| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,924,590 | A→T | 6.2% | L75Q (CTG→CAG) | peaB ← | quinohemoprotein amine dehydrogenase modification protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,924,590 | 0 | A | T | 6.2% | 196.5 / 3.0 | 64 | L75Q (CTG→CAG) | peaB | quinohemoprotein amine dehydrogenase modification protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/32); new base T (2/2); total (30/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.41e-01 | |||||||||||
AGGTCTTCCTTGTAGCAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGG > NC_002947/3924443‑3924735 | aGGTCTTCCTTGTAGCAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAg > 6:336386/1‑149 (MQ=255) ggTCTTCCTTGTAGCAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGt > 7:260933/1‑149 (MQ=255) cTTCCTTGTAGCAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTcg > 8:20536/1‑149 (MQ=255) cTTGTAGCAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTcgcg > 2:259127/1‑147 (MQ=255) ttGTAGCAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAg > 4:83590/1‑149 (MQ=255) gTAGCAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAgg < 5:60799/148‑1 (MQ=255) gTAGCAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAg < 1:85638/147‑1 (MQ=255) cAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTc > 6:36221/1‑149 (MQ=255) aTAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGGTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCt < 3:79176/149‑1 (MQ=255) tAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTg < 5:36221/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGGGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCTCGCAGGGTGTCCTggtt < 2:14575/149‑3 (MQ=255) gTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGat < 6:219937/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGa > 7:176027/1‑148 (MQ=255) tGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGata < 1:259127/149‑1 (MQ=255) cAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATc < 8:260933/149‑1 (MQ=255) aGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATcc > 2:277759/1‑149 (MQ=255) aGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATcc < 4:1535/149‑1 (MQ=255) cTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTc > 3:153678/1‑149 (MQ=255) ttGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGc < 4:270978/149‑1 (MQ=255) gCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCa < 7:78656/148‑1 (MQ=255) aaCCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATc < 4:20048/136‑1 (MQ=255) aaCCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAAc > 5:15342/1‑149 (MQ=255) aaCCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAAc > 4:24274/1‑149 (MQ=255) aaCCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCCGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATc > 3:20048/1‑136 (MQ=255) cGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAgg > 5:99717/1‑119 (MQ=255) cGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAgg < 6:99717/119‑1 (MQ=255) ggTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAActgct < 7:20536/149‑1 (MQ=255) gtgtTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAActgct‑g < 5:101794/149‑1 (MQ=255) gACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGcc > 6:335779/1‑147 (MQ=255) cGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAgg < 5:336386/149‑1 (MQ=255) gTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGgc < 8:226596/149‑1 (MQ=255) aGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTg < 5:335779/149‑1 (MQ=255) aGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTg > 7:87649/1‑149 (MQ=255) gCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGc < 4:153678/149‑1 (MQ=255) cacGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCAt > 1:12042/1‑147 (MQ=255) aGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCa > 5:199868/1‑139 (MQ=255) aGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCa < 6:199868/139‑1 (MQ=255) gACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCTCGGCCGAGGAGCTGATGCAGCGCCTTGGCc‑agcagtttgccg < 6:15342/149‑8 (MQ=25) cTGAGGGCGATTTCCGGTGTCAGCGGCGAGCCGGCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCaa < 8:157237/149‑1 (MQ=255) cTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCaa < 3:83590/149‑1 (MQ=255) gggCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGAGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGgtg < 8:176027/149‑1 (MQ=255) gCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCaa > 7:301276/1‑143 (MQ=255) gCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GCCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCaa < 8:301276/143‑1 (MQ=255) tttCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCgat > 8:61922/1‑148 (MQ=255) tttCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCgat > 6:106407/1‑148 (MQ=255) ccGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCgatgat < 3:24274/148‑1 (MQ=255) ggTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATGCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGGAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATgccgc < 2:275323/149‑1 (MQ=255) tCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGag < 2:321778/113‑1 (MQ=255) aGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGAGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGt > 3:173597/1‑149 (MQ=255) cGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACcgc > 1:57531/1‑145 (MQ=255) cGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACcgc < 2:57531/145‑1 (MQ=255) cGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGCGTCa < 2:12042/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGaa > 3:58006/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGaa > 7:171553/1‑148 (MQ=255) cctgcgcGAACTGATCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGAACAg > 3:136940/4‑145 (MQ=255) cctgcgcGAACTGATCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGAACAg < 4:136940/142‑1 (MQ=255) cAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCga < 7:202681/110‑1 (MQ=255) cAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCga > 8:202681/1‑110 (MQ=255) tgcgcGAACTGATCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGGTGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGAACa > 5:330640/2‑142 (MQ=255) tgcgcGAACTGATCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGGTGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGAACa < 6:330640/141‑1 (MQ=255) cgATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGgtgt > 6:78455/1‑102 (MQ=255) cgATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGgtgt < 5:78455/102‑1 (MQ=255) aTCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTggg > 5:89019/1‑149 (MQ=255) aTCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTggg > 3:203198/1‑149 (MQ=255) | AGGTCTTCCTTGTAGCAATAGGTGCAGCTGAGGTTGCAACCGGTGTTGACGTTGAGCACCACGGTGTTGAGCGCGGTGCGCTCGACTTGCCTGAGGGCGATTTCCGGGGTCAGCGGCGAGCCGTCGCTGACCAGCTCCAGCGCGATCAGTTCGCGCAGGGTGTCCTGGATATCCTCGCCGGCAAACTGCT‑GGCCAAGGCGCTGCATCAGCTCCTCGGCCGAGCAGCCTTGCTGGCGCAAGGTGTCGATGATGCCGCCGGTCACCGCGTCAGCGGTGAACAGCGAACTGCTGGG > NC_002947/3924443‑3924735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |