Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,901,761 | A→T | 6.3% | D771V (GAC→GTC) | PP_1703 → | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,901,761 | 0 | A | T | 6.3% | 180.8 / 3.0 | 64 | D771V (GAC→GTC) | PP_1703 | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/29); new base T (2/2); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.01e-01 |
CCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATGGCATCAG > NC_002947/1901617‑1901909 | cccTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAg < 3:202308/149‑1 (MQ=255) ccTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAgg > 8:219417/1‑149 (MQ=255) ttGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGCGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGcc > 4:180537/1‑149 (MQ=255) gATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGccc < 3:45624/148‑1 (MQ=255) tGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGTCCAGGcccagcag < 8:81008/149‑6 (MQ=255) gAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGcc > 7:22842/1‑148 (MQ=255) aaCACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCgcgc < 4:79673/146‑1 (MQ=255) cagCCACTGTAGAGCCTCTCCGCATCCCGACAGCCACCCTGTACCGTCTGCTAGCCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCAGAAGAAGAGCTTCATTACCTCAAAGGATTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCACTCGCCGAggg > 3:220097/3‑148 (MQ=255) cACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGACATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTAc > 7:218762/1‑149 (MQ=255) aCTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTAcc > 5:237977/1‑149 (MQ=255) gagCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCt > 1:322289/1‑149 (MQ=255) cTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCg < 7:219417/149‑1 (MQ=255) cTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCg < 8:22842/149‑1 (MQ=255) tGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCgg > 2:145355/1‑149 (MQ=255) gTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGc < 7:78975/149‑1 (MQ=255) cGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAg > 5:286755/1‑149 (MQ=255) aTGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTgc < 6:286755/149‑1 (MQ=255) aCCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGACATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCgct < 8:218762/149‑1 (MQ=255) cGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCGTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCgctgg < 1:50736/149‑1 (MQ=255) gTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGTCAGcc > 8:66534/1‑149 (MQ=255) tGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCa < 4:114051/138‑1 (MQ=255) tGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCa > 3:114051/1‑138 (MQ=255) cTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgt < 4:15780/148‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgttt > 3:64273/1‑149 (MQ=255) gCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTc > 3:106194/1‑149 (MQ=255) gCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTc > 6:276309/1‑149 (MQ=255) cggCACACCTTGCCGGGTCCGGTGCGGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGa < 8:238408/147‑1 (MQ=255) cTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAATAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGa < 3:132479/149‑1 (MQ=255) cacaCCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgttt < 7:193999/137‑1 (MQ=255) cacaCCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgttt > 8:193999/1‑137 (MQ=255) cacaCCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACgg > 2:244374/1‑149 (MQ=255) acCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGTCCAGGccc < 6:276877/76‑1 (MQ=255) acCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGTCCAGGccc > 5:276877/1‑76 (MQ=255) acCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAg > 3:6696/1‑125 (MQ=255) acCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAg < 4:6696/125‑1 (MQ=255) acCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCCCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGc < 5:44043/147‑1 (MQ=255) acCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCCCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGc > 6:44043/1‑147 (MQ=255) cTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGa > 5:139958/1‑141 (MQ=255) cTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGa < 6:139958/141‑1 (MQ=255) tCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTgcg > 7:162452/1‑100 (MQ=255) tCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTgcg < 8:162452/100‑1 (MQ=255) ggCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTCCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTc < 2:281050/148‑1 (MQ=255) ggCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGccc < 5:276309/149‑1 (MQ=255) cGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGTCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGc < 7:66534/149‑1 (MQ=255) aagaagAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCt > 6:222079/1‑149 (MQ=255) gaagaGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGc < 3:180537/149‑1 (MQ=255) gagCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAAc > 3:319409/1‑149 (MQ=255) gCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTg > 5:63686/1‑149 (MQ=255) gTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCGGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCa < 1:244374/149‑1 (MQ=255) tCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGGCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCAc > 6:204085/1‑149 (MQ=255) aTTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCAccc < 4:64273/149‑1 (MQ=255) ttACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCa > 6:161415/1‑149 (MQ=255) ttACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCa > 3:237983/1‑149 (MQ=255) cTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATcgc > 6:60124/1‑149 (MQ=255) tGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATcgcg > 6:211663/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCgg > 1:36068/1‑149 (MQ=255) cAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCgg > 7:202559/1‑148 (MQ=255) cAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCgg < 2:36068/148‑1 (MQ=255) aaGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGca > 2:26709/1‑149 (MQ=255) tggTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGGGCCGCTGTCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGGCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGTcac < 6:237977/148‑1 (MQ=255) ctgGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCgcgc < 4:319409/148‑1 (MQ=255) cgggCCTGGTCCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCa > 7:15060/2‑149 (MQ=255) gCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATgg < 5:161415/149‑1 (MQ=255) gACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATGGCATCa < 4:106194/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATGGCATCAg < 5:211663/149‑1 (MQ=255) | CCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATGGCATCAG > NC_002947/1901617‑1901909 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |