| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 294,408 | C→G | 6.4% | T202T (ACC→ACG) | ssuC → | aliphatic sulfonatesABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 294,408 | 0 | C | G | 6.4% | 195.6 / 4.3 | 63 | T202T (ACC→ACG) | ssuC | aliphatic sulfonatesABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/25); new base G (2/2); total (36/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.40e-01 | |||||||||||
GGTGGAAATGGCGCGCAGTTACGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTGGAGCGCGTGTGGTTGC > NC_002947/294267‑294556 | ggtggAAATGGCGCGCAGTTACGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCg < 6:111413/148‑1 (MQ=255) gtggAAATGGCGCGCAGTTACGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGc > 8:75801/1‑149 (MQ=255) gAAATGGCGCGCAGTTACGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCaa > 2:225258/1‑149 (MQ=255) cgcAGTTACGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAATGGTTTCGGcaa < 5:84930/139‑3 (MQ=255) cgcAGTTACGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAATGGTTTCGGcaa > 6:84930/1‑137 (MQ=255) aCGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTAc > 8:143131/1‑149 (MQ=255) cGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCgg < 7:197466/128‑1 (MQ=255) cGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCgg > 8:197466/1‑128 (MQ=255) cGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTAc < 8:105591/148‑1 (MQ=255) cTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTgg > 5:173615/1‑149 (MQ=255) gTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCaa > 6:303941/1‑149 (MQ=255) tCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCTGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCaat > 7:50115/1‑149 (MQ=255) cGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAATGGTTTCGGcaaca < 7:104130/124‑5 (MQ=255) cGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAATGGTTTCGGcaaca > 8:104130/1‑120 (MQ=255) cGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCaatga < 5:288957/149‑1 (MQ=255) gCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCaatgaat < 3:201236/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTcgc > 7:10761/1‑148 (MQ=255) ccGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGc > 4:320751/1‑129 (MQ=255) ccGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGc < 3:320751/129‑1 (MQ=255) ccGCCAGGTGACCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATt‑tc > 2:31111/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACTCTTATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATt‑tctt < 5:72506/149‑1 (MQ=255) gCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCaat > 6:83923/1‑130 (MQ=255) gCCAGGTGACCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGATACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATt‑tctt < 1:31111/149‑1 (MQ=255) cAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑TGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCa < 1:234472/149‑1 (MQ=255) cAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTAc > 4:45081/1‑120 (MQ=255) aTCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGa > 8:42618/1‑149 (MQ=255) tCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGAc < 6:205737/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATc < 3:27432/105‑1 (MQ=255) tGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTg > 5:304027/1‑149 (MQ=255) ccGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTgg < 7:75801/148‑1 (MQ=255) ggggCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGt < 1:287392/143‑1 (MQ=255) ggggCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGt > 2:287392/1‑143 (MQ=255) ggCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTCGGCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCa > 1:49711/1‑110 (MQ=255) ggCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCa < 2:49711/109‑1 (MQ=255) gcTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTgg < 6:173615/149‑1 (MQ=255) gcTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTgg < 7:42618/149‑1 (MQ=255) tGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCaatgaat > 2:176036/1‑110 (MQ=255) tGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCaatgaat < 1:176036/110‑1 (MQ=255) gCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCa < 8:50115/149‑1 (MQ=255) ttCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCGAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGAGCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCg > 8:131465/1‑149 (MQ=255) aTCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCt > 7:81427/1‑149 (MQ=255) aTCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCt < 8:10761/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATTGTCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTg < 1:225258/148‑1 (MQ=255) tggtggGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTAt > 5:306332/1‑149 (MQ=255) ggtgTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGt > 6:220100/1‑149 (MQ=255) cGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCg < 6:304027/148‑1 (MQ=255) tttC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGc > 1:142290/1‑148 (MQ=255) c‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAg < 2:142290/148‑1 (MQ=255) cccTTGGCTTCATGTGGTTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGAtt > 3:240240/1‑149 (MQ=255) ttCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCt > 4:1807/1‑149 (MQ=255) ttCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCt > 1:39471/1‑149 (MQ=255) aTGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAATCTTGCCGagcacg < 8:81427/148‑6 (MQ=255) aTGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGc > 3:70012/1‑149 (MQ=255) tgGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGc > 4:284158/1‑149 (MQ=255) gATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTg > 7:305545/1‑148 (MQ=255) gATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGAACGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGAACTTGCGGCCCGAGGCCTg > 5:76550/1‑148 (MQ=255) aTTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTGGa < 5:303941/149‑1 (MQ=255) tgCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTGGAGcgcg > 7:237283/1‑149 (MQ=255) ccGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTGGAGCGCgtg > 8:292752/1‑149 (MQ=255) gAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAAt > 2:202487/1‑55 (MQ=255) gAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAAt < 1:202487/55‑1 (MQ=255) gAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTGGAGCGCGtgtg > 4:69979/1‑149 (MQ=255) aaCCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTGGAGCGCGTGTGGt > 8:20620/1‑149 (MQ=255) ccATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGcc < 6:104457/132‑1 (MQ=255) ccATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGcc > 5:104457/1‑132 (MQ=255) ccATTGCCGCCAACCGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTGGAGCGCGTGTGGtt < 5:56844/149‑1 (MQ=255) cATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTGCCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTGGAGCGCGTGTGGTTgc > 1:301592/1‑149 (MQ=255) | GGTGGAAATGGCGCGCAGTTACGGCTTGTCCGGCTTCGGCCTGTTCCGCCAGGTGATCCTGCCGGGGGCGCTGCCTTCGATCCTGGTGGGTGTGCGTTTC‑GCCCTTGGCTTCATGTGGCTGACCCTGATTGTTGCCGAAACCATTTCGGCCAA‑CGCCGGCATCGGTTACCTGGCAATGAATGCTCGCGAATT‑TCTTCAGACCGACGTGGTAGTGCTGGCCATCGTCCTGTATGCCGTGCTCGGCAAGATTGCCGACCTTGCGGCCCGAGGCCTGGAGCGCGTGTGGTTGC > NC_002947/294267‑294556 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |