| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,457,000 | T→A | 5.2% | L24Q (CTG→CAG) | PP_2150 → | thiamine biosynthesis lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,457,000 | 0 | T | A | 5.2% | 345.4 / 4.6 | 108 | L24Q (CTG→CAG) | PP_2150 | thiamine biosynthesis lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/49); new base A (3/3); total (56/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.32e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGT > NC_002947/2456855‑2457147 | aCAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTggg > 1:297884/1‑149 (MQ=255) cAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTgg < 1:290880/147‑1 (MQ=255) cAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTgg < 6:158846/147‑1 (MQ=255) cAGGATTATCGCTGCCACTTTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTgg < 5:309105/147‑1 (MQ=255) aGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGggtg < 5:135560/149‑1 (MQ=255) ggATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCAGGCGCTCCAGggtgg < 3:122893/149‑1 (MQ=255) ttATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTcc < 4:90579/149‑1 (MQ=255) cTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCAt > 6:211559/1‑149 (MQ=255) gCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATgg > 4:296972/1‑149 (MQ=255) ccccTGTAGCAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATg < 3:76859/147‑1 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgc < 5:211559/149‑1 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGGTTTACACGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACACTACTGTGCGCACAGCCCTAGTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGACTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGGCTGGGTGGTCCGACCaagcg > 2:271631/1‑144 (MQ=39) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGcagcag > 6:176159/1‑149 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGggtggt < 3:185943/130‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGggtggt > 4:185943/1‑130 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGa > 7:85928/1‑133 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagca > 2:184881/1‑145 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTa > 6:98927/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGACCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagca < 1:184881/145‑1 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACAGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGACGTACTGTACATAATGCTCCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCACACCCTGGACCTCCAGGGTGGTCCGACATTGGGCAGCACCTACac > 6:188593/1‑147 (MQ=255) 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ggCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGa < 6:298763/149‑1 (MQ=255) gCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAg > 1:7798/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGAGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGc > 3:256132/1‑149 (MQ=255) gCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtg > 3:2034/1‑149 (MQ=255) cGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCtggtgg > 2:157292/1‑149 (MQ=255) cGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATACAGTACGTc > 7:65182/1‑135 (MQ=255) cGGCAACAGAGAAAGCCTACTGTGCTCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGATACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTc < 8:65182/135‑1 (MQ=255) ggCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGc > 3:80750/1‑149 (MQ=255) ccGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCt < 3:264397/149‑1 (MQ=255) cGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATc > 1:220118/1‑119 (MQ=255) cGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATc < 2:220118/119‑1 (MQ=255) gagaAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagc < 1:136636/106‑1 (MQ=255) gagaAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGgcagc > 2:136636/1‑106 (MQ=255) gaAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCg > 7:111537/1‑149 (MQ=255) aaCCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCgg < 4:2034/148‑1 (MQ=255) cccTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGccc < 2:7798/149‑1 (MQ=255) cccTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGccc < 2:2517/149‑1 (MQ=255) ccTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGcc > 1:144993/1‑147 (MQ=255) cTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAg < 4:20877/149‑1 (MQ=255) cTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTg > 5:46919/1‑149 (MQ=255) gcgcACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTg > 7:85840/1‑145 (MQ=255) ccTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTg > 1:163949/1‑148 (MQ=255) cTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGaaa < 1:182056/149‑1 (MQ=255) cTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGaaa < 8:85840/148‑1 (MQ=255) tGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAAc > 6:94586/1‑148 (MQ=255) tGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGAATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGAGGCACGCTG‑CCGGCCCAGTTGCAGATGGCGGTGGAAAc > 7:148574/1‑148 (MQ=255) ttCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAgg < 1:22023/127‑1 (MQ=255) ttCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAgg > 2:22023/1‑127 (MQ=255) tCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGt > 8:235199/1‑127 (MQ=255) tCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGt < 7:235199/127‑1 (MQ=255) cATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGAGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATc < 2:297884/148‑1 (MQ=255) cATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGAGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATc < 4:256132/148‑1 (MQ=255) cATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACAAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATcc > 1:65652/1‑149 (MQ=255) aTTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCATGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCATGGTGGCCCGCTG‑CAGGACCACGTGCAGATGGCGGTGGAAAACATCCt > 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cACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAg > 7:29895/1‑73 (MQ=255) aCCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGacca > 5:334041/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGacca > 2:221813/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGac < 6:46919/147‑1 (MQ=255) aCCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CAGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGacca > 2:174481/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGAAACCAATGCCCCAGCCTGGAGCGCCTGGGTGGTGCGACGATGGGCAGCAGCTACAGCTTCCAGTACGTCCGCGAGCCTTGTGGCCCGGTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGATACCATCCTGCACGACATCGaccac < 5:188593/149‑1 (MQ=255) gCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGAccacca > 5:332015/1‑149 (MQ=255) cTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACcaccac > 6:149659/1‑148 (MQ=255) ccAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGa < 1:174481/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGGCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGa < 8:250907/149‑1 (MQ=255) cAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGAc < 3:296972/149‑1 (MQ=255) aaGGCCCCAACCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATACAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCACAGGAGCAGATGGAGGTGGAAACCATCATTCAAGACATCGACCACACCTACTCGAc > 8:280230/1‑148 (MQ=255) cggaccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGaaa > 4:39892/5‑112 (MQ=255) cggaccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGaaa < 3:39892/108‑1 (MQ=255) ccACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CAGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACcgc > 3:3443/1‑149 (MQ=255) ccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCg < 1:142348/101‑1 (MQ=255) ccACCCAGGCGCTCCAGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCg > 2:142348/1‑101 (MQ=255) cccTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCgcggc > 7:53245/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGaccacc > 3:74446/1‑128 (MQ=255) cTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGCCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGa < 5:196950/149‑1 (MQ=255) gAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGAtt < 5:149659/148‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAg > 4:180454/1‑79 (MQ=255) gcgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAg < 3:180454/79‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCgcggcg < 2:240652/143‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCgcggcg > 1:240652/1‑143 (MQ=255) gcgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCa < 7:29589/149‑1 (MQ=255) cgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CAGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCTACCTACCGCGGCGATTCCAt < 4:80750/149‑1 (MQ=255) tGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGt > 1:79006/1‑148 (MQ=255) | ACAGGATTATCGCTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACCGGCAACCGAGAAACCCTACTGTGCGCACAGCCCTACTGTTCATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTG‑CCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGT > NC_002947/2456855‑2457147 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |