Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,840,143 | T→C | 5.6% | V170A (GTG→GCG) | ccoN‑II → | cbb3‑type cytochrome c oxidase subunit 1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,840,143 | 0 | T | C | 5.6% | 207.4 / 2.3 | 71 | V170A (GTG→GCG) | ccoN‑II | cbb3‑type cytochrome c oxidase subunit 1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/31); new base C (2/2); total (38/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.15e-01 |
CCAAGGAATACGCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACGGCCACAACGCCGTGGGCTTCTTC > NC_002947/4839996‑4840276 | ccaAGGAATACGCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTg < 3:227514/149‑1 (MQ=255) caAGGAATACGCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTgg > 5:242864/1‑149 (MQ=255) caAGGAATACGCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTgg > 5:91349/1‑149 (MQ=255) caAGGAATACGCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGCgg > 6:286767/1‑149 (MQ=255) tACGCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACcgc > 1:277425/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTc < 4:201617/141‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTc > 3:201617/1‑141 (MQ=255) gCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCCCCGCGAt > 8:227452/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGAt < 6:242864/149‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCATCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGAt > 4:92652/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTGATCGTGGTCACCGCGAtgc < 2:94422/149‑1 (MQ=255) gAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGCGGTGACCACGAtgaa < 5:286767/149‑3 (MQ=255) aGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGAtgctg > 4:159348/1‑149 (MQ=255) aGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGAtgctg < 6:91349/149‑1 (MQ=255) ggAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGCGGTGACCACGAtgaacgca > 5:313493/1‑142 (MQ=255) ggAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGCGGTGACCACGAtgaacgca < 6:313493/148‑7 (MQ=255) gTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCg > 6:210707/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTc < 4:60492/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTTGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCaa < 5:98092/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAAc > 1:190976/1‑148 (MQ=255) gCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAAc > 5:245114/1‑148 (MQ=255) cTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAAcc > 3:23282/1‑148 (MQ=255) gCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCACCTGGTTCAACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACcaaa > 6:173040/1‑146 (MQ=255) gCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACcaca > 3:266398/1‑148 (MQ=255) aTCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGTCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCTATGCTGCACATCGTCAACCACAtctc < 1:153937/149‑1 (MQ=255) aTCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACAtctc < 3:93531/149‑1 (MQ=255) ctgGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGcc < 7:154950/149‑1 (MQ=255) ctgGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGcc > 8:154950/1‑149 (MQ=255) ctgGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGc < 4:266398/148‑1 (MQ=255) ggCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCgg > 1:206705/1‑149 (MQ=255) cATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGa < 6:245114/149‑1 (MQ=255) tGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACGAGATCTCGATGCAGGTGAGCCTGtt < 2:190976/149‑1 (MQ=255) ggTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTc > 3:51439/1‑148 (MQ=255) gTTACCTACTGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCaa < 1:91677/149‑1 (MQ=255) aCCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGt < 3:92652/148‑1 (MQ=255) tACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTa > 5:17567/1‑149 (MQ=255) aCGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACTACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTAc > 3:212430/1‑149 (MQ=255) cgggTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTGCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGc < 2:183908/147‑1 (MQ=255) ggTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGt > 6:51682/1‑123 (MQ=255) ggTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGt < 5:51682/123‑1 (MQ=255) gtgtTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCt > 2:85067/1‑148 (MQ=255) tgtTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCACGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTAc < 5:199829/149‑1 (MQ=255) ttcGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCgg > 6:36081/1‑149 (MQ=255) cACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCa < 4:23282/149‑1 (MQ=255) gTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGAcg < 5:210707/148‑1 (MQ=255) tCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGAcgc > 1:133694/1‑148 (MQ=255) cAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCga < 2:277425/149‑1 (MQ=255) gCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATc < 2:206705/149‑1 (MQ=255) gCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATc > 1:188549/1‑149 (MQ=255) aaGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATc > 2:109488/1‑147 (MQ=255) aaGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATc > 8:165531/1‑147 (MQ=255) gACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGt > 7:32676/1‑93 (MQ=255) gACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGt < 8:32676/93‑1 (MQ=255) aCCAAGCTCTTCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTTCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACTTCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAgtg < 5:173040/149‑1 (MQ=255) aCCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAg > 6:293853/1‑105 (MQ=255) aCCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAg < 5:293853/105‑1 (MQ=255) ccAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAgtgg < 1:85067/149‑1 (MQ=255) aGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCAACCGACGCGATGATCCAGtggtgg > 8:76165/1‑149 (MQ=255) gCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTggtggt < 7:165531/149‑1 (MQ=255) aTCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACgg > 2:281660/1‑149 (MQ=255) aTCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACgg > 4:92877/1‑149 (MQ=255) aTGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACGGCca > 7:98826/1‑148 (MQ=255) aTGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTCCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACGGCca > 6:70760/1‑148 (MQ=255) tGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAgtgg > 6:208332/1‑136 (MQ=255) tGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAgtgg < 5:208332/136‑1 (MQ=255) tGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACGGCcac < 3:159348/148‑1 (MQ=255) tCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACGGCCACAAc > 4:156917/1‑149 (MQ=255) tGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACGGCCACAACGCCGTgg > 5:51479/1‑148 (MQ=255) cTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGa > 7:94863/1‑105 (MQ=255) cTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGa < 8:94863/105‑1 (MQ=255) cGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACGGCCACAACGCCGTGGGCttcttc < 1:109488/148‑1 (MQ=255) | CCAAGGAATACGCCGAGCTGGAGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTACCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTGGTCACCGCGATGCTGCACATCGTCAACCACATCTCGCTGCCGGTGAGCCTGTTCAAGTCGTACTCGGCCTACTCCGGCGCCACCGACGCGATGATCCAGTGGTGGTACGGCCACAACGCCGTGGGCTTCTTC > NC_002947/4839996‑4840276 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |