| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,371,996 | Δ1 bp | 5.1% | intergenic (‑60/+37) | carB ← / ← carA | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit/carbamoyl‑phosphate synthase small subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,371,996 | 0 | G | . | 5.1% | 253.1 / 6.9 | 78 | intergenic (‑60/+37) | carB/carA | carbamoyl‑phosphate synthase large subunit/carbamoyl‑phosphate synthase small subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/37); new base . (2/2); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.37e-01 | |||||||||||
GCAGGCCTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCGGT > NC_002947/5371856‑5372143 | gCAGGCCTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGC‑CGGC‑acctg < 3:167757/149‑5 (MQ=255) agcccTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGCTGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGc < 4:211645/146‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCCGATCCCGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGc < 8:306474/149‑1 (MQ=255) cGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCggg < 6:260891/149‑1 (MQ=255) gATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGTGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCgggg > 4:16027/1‑149 (MQ=255) gATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCgggg > 3:45979/1‑149 (MQ=255) tCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGcc < 2:101455/149‑1 (MQ=255) aCGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCt < 4:274901/148‑1 (MQ=255) gATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGa < 4:328592/149‑1 (MQ=255) gATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGa < 2:291154/149‑1 (MQ=255) aTCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTg > 5:231744/1‑147 (MQ=255) aTCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGaa < 4:45979/149‑1 (MQ=255) gggCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCa < 7:27115/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGAt > 6:332302/1‑149 (MQ=255) cgcCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCgg < 1:205061/130‑1 (MQ=255) cgcCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCgg > 2:205061/1‑130 (MQ=255) gcCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGTCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCt > 4:258350/1‑148 (MQ=255) gATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTgg > 7:93941/1‑149 (MQ=255) gATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTgg > 8:110400/1‑149 (MQ=255) ttttGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATg > 6:365383/1‑149 (MQ=255) ttGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATgg < 2:244602/148‑1 (MQ=255) tGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCg < 5:365383/149‑1 (MQ=255) cTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGt > 8:122815/1‑148 (MQ=255) tGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTg > 8:152703/1‑109 (MQ=255) tGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTg < 7:152703/109‑1 (MQ=255) tACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCAt > 8:339119/1‑136 (MQ=255) tACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCAt < 7:339119/136‑1 (MQ=255) tACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGaaa > 2:145819/1‑149 (MQ=255) cGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACg < 8:93941/149‑1 (MQ=255) gTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATg < 2:362254/134‑1 (MQ=255) gTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATg > 1:362254/1‑134 (MQ=255) gTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGa < 3:16027/149‑1 (MQ=255) gTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATACCGGGTCAGTCGGCAAGACGATTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGCGCGCGGC‑AGGTGACG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCAGCGCTTGGTCATGGCATCGGTGAAACGa > 1:185479/1‑149 (MQ=255) ttttGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGAt > 4:187352/1‑149 (MQ=255) ttttGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGAt > 4:181697/1‑149 (MQ=255) ttGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATg > 8:331157/1‑131 (MQ=255) ttGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAAGCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATg < 7:331157/131‑1 (MQ=255) tGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCg < 1:145819/148‑1 (MQ=255) aTGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACag > 8:140976/1‑149 (MQ=255) gtggtCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACaga < 6:231744/147‑1 (MQ=255) aCTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGAc > 4:195320/1‑149 (MQ=255) tCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACgt > 8:8222/1‑149 (MQ=255) aaaTCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACgt < 5:332302/147‑1 (MQ=255) tCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACgtcggtc < 4:237931/149‑1 (MQ=255) tCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACgtcggtc > 1:50710/1‑149 (MQ=255) aGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCggg > 6:5470/1‑149 (MQ=255) aGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCggg > 1:214716/1‑149 (MQ=255) gTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGc > 4:14446/1‑149 (MQ=255) gTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGc > 7:189299/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGtcggtcgg > 8:62797/1‑138 (MQ=255) ggCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGtcggtcgg < 7:62797/138‑1 (MQ=255) gCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGc > 5:239755/1‑149 (MQ=255) aaGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGCGAGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCt > 1:69283/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACgtcggtc > 4:193307/1‑130 (MQ=255) cGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGcc > 5:336512/1‑134 (MQ=255) cGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGcc < 6:336512/134‑1 (MQ=255) cGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAgg < 3:195320/149‑1 (MQ=255) cTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGG‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTGGAGGCAGGATGCGCAGCGGCGCTTGGCCATGGCCGCGGGGGAGCGAGCGAACAGCGGCGCGCCGTCGGGCGGGCCCGGGCGCGGGTCAgggg > 8:264833/1‑148 (MQ=255) tGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCAATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTg < 5:139920/147‑1 (MQ=255) aaTCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTgg < 4:334541/149‑1 (MQ=255) aaTCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTgg < 2:69283/149‑1 (MQ=255) aTCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGa < 5:5470/149‑1 (MQ=255) gcTGGGGCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGCTGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCAGCGGTGAACCGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGGCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGaa < 3:14575/148‑1 (MQ=255) gggTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCt > 5:26913/1‑149 (MQ=255) tCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGaa > 1:299007/1‑149 (MQ=255) tCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGaa > 1:338597/1‑149 (MQ=255) aGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAAc < 7:141449/148‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACgcgc < 6:239755/149‑1 (MQ=255) gcggCCGGGCGCGGC‑AGGGGCCG‑GCCCGGGGCCGTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGGGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGGCGGGCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGct < 8:189299/146‑1 (MQ=255) cTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGAAGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGctc < 6:227397/149‑1 (MQ=255) ccccGGGC‑CGGC‑ACCTGCCGCGCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGcc < 8:126406/127‑1 (MQ=255) ccccGGGC‑CGGC‑ACCTGCCGCGCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGcc > 7:126406/3‑129 (MQ=255) ccccGGGC‑CGGC‑ACCTGCCGCGCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGctct > 7:101425/3‑149 (MQ=255) cGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGt < 2:338597/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGAGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCtgttgt > 1:313255/1‑149 (MQ=255) ggCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGGTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGt > 5:310872/1‑147 (MQ=255) ggCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGt < 6:310872/147‑1 (MQ=255) ggCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCg < 7:140976/149‑1 (MQ=255) cgcgGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCGGt < 3:258350/149‑1 (MQ=255) | GCAGGCCTGGCCGATCACGATCGGGCCAGCGCCGAGAATCAGGATGCTTTTGATGTCTGTACGTTTTGGCATGGTGGTCACTCAAATCCGGGGTCAGTCGGCAAGCCGCTTTGAACAATCTGGGTCAGGCGCTGCCGGGCGCGGC‑AGGTGCCG‑GCCCGGGGCCTTGAAGCAGGATGCTCAGCGGCGCTTGGCCATGGCATCGGTGAAACGATCGAACAGAGGCGCGACGTCGGTCGGGCCCGGGCTCGCTTCAGGGTGGCCCTGGAAGCTGAACGCGCTCTTGTCGGT > NC_002947/5371856‑5372143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |