| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,232,958 | C→A | 5.3% | P49Q (CCG→CAG) | GbpR → | galactose‑binding protein regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,232,958 | 0 | C | A | 5.3% | 246.9 / 3.0 | 76 | P49Q (CCG→CAG) | GbpR | galactose‑binding protein regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/38); new base A (2/2); total (36/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.10e-01 | |||||||||||
GATATGTCTCGCTTGCCACCTGACAAGGCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAG > NC_002947/3232810‑3233106 | gATATGTCTCGCTTGCCACCTGACAAGGCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAAcc > 1:101981/1‑149 (MQ=255) tGTCTCGCTTGCCACCTGACAAGGCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGgcc < 4:283647/149‑1 (MQ=255) ccTGACAAGGCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACAGGCTGGCGGCCGGTTGcg < 3:247667/149‑2 (MQ=255) cTGACAAGGCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTa < 6:156723/149‑1 (MQ=255) aCAAGGCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTAc < 2:101981/147‑1 (MQ=255) aaGGCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTAcag > 6:9464/1‑147 (MQ=255) aaGGCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTAcag > 1:303371/1‑147 (MQ=255) ggCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACagcagc > 3:154604/1‑149 (MQ=255) gCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCt > 6:154312/1‑149 (MQ=255) gCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACAGGCTGGCGGCCGGTTGc < 4:147218/139‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACAGGCTGGCGGCCGGTTGc > 3:147218/1‑139 (MQ=255) cTCAGGCGCCTTCCAGCGTCGTTGCCTTGAAGATTTCCAGGCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCtt < 4:43549/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTgag > 4:214398/1‑149 (MQ=255) aGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTgag < 7:136409/149‑1 (MQ=255) gcCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTAcag < 2:29861/136‑1 (MQ=255) gcCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTAcag > 1:29861/1‑136 (MQ=255) gcCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAgc > 2:203744/1‑149 (MQ=255) ccTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAgcg > 2:72467/1‑149 (MQ=255) cTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAgcgc < 3:226095/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTgagga < 6:130572/143‑1 (MQ=255) gCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTgagga > 5:130572/1‑143 (MQ=255) cAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTgg < 2:16405/149‑1 (MQ=255) cAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTgg > 6:302240/1‑149 (MQ=255) cAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTgg > 3:251612/1‑149 (MQ=255) cAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTgg < 7:256439/149‑1 (MQ=255) cAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTgg > 2:234567/1‑149 (MQ=255) aGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGTAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTggg < 1:72467/149‑1 (MQ=255) aGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTggg < 3:214398/149‑1 (MQ=255) ggTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGCCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTAc < 1:234567/148‑1 (MQ=255) gTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGt < 5:302240/149‑1 (MQ=255) tGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTc > 5:285748/1‑149 (MQ=255) gAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGtt > 2:245803/1‑108 (MQ=255) gAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGtt < 1:245803/108‑1 (MQ=255) aaGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTc > 6:154872/1‑147 (MQ=255) tCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGcc < 1:203744/148‑1 (MQ=255) aGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGa < 5:302346/140‑1 (MQ=255) aGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGa > 6:302346/1‑140 (MQ=255) tCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCggg < 1:127353/149‑1 (MQ=255) aCGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCa < 5:261604/149‑1 (MQ=255) cGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGc > 1:17134/1‑147 (MQ=255) gTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAg > 7:286160/1‑149 (MQ=255) gCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCg < 6:285748/148‑1 (MQ=255) gCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGa > 7:16536/1‑149 (MQ=255) tCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCgg > 6:51217/1‑134 (MQ=255) tCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCgg < 5:51217/134‑1 (MQ=255) aaTGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTAc < 4:103660/109‑1 (MQ=255) aaTGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTAc > 3:103660/1‑109 (MQ=255) aaTGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCt < 2:303371/149‑1 (MQ=255) aaTGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCACCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGCGGGATGCAAGCGACGCt > 5:169784/1‑149 (MQ=255) tGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTg > 1:237995/1‑148 (MQ=255) tGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGt < 5:154872/149‑1 (MQ=255) cgcTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTAt > 8:177423/1‑149 (MQ=255) gcTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATg < 3:227232/149‑1 (MQ=255) ggCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGc < 2:43186/147‑1 (MQ=255) gCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAg < 4:154604/149‑1 (MQ=255) gAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGt > 7:44765/1‑149 (MQ=255) aTTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGAGGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGtga > 1:279182/1‑149 (MQ=255) ttCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGtgat > 4:175079/1‑149 (MQ=255) cAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGtg < 2:109215/142‑1 (MQ=255) cAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGtg > 1:109215/1‑142 (MQ=255) cAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTc < 8:286160/149‑1 (MQ=255) aaCCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCg < 2:237995/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGc < 1:60116/149‑1 (MQ=255) tGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTAt > 7:233898/1‑149 (MQ=255) cgccgcgccgCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGCGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTAt < 7:90591/147‑1 (MQ=255) cgccgcgccgCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTATgc < 1:62557/149‑1 (MQ=255) gcgccgcCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCTTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCa > 3:243135/1‑148 (MQ=255) gcgccgcCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTATgc > 4:245867/1‑145 (MQ=255) gcgccgcCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTATgc < 3:245867/145‑1 (MQ=255) cgccgccgcGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCAATgcgttttgcg > 4:162341/1‑142 (MQ=255) cgcgATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGc < 7:238072/130‑1 (MQ=255) cgcgATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGc > 8:238072/1‑130 (MQ=255) cgATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCAt < 3:175079/149‑1 (MQ=255) gATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATg < 6:84444/149‑1 (MQ=255) cacaCCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAgg > 6:24162/1‑112 (MQ=255) cacaCCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAgg < 5:24162/112‑1 (MQ=255) tgtagCAACAGGCTGGCGGCCGGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGCGGAACGTCAGTTCGAGCGCCTGCCCCCGGCGATGCAAGCGACCCTGTATGGCGAGGtga > 8:270405/5‑111 (MQ=255) cGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAg < 5:9464/149‑1 (MQ=255) | GATATGTCTCGCTTGCCACCTGACAAGGCTCAGGCGCCTGCCAGCCTCGGTGCCTTGAAGATTTCCAGCCGTCAGATCACGTTGCTCAATGCGCTGGGCGAATTCGGCAACCTGCGCCGCGCCGCCGCCGCGATGCACACCACGCAACCGGCCGCCAGCCTGTTGCTACAGCAGCTTGAGGAGCGCCTGGGGGTACGTCTGTTCGAGCGCCTGCCCCGGGGGATGCAAGCGACGCTGTATGGCGAGGTGATGATTCGCTATGCGCAAAACGCATTGCATGAGTTCGATCATGCCCAG > NC_002947/3232810‑3233106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |