New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 64435 | 43 (0.760) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 9.4% | coding (281/888 nt) | PP_0055 | transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 64458 | 36 (0.670) | coding (258/888 nt) | PP_0055 | transcriptional regulator |
ATGGATGCTGATTTCTGCCTCGCGGTTGAGGATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCGTACCCCTGGGCATGTTGCACGAACAGCGCGGTC > NC_002947/64287‑64581 | atggatgCTGATTTCTGCCTCGCGGTTGAGGATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGC < 6:71145‑M1/149‑1 (MQ=255) tGATTTCTGCCTCGCGGTTGAGGATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCcatcaccc > 1:320881‑M1/1‑141 (MQ=255) tGATTTCTGCCGCGCGGTAGAGGATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTACCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGTGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTg < 7:301014/149‑1 (MQ=255) gATTTCTGCCTCGCGGTTGAGGATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGc > 8:32039/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGGTTGAGGATGCTGACGAAGCGTGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCggg < 4:252752/149‑1 (MQ=255) ccTCGCGGTTGAGGATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCggg < 5:141932/149‑1 (MQ=255) cTCGCGGTTGAGGATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCgggg < 7:32039/149‑1 (MQ=255) tGAGGATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGgcc < 2:200224‑M2/149‑4 (MQ=255) gATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCcatcaccccgctgggcaagattcgcctggg < 2:320881‑M1/149‑31 (MQ=255) tGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACACCGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGCGTGAtt > 7:46827/1‑149 (MQ=255) tGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGAtt > 7:51908/1‑149 (MQ=255) tGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGAtt > 5:337289/1‑149 (MQ=255) aCGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGAtt > 6:181165/1‑147 (MQ=255) aCGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGAtt < 5:181165/147‑1 (MQ=255) gAAGCGCGGCACCGCTAACAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCACAGCGTGGTGAAGGCCTGGGTGATTtcct > 1:106007/1‑149 (MQ=255) gcgGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCtgt < 3:207805/149‑1 (MQ=255) aCCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCATTCGGTTACCCCCAGCCGAATCTTCACCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCcag > 3:41783/1‑149 (MQ=255) ccGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCcagc < 7:308089/149‑1 (MQ=255) gCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCcagcag < 5:90736/149‑1 (MQ=255) tACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCcagc < 7:238813/145‑1 (MQ=255) tACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCcagc > 8:238813/1‑145 (MQ=255) aCCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCcatcaccccgctgggcaagattcgcctgggg < 3:231320‑M1/125‑32 (MQ=255) aCCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCcatcaccccgctgggcaagattcgcctgggg > 4:231320‑M1/1‑94 (MQ=255) cACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCcagca > 6:110104/1‑137 (MQ=255) cACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCcagca < 5:110104/137‑1 (MQ=255) ccTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGCGAACAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCGGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTcc < 8:192543/149‑1 (MQ=255) cGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCg < 1:200224/149‑1 (MQ=255) gggTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCgg > 5:221154/1‑148 (MQ=255) cTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACCTGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCGAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGGATGGtt > 4:149858/1‑147 (MQ=255) cTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCAGATGCCTTCGGTTACCCCCATGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCGTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCtt > 6:345441/1‑147 (MQ=255) aacaacGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAg < 6:221154/149‑1 (MQ=255) cgTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCGCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGa < 2:351204/149‑1 (MQ=255) gTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGAc > 1:118016/1‑149 (MQ=255) cATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGAccc > 2:269479/1‑148 (MQ=255) aTGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGAccc > 8:316094/1‑147 (MQ=255) gTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAgggg > 5:355276/1‑149 (MQ=255) ggTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGt > 2:309313/1‑147 (MQ=255) ggTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCa < 4:41783/149‑1 (MQ=255) agaaCATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTc < 1:309313/148‑1 (MQ=255) gaaCATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCg > 1:7424/1‑148 (MQ=255) aaCATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTATGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGCTCAGCTCGTa > 1:88858/1‑149 (MQ=255) atgatgCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGTGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCACCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCGTAccc < 2:106007/149‑1 (MQ=255) atgatgCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCGTAccc < 2:118016/149‑1 (MQ=255) gccgatgccTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCGTACCCCTgg < 7:316094/148‑1 (MQ=255) cgatgccTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCATGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCGTACCCCTGGGCa > 1:25686/1‑149 (MQ=255) ttCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCGTACCCCTGGGCATGTTGCa > 8:67956/1‑149 (MQ=255) cGGTTACCGCACGGCGAATCTTGGCCAGCGTGGTGATGGCCTGGTTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGTCATGCTTGATCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCTTACCCCTGGGCATGTTGCa < 8:46827/147‑1 (MQ=255) cGGTTACCCCCAGGCGAAGCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGTCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCGTACCCCTGGGCATGTTGCa < 8:51908/147‑1 (MQ=255) ccccAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGgcctgggggtaaccgaaggcatcggcatcatgttcttcaccccacgcatgaacgcgttgttcgagcgctaccccggcctggaggtggaattggt > 4:231320‑M2/1‑31 (MQ=255) ccccAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGgcctgggggtaaccgaaggcatcggcatcatgttcttcaccccacgcatgaacgcgttgttcgagcgctaccccggcctggaggtggaattggt < 3:231320‑M2/125‑95 (MQ=255) cccAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGgcctgggggtaaccgaaggcatcggcatcatgttcttcaccccacgcatgaacgcgttgttcgagcgctaccccggcctggaggtggaattggtagcggtgccgcgcttcgtcagcatc < 2:320881‑M2/149‑120 (MQ=255) ccAGGCGAATATTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCATCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTAGACCCGACGGCGTCAGCTCGTACCCCTGGGCATCTAGCACGAACAGcgcg > 4:260297/1‑149 (MQ=255) ggCcatcaccccgctgggcaagattcgcctgggggtaaccgaaggcatcggcatcatgttcttcaccccacgcatgaacgcgttgttcgagcgctaccccggcctggaggtggaattggtagcggtgccgcgcttcgtcagcatcctca < 2:200224‑M1/149‑147 (MQ=255) | ATGGATGCTGATTTCTGCCTCGCGGTTGAGGATGCTGACGAAGCGCGGCACCGCTACCAATTCCACCTCCAGGCCGGGGTAGCGCTCGAACAACGCGTTCATGCGTGGGGTGAAGAACATGATGCCGATGCCTTCGGTTACCCCCAGGCGAATCTTGCCCAGCGGGGTGATGGCCTGGGTGATTTCCTCCTGTGCCAGCAGGGCGACGTTCTCCATGGCTTCGGCATGCTTGAGCAGGGCTTGACCCGAGGGGGTCAGCTCGTACCCCTGGGCATGTTGCACGAACAGCGCGGTC > NC_002947/64287‑64581 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |