Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 644,641:1 | +G | 7.8% | coding (376/978 nt) | acoA ← | acetoin:2,6‑dichlorophenolindophenol oxidoreductase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 644,641 | 1 | . | G | 7.8% | 248.4 / 12.5 | 64 | coding (376/978 nt) | acoA | acetoin:2,6‑dichlorophenolindophenol oxidoreductase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (31/28); new base G (2/3); total (33/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
TTCTCGGCCACGAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTACACGTCCA > NC_002947/644493‑644784 | ttCTCGGCCACGAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGc < 3:319791/149‑1 (MQ=255) aGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTgcg > 1:175970/1‑149 (MQ=255) aTGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGCGCACCActggtggcc > 1:320796/1‑146 (MQ=255) agggcaggTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGCGCACCACTGGtg‑gccgggg < 2:320796/149‑3 (MQ=255) agggcaggTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTgcgccggcg > 4:163921/1‑149 (MQ=255) gggcaggTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTgcgccggcgc < 2:175970/149‑1 (MQ=255) ttCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGTATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTAATCGCGGCCCTTCAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGAGGTGCGCCGGCGCcgacga > 8:192076/1‑148 (MQ=255) tCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGGCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTg < 1:295541/149‑1 (MQ=255) cATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCAcc > 2:203443/1‑147 (MQ=255) cATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATAGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCCCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGa > 2:8502/1‑149 (MQ=255) ggCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGCGCACCACTGGtg‑gccggggcg < 1:267920/120‑2 (MQ=255) ggCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGCGCACCACTGGtg‑gccggggcg < 3:136243/120‑2 (MQ=255) ggCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGCGCACCACTGGtg‑gccggggcg > 2:267920/1‑119 (MQ=255) gCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCtt > 3:237423/1‑149 (MQ=255) ccTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCttt > 3:18600/1‑149 (MQ=255) tCGAATACGGCGCCCTCGTTTGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtggt > 6:287529/1‑105 (MQ=255) tCGAATACGGCGCCCTCGTTTGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtggt < 5:287529/105‑1 (MQ=255) tCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTc > 7:295921/1‑149 (MQ=255) aaTACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAg > 1:151901/1‑149 (MQ=255) aTACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAgg < 5:294723/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCgg > 5:214437/1‑148 (MQ=255) gcCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCaa < 4:79048/149‑1 (MQ=255) ccTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAAtg > 5:110252/1‑149 (MQ=255) ccTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCATGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAAtg > 1:284040/1‑149 (MQ=255) cTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAAtgt < 4:18600/149‑1 (MQ=255) ttGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCAt < 6:214437/149‑1 (MQ=255) ttGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCAt > 7:298307/1‑149 (MQ=255) ttGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCAt > 1:102092/1‑149 (MQ=255) gATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGa < 3:339789/149‑1 (MQ=255) tGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAgc < 4:237423/149‑1 (MQ=255) cccATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCCGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TAACGTTGGCCCCGCGGCTGCCCGTTTCCAGGTCGGGAAGGTGGATCGcgccgc > 6:100129/1‑149 (MQ=255) cccATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAgccgc > 5:249145/1‑149 (MQ=255) cccATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAgccgc > 3:256631/1‑149 (MQ=255) cccATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATAGCGGCCCTTGAGCTTGCCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAgccgc > 2:212364/1‑149 (MQ=255) ccATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAAtgt > 2:109710/1‑136 (MQ=255) ccATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAAtgt < 1:109710/136‑1 (MQ=255) gaagaaGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGa > 3:275353/1‑101 (MQ=255) gaagaaGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGa < 4:275353/101‑1 (MQ=255) agaagGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCg < 5:100129/149‑1 (MQ=255) gaagGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CTCCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGc < 2:151901/149‑1 (MQ=255) agGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAAAGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACAGcac < 1:203443/149‑1 (MQ=255) ggCTACCGACACGTCATAGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGATGGCACACAGCATGCCCATTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGcaca > 6:1753/1‑149 (MQ=255) ccGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCg < 1:212364/149‑1 (MQ=255) gTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGtcttct > 3:63768/1‑149 (MQ=255) cATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGTGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTg > 2:317745/1‑149 (MQ=255) aTCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGGCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTcttctt < 7:170542/147‑1 (MQ=255) aTCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGc > 5:363007/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGcc > 5:97900/1‑149 (MQ=255) gcgGCCCTGGAGCTTGGCCGCCACCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGCGCATGCCCTTTTCCAGGGCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGt < 8:92453/149‑1 (MQ=255) cgGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTa < 8:298307/149‑1 (MQ=255) cgGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTa < 2:102092/149‑1 (MQ=255) gAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGTCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTAGCCACCGCACACGCCTGTCTTCTTGCCGTAGATCTCg < 8:295921/148‑1 (MQ=255) gAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACTA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGTCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCg < 7:192076/148‑1 (MQ=255) gAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCg < 1:8502/148‑1 (MQ=255) aGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGtc > 6:282644/1‑129 (MQ=255) aGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGtc < 5:282644/129‑1 (MQ=255) aGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCgg < 3:163921/148‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGc < 6:249145/148‑1 (MQ=255) gccAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGcc > 5:110746/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTa > 7:110901/1‑148 (MQ=255) gccCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTACACGTc < 4:63768/149‑1 (MQ=255) ccccGGC‑CACCCGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTACACGTcc < 6:110746/149‑1 (MQ=255) ccGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATTACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTACACGTCCa > 1:220300/1‑149 (MQ=255) gC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGcc > 2:232780/1‑113 (MQ=255) gC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGcc < 1:232780/113‑1 (MQ=255) | TTCTCGGCCACGAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGA‑TACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTACACGTCCA > NC_002947/644493‑644784 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |