| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 274,151 | A→T | 6.8% | L140Q (CTG→CAG) | PP_0221 ← | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 274,151 | 0 | A | T | 6.8% | 172.0 / 2.6 | 59 | L140Q (CTG→CAG) | PP_0221 | methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/24); new base T (2/2); total (33/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 | |||||||||||
TCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGC > NC_002947/274007‑274292 | tCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCcagcagcagcag < 8:283562/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGc > 2:99089/1‑149 (MQ=255) tAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGCTCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCt < 5:8410/149‑1 (MQ=255) ggCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTg < 5:42903/148‑1 (MQ=255) ggCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGt < 2:124592/149‑1 (MQ=255) cgTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGAt < 2:133607/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGt > 2:42965/1‑149 (MQ=255) gTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCcagcagcag < 5:107049/121‑1 (MQ=255) gTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCcagcagcag > 6:107049/1‑121 (MQ=255) gTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTggtcgggtcg > 2:255249/1‑149 (MQ=255) cACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGGCTCCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGtt < 1:99089/149‑1 (MQ=255) cGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGa > 5:201797/1‑149 (MQ=255) ccTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGc > 2:19187/1‑123 (MQ=255) ccTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGc < 1:19187/123‑1 (MQ=255) tGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCt < 5:87963/119‑1 (MQ=255) tGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCt > 6:87963/1‑119 (MQ=255) tGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCt > 5:57532/1‑149 (MQ=255) gAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTg > 7:69303/1‑149 (MQ=255) gAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTg > 5:48233/1‑149 (MQ=255) aaGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTgg > 1:137279/1‑149 (MQ=255) ggATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCATTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGgcg > 1:73601/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCTGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCtt > 1:269279/1‑147 (MQ=255) ttAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCt < 1:42965/148‑1 (MQ=255) gTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCt > 1:53378/1‑143 (MQ=255) gTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCt < 2:53378/143‑1 (MQ=255) cGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCa > 3:34056/1‑143 (MQ=255) cGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCa < 4:34056/143‑1 (MQ=255) cGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCtt < 2:137279/149‑1 (MQ=255) gAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCttt < 8:69303/149‑1 (MQ=255) aGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCtttt < 3:225020/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTAc < 8:14436/148‑1 (MQ=255) cAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACttt > 1:128478/1‑149 (MQ=255) aGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACtttt > 6:64743/1‑149 (MQ=255) ccTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTc > 7:64015/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGt < 5:64743/149‑1 (MQ=255) cTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGc > 8:218332/1‑149 (MQ=255) cTTGTAGCCCACCCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTAGGCGATGGCAACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAgga > 6:178022/1‑148 (MQ=255) cccACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACgtt > 7:135223/1‑149 (MQ=255) ccACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACgttg > 5:300642/1‑149 (MQ=255) gacGG‑‑GCTTGAGGGTGATGAACCCTGCCTTGGCCAGCAGCAGCTGGCGTCTGGCGCTGTTTTTCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTGAGTCAGCTGGGGTATGCTTTTGTTGTTTTTCGTGTTTTGGCCAACGTTGTtg‑a < 6:352/147‑1 (MQ=255) gCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTtg‑a < 2:73601/149‑1 (MQ=255) cGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTtg‑at > 5:320899/1‑148 (MQ=255) gCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑atgatg > 8:287634/1‑149 (MQ=255) ttGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCAGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGcc > 4:113192/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTtg‑a > 6:18838/1‑140 (MQ=255) gAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTtg‑a < 5:18838/140‑1 (MQ=255) ggTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCggg > 6:125551/1‑55 (MQ=255) ggTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCggg < 6:48233/148‑1 (MQ=255) gTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGc < 6:201797/149‑1 (MQ=255) gTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGc > 2:192255/1‑149 (MQ=255) acagcGGCCGTGGCCTGCTGCTGCTGGCCAAGGCCG‑GGTTGATCAGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAgg > 5:104129/5‑148 (MQ=37) acagcGGCCGTGGCCTGCTGCTGCTGGCCAAGGCCG‑GGTTGATCAGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAGGc < 6:104129/145‑1 (MQ=37) aCCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAgg > 2:40999/1‑148 (MQ=255) cccGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTc > 5:143142/1‑106 (MQ=255) cccGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTc < 6:143142/106‑1 (MQ=255) agcGGCCGTGGCCTGCTGCTGCTGGCCAAGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACgttg > 7:187448/3‑124 (MQ=38) cGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCATTTGTACTTTTTCGAGTTCAGGCCAACGTTGGTG‑ATGATGCCCGGGCCGTAAGGcac > 1:283533/1‑148 (MQ=255) gCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAg > 5:328262/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAgg < 6:328262/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGCTGCTGGCCAAGGCCG‑GGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGaa < 6:122425/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTGCATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGtt < 1:192255/148‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGaa < 1:40999/149‑1 (MQ=255) cagcagcagcagGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGc < 7:287634/149‑1 (MQ=255) | TCGGCGTCGTCGTAGGCGCGTACCAGTTGCACCGCCTCGACCTGAAGGATCTTCAGCTTTTTAGGGTTGGCGAGGATGTCAGCCTCGGTGGCCTTGTAGCCCACGCCGG‑‑GCTTGAGGGTGATCAACCCGGCCTTGGCCAGCAGCAGCAGGCCACGGCCGCTGTTGATCGGGTCGTTGGCGATGGCCACGCTGGCGCCTTCAGGCAGCTCGGCAAAGCTTTTGTACTTTTTCGAGTACAGGCCAACGTTGTTG‑ATGATGCCCGGGGCGTAAGGCACAAGGTTGAAGC > NC_002947/274007‑274292 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |