| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,290,397 | C→G | 5.5% | intergenic (+22/‑253) | pepN → / → PP_2018 | aminopeptidase N/BNR domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,290,397 | 0 | C | G | 5.5% | 296.1 / 5.3 | 91 | intergenic (+22/‑253) | pepN/PP_2018 | aminopeptidase N/BNR domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/38); new base G (2/3); total (50/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
CTGACACGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACCCACCAAA > NC_002947/2290250‑2290544 | cTGACACGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCa < 6:246257/149‑1 (MQ=255) acacGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAg < 5:104445/147‑1 (MQ=255) acGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCATGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCgg > 1:215248/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGccc > 2:80013/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGcccc < 4:86584/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGACCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCTGGGCGGcccc < 5:292542/149‑1 (MQ=255) gcgcAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCTGGGCGGccccaa < 2:229077/148‑3 (MQ=255) gcAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCtt > 1:18718/1‑149 (MQ=255) cAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCttt > 3:234296/1‑149 (MQ=255) aaGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTCGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTc < 1:80013/149‑1 (MQ=255) gcgTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGacaac > 6:281510/1‑148 (MQ=255) gTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGAcaacaa > 3:6461/1‑148 (MQ=255) aGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTTAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAAc < 1:216755/148‑1 (MQ=255) aGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCAGCCGACAACAAAACa < 2:215248/149‑1 (MQ=255) aGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAATGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACa > 5:87183/1‑149 (MQ=255) cgc‑TGTTGAAGGGTGACCTGCAGCGCATGGTGGGTGGGGGTAAGTTGCCCCGTCCTGTGTAGTCGGTTGTCAGCAACAGGCTGGCTTAATGCGGGTGAATGGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTCCCCCGGCCCACAACAAAACATaa < 4:111896/149‑1 (MQ=255) cgc‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGGCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACa < 7:9895/146‑1 (MQ=255) cgc‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACa > 8:9895/1‑146 (MQ=255) cgc‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATaa < 4:234296/149‑1 (MQ=255) tgatgaAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAacac > 5:75818/1‑149 (MQ=255) tgatgaAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGGTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAacac > 8:304401/1‑149 (MQ=255) atgaAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACAcc‑c > 6:333112/1‑149 (MQ=255) gggTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCACGGCTTTCCCAGGCCGCCAACAAAACATAAAACc‑cagccc > 4:193342/1‑149 (MQ=255) gTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGt > 8:229529/1‑149 (MQ=255) tGAGTTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGtt < 7:180038/149‑1 (MQ=255) tGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGTCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGtt > 4:313843/1‑149 (MQ=255) cTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATaa > 8:194367/1‑132 (MQ=255) gAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTc < 2:18718/148‑1 (MQ=255) gcgcATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCttt < 1:222253/104‑1 (MQ=255) gcgcATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCttt > 2:222253/1‑104 (MQ=255) gcgcATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCg > 5:123258/1‑149 (MQ=255) aTTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAATGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCaaa < 6:87183/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCaaa > 2:10145/1‑148 (MQ=255) tGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATc > 1:181331/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATcc < 3:313843/148‑1 (MQ=255) cTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCCTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATccc < 5:333112/148‑1 (MQ=255) ggTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATaa > 3:290370/1‑111 (MQ=255) ggTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATaa < 4:290370/111‑1 (MQ=255) gTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTAc > 7:40519/1‑148 (MQ=255) aGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAt < 1:10145/148‑1 (MQ=255) gTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAtct > 1:290801/1‑149 (MQ=255) ttGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAtctc > 7:297903/1‑149 (MQ=255) tCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATctcct < 2:290801/148‑1 (MQ=255) cAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATctcctc > 1:180826/1‑147 (MQ=255) gTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGc > 6:79803/1‑149 (MQ=255) gtATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTccc < 2:5671/112‑1 (MQ=255) tATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAg > 6:117904/1‑149 (MQ=255) tGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACTATTGTTAACACCATGGGCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAgg > 1:271525/1‑149 (MQ=255) tGACGTTGTCAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGc < 4:198669/149‑1 (MQ=255) aGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTTGTTAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCct < 3:177448/149‑1 (MQ=255) ttGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTa < 8:40519/149‑1 (MQ=255) gtgAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCctc > 3:142138/1‑145 (MQ=255) aGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCa < 5:79803/149‑1 (MQ=255) gCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCa < 4:6461/148‑1 (MQ=255) gCAACAGGCGGGCGTACATCTGCTCAATGGCGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAg < 6:39664/149‑1 (MQ=255) agagTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCt > 6:90139/1‑149 (MQ=255) tCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCt > 3:129509/1‑149 (MQ=255) cTGGCGTAATTCTGGTGAATTTGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCACGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCt < 3:193342/148‑1 (MQ=255) ggCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGc > 1:92523/1‑148 (MQ=255) gCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTAtt < 2:287307/121‑1 (MQ=255) gCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTAtt > 1:287307/1‑121 (MQ=255) cGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCaaa < 6:75818/149‑1 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tGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCaa > 4:127130/1‑149 (MQ=255) tGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCaa > 7:21964/1‑149 (MQ=255) tGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAACTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAATGCCTGCaa > 4:260856/1‑149 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCaa < 5:117904/147‑1 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAAt < 1:307018/148‑1 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATg > 1:81711/1‑149 (MQ=255) aaTTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCAt > 2:13723/1‑149 (MQ=255) aaTTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATAAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCAt < 1:13723/149‑1 (MQ=255) ttGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCATTCCCCGGCCGCCAACAAAACAAAACACC‑CCGCCCGATGAACACCCGCAAACAACCCCGCTCCGATCACCTCAAGCTATAGCAGGCCTCTAGATCAGGCTATCTGCAAAGCCAGAAATGCAtag > 4:41131/1‑147 (MQ=255) ccggggCCGCTGGGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCAtt < 7:212946/146‑1 (MQ=255) ccggggCCGCTGGGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCAtt > 8:212946/3‑148 (MQ=255) ggggCCGCTGGGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTAGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCACCTCAAGCTATTGCCGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTCCAAACCCTGCAATGCATAGAc > 8:112684/1‑149 (MQ=255) ggCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGAcc > 6:237890/1‑148 (MQ=255) ggCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGAcc < 5:237890/148‑1 (MQ=255) gccgccCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACcca > 2:173211/1‑149 (MQ=255) gccgccCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACcca < 3:127130/149‑1 (MQ=255) ccgccCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTAATCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACccac < 7:304401/149‑1 (MQ=255) cgccCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACccac > 4:6542/1‑148 (MQ=255) gccCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACccacc > 3:312914/1‑148 (MQ=255) cccAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACccacca > 2:219279/1‑148 (MQ=255) ccAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACCCACCaaa < 6:123258/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAAAACA‑CCGCCAGTAGTACTCCATCAAACAACACCTCTACGATCTAAACAAGCTATTGCAGGACTCTATATCAGCCTTTCTGCAAAGCCTGAAATCCATTAACCCACaaaa > 5:247260/1‑148 (MQ=255) | CTGACACGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGC‑TGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCCGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACC‑CCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACCCACCAAA > NC_002947/2290250‑2290544 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |