| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,417,966 | C→G | 5.1% | A334G (GCG→GGG) | PP_2119 → | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,417,966 | 0 | C | G | 5.1% | 324.1 / 5.4 | 97 | A334G (GCG→GGG) | PP_2119 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/48); new base G (3/2); total (47/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.24e-01 | |||||||||||
GCAGCATTCGTGTTCTACAGCCTGATCGTCGGCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGCCCTGGTAGGC > NC_002947/2417818‑2418108 | gcagcaTTCGTGTTCTACAGCCTGATCGTCGGCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGgc < 5:20613/149‑1 (MQ=255) caTTCGTGTTCTACAGCCTGATCGTCGGCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAg < 7:166060/149‑1 (MQ=255) tgtTCTACAGCCTGATCGTCGGCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGtgct‑g < 8:28277/149‑1 (MQ=255) tGATCGTCGGCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCgg > 8:60020/1‑149 (MQ=255) tcgtcgGCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGGGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGc > 1:268523/1‑148 (MQ=255) gtcgGCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAg > 7:261904/1‑149 (MQ=255) cgGCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCg < 2:79903/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTCCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCg < 7:60020/148‑1 (MQ=255) cAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTc < 2:268523/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCa > 4:314118/1‑149 (MQ=255) gcCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCggcagca < 8:207306/140‑6 (MQ=255) gcCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCggcagca > 7:207306/1‑135 (MQ=255) ccTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATc < 2:201375/149‑1 (MQ=255) cGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAg < 6:15201/148‑1 (MQ=255) ggTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGc < 2:192377/131‑1 (MQ=255) ggTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGc > 1:192377/1‑131 (MQ=255) ccTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCaa > 5:323677/1‑148 (MQ=255) ccTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCaa > 8:275639/1‑148 (MQ=255) ccTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCaa > 3:257675/1‑148 (MQ=255) tGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCg > 6:96443/1‑149 (MQ=255) gAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCgt < 2:93341/149‑1 (MQ=255) aGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCgtg > 6:88399/1‑149 (MQ=255) gTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGtt > 6:191550/1‑149 (MQ=255) gTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGtt > 6:42677/1‑149 (MQ=255) gTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGtt > 1:14911/1‑149 (MQ=255) gATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCg > 7:78166/1‑149 (MQ=255) gCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCg > 3:274235/1‑114 (MQ=255) gCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCg < 4:274235/114‑1 (MQ=255) cGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCt > 7:266988/1‑126 (MQ=255) cGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCt < 8:266988/126‑1 (MQ=255) gCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGtg > 3:261222/1‑88 (MQ=255) gCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGtg < 4:261222/88‑1 (MQ=255) tGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCa > 6:253118/1‑149 (MQ=255) cAACGGGCCGCGGGCGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACg > 8:174798/1‑149 (MQ=255) aCGGGCCGCGGGTGCAGCCGCGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTACACGGc > 8:201285/1‑149 (MQ=255) cGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGcc > 6:286537/1‑149 (MQ=255) gggCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGcc > 8:87606/1‑148 (MQ=255) ggCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCa > 7:149776/1‑105 (MQ=255) ggCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCa < 8:149776/105‑1 (MQ=255) cgcgGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCg > 7:285300/1‑128 (MQ=255) cgcgGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCg < 8:285300/128‑1 (MQ=255) gcgGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGt < 5:88399/149‑1 (MQ=255) cgGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTg < 4:63691/149‑1 (MQ=255) gggTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTgg < 8:78166/149‑1 (MQ=255) gTGCAGGCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCa < 6:138248/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCa < 5:96443/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCa < 2:14911/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCa < 8:261904/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCa < 7:275639/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCata > 2:8517/1‑98 (MQ=255) tGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCata < 1:8517/98‑1 (MQ=255) gCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCa < 7:25750/144‑1 (MQ=255) gCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCa > 8:25750/1‑144 (MQ=255) gCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGt < 5:42677/149‑1 (MQ=255) gCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGt > 7:148446/1‑149 (MQ=255) ccttgcgcATTGCGTAACTTTTGGCCGGGCGAAGTGCAATCCTGCACCCCGTTCTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTc < 1:271740/145‑1 (MQ=255) aGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGAc > 4:165498/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATTGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGgcct > 1:285495/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGc < 4:208364/124‑1 (MQ=255) aTTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGc > 3:208364/1‑124 (MQ=255) tGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGgcct > 6:162528/1‑147 (MQ=255) gCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGgcctga < 7:28894/148‑1 (MQ=255) gCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGgcctga < 7:47324/148‑1 (MQ=255) ccGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGgcctgag < 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gcAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCggg < 3:314118/149‑1 (MQ=255) gcAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCggg < 5:253118/149‑1 (MQ=255) aGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTgg > 8:48651/1‑109 (MQ=255) aGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCa < 5:239040/149‑1 (MQ=255) aGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCATACCCTTCACGGCCCACGGTgg < 7:48651/109‑1 (MQ=255) gCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGAc > 4:136453/1‑149 (MQ=255) ccATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑GACCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCACCAGGTCGTGTTCGCTTCCCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGAc > 1:39084/1‑149 (MQ=255) ccATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCg > 5:300013/1‑135 (MQ=255) ccATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCg < 6:300013/135‑1 (MQ=255) agcaccTGCGCCACGTCGGGGGGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGgc < 1:45369/115‑1 (MQ=255) agcaccTGCGCCACGTCGGGGGGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGgc > 2:45369/5‑119 (MQ=255) tCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGTCCATCGAACCCGGGCAGACCGTc < 6:199071/149‑1 (MQ=255) accTGCGCCACGTCGGGGGGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTc > 8:112471/2‑149 (MQ=255) cTGCGCCACGTCGGGGGGCAGGTGCTGG‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCAt > 1:171620/1‑129 (MQ=255) cTGCGCCACGTCGGGGGGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCAt < 2:171620/128‑1 (MQ=255) cTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGc > 4:130174/1‑149 (MQ=255) cTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGc < 7:87606/149‑1 (MQ=255) ccccccGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGCCCt > 4:131829/1‑149 (MQ=255) ccccccGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGCCCt > 6:321027/1‑149 (MQ=255) cccccGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGCCCTg < 8:231551/149‑1 (MQ=255) cccGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGCCCTgg > 7:51004/1‑148 (MQ=255) cccGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGCCCTGGt < 1:131349/149‑1 (MQ=255) aCGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGCCCTGGTAGGc < 8:66653/149‑1 (MQ=255) | GCAGCATTCGTGTTCTACAGCCTGATCGTCGGCAGCGCCTTCGGTACCCTCAGTGAGGTGATCGGCGAGCTGCAACGGGCCGCGGGTGCAGCCGAGCGCATTGCCGAACTGTTGGCCGCGCGCAGTGCCATCCTGCCCCCCGACGTGGCGCAGGTGCT‑G‑CCGCAGCCGCGGGCCAGCGGTCATATCGAGCTGCAACAGGTCGTGTTCGCTTACCCTTCACGGCCCACGGTGGCAGCTGTCGACGGCCTGAGCCTGACCATCGAACCCGGGCAGACCGTCGCCCTGGTAGGC > NC_002947/2417818‑2418108 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |