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCgg < 4:60968/149‑1 (MQ=255) aaGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGt < 6:146063/149‑1 (MQ=255) gccagccCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCACCCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑g > 5:99363/1‑148 (MQ=255) gccagccCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑g > 1:155870/1‑148 (MQ=255) cagccCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTCGGGCGGGACAGCCTTGGGTCAACGGCGGTTTCATGAACCCCCGTGTGCGGCGTGCGGGCCATTGACGCGGG‑‑G‑c > 2:229279/1‑148 (MQ=255) cccccACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCAc < 3:274087/149‑1 (MQ=255) aGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAAc > 2:44966/1‑149 (MQ=255) tATGATGCTGCCTTCAGGTGTAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTc > 7:79517/1‑148 (MQ=255) tgatgCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTcgc > 6:280857/1‑127 (MQ=255) tgatgCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTcgc < 5:280857/127‑1 (MQ=255) gacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAAcggcgg < 2:227578‑M1/42‑1 (MQ=255) gacaagggcctgcaggccgaagacgtggttgcagtaaaccGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAAcggcgg > 1:227578‑M1/41‑82 (MQ=255) ctgcCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCt > 1:203157/1‑149 (MQ=255) tgcCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTg > 3:76696/1‑117 (MQ=255) tgcCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTg < 4:76696/117‑1 (MQ=255) gcCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTgg > 4:286756/1‑149 (MQ=255) cTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGcc < 7:269213/149‑1 (MQ=255) tCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCtt > 1:153397/1‑149 (MQ=255) tGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGAc > 8:306697/1‑148 (MQ=255) cagcaCGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGAc > 8:83627/1‑146 (MQ=255) agcaCGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGc < 4:174137/91‑1 (MQ=255) agcaCGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGc < 4:169922/91‑1 (MQ=255) agcaCGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGc > 3:174137/1‑91 (MQ=255) agcaCGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGc > 3:169922/1‑91 (MQ=255) aCGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATg > 8:253105/1‑149 (MQ=255) cGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCAcc < 7:225824/115‑1 (MQ=255) cGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCAcc > 8:225824/1‑115 (MQ=255) cccTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑GCCATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCgg < 1:229279/149‑1 (MQ=255) ccTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTg < 8:79517/149‑1 (MQ=255) ccTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTg > 7:2096/1‑149 (MQ=255) ttGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAAc > 1:10824/1‑115 (MQ=255) ttGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAAc < 2:10824/115‑1 (MQ=255) gtgGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGcc < 4:264264/148‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGGGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCGCTc < 2:153397/148‑1 (MQ=255) gTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCgg < 7:253105/148‑1 (MQ=255) CCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGcc > 8:42261‑M1/1‑149 (MQ=255) CGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGccc < 2:112928‑M1/149‑1 (MQ=255) cGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTAGAGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTAGCGGT‑‑G‑CCTCACCGAAAACTCCCCGCCCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTTGCCCTCCCCGCGGATTGCCCGAAATTGCa > 1:215784/1‑149 (MQ=255) cGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGCCCGAAAGTGCa < 3:286756/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGTAGG‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGCCCGAAAGTGCAc > 1:266988/1‑148 (MQ=255) gCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGCCCGAAAGTGCACg > 4:43904/1‑146 (MQ=255) gTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGACTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGCCCGAAAGTGCACGAAGATg > 2:141572/1‑148 (MQ=255) ccgCCGTTGACCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGCCCGAAAGTGCACGAAGATGTCa > 2:240577/3‑149 (MQ=255) ccgCCGTTGACCAAAGGAGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGACTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGCGCGCAAGTGCACGATGCTGTct > 4:51246/3‑148 (MQ=255) ccGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGCCCGAAAGTGCACGAAGATGTCATCg > 3:242871/1‑149 (MQ=255) | GAGGCCCCGCCTCCTCATTATTGAGTTGTTCCAGGCTGCTATCGCCGGCAAGCCAGCCCCCACAGGTATGATGCTGCCTTCAGGTGCAGCACGGCCCTTGTGGGCGCTGGTTTGCCGTTGATAGCGTC‑GGCCGGTCAGCCGTTGGTCAACGGCGGTTTACTGCAACCACGTCTTCGGCCTGCAGGCCCTTGTCGCGGT‑‑G‑CATCACCGAAAACTCCACGCGCTGGCCTTCGACCAGAATGCGGTGGCCCTCACCGCGGATGGCCCGAAAGTGCACGAAGATGTCATCG > NC_002947/1387751‑1388037 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |