New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 152584 = | 47 (0.830) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 8.2% | coding (1023/1407 nt) | PP_0144 | insulinase family metalloprotease |
? | NC_002947 | 152653 = | 45 (0.840) | coding (954/1407 nt) | PP_0144 | insulinase family metalloprotease |
CGTCGGTATAGTCGTTCAGCGCCCCCCAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTCGTTGCGCAGGCGCAGCTGGTCGTACAGC > NC_002947/152436‑152728 | cGTCGGTATAGTCGTTCAGCGCCCCCCAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAgg < 1:58628/149‑1 (MQ=255) ttcatcgagccggtgctggacaacgaccaccaagccaccctcgacctgctgtcgcgctacctggactgggcgctgtacgaccagctgcgcctgcgcaacgagctgtcctacggcccctccgtgcagcgtgagagctttggcgacaccgg < 1:194979‑M1/2‑1 (MQ=255) tCGGTATAGTCGGTCAGCGCCCCCCATTAGTACTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCGTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGCTGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGc < 3:184553/149‑1 (MQ=255) catcgagccggtgctggacaacgaccaccaagccaccctcgacctgctgtcgcgctacctggactgggcgctgtacgaccagctgcgcctgcgcaacgagctgtcctacggcccctccgtgcagcgtgagagctttggcgacaccGGc > 4:114159‑M1/146‑148 (MQ=255) ggTATAGTCGTTCAGCGCCCCCCAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCt < 1:164621/149‑1 (MQ=255) atcgagccggtgctggacaacgaccaccaagccaccctcgacctgctgtcgcgctacctggactgggcgctgtacgaccagctgcgcctgcgcaacgagctgtcctacggcccctccgtgcagcgtgagagctttggcgacaccGGCCt < 3:302274‑M1/5‑1 (MQ=255) gTATAGTCGTTCAGCGCCCCCCAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTg < 1:22413/149‑1 (MQ=255) tCGTTCAGCGCCCCCCAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCAc > 5:177547/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCGCCCCCCAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCAcc < 1:158310/148‑1 (MQ=255) aGCGCCCCCCAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGAc < 7:303512/149‑1 (MQ=255) aGCCCCCCCCAGTAGTAGGCGGCCAAGGCGCGGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCCTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGAc < 2:83884/149‑1 (MQ=255) gcgcCCCCCAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGa > 5:146746/1‑147 (MQ=255) ccccccAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGcc < 2:128656/149‑1 (MQ=255) gtagtaggCTGCCACGGCGGTGTTGCCTGGTGTGCTGGAGCTTTCCATGGCGATTCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCTGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGa < 4:208214/149‑1 (MQ=255) tagtagtCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGAt < 4:313814/149‑1 (MQ=255) gtCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTTGATGTCAt > 5:1660/1‑149 (MQ=255) tCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATc < 1:289612/149‑1 (MQ=255) accctcgacctgctgtcgcgctacctggactgggcgctgtacgaccagctgcgcctgcgcaacgagctgtcctacggcccctccgtgcagcgtgagagctttggcgacaccGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATcgc < 4:237850‑M1/38‑1 (MQ=255) gCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATcgcg > 3:276599/1‑149 (MQ=255) cTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTc < 7:138708/149‑1 (MQ=255) tcgcgctacctggactgggcgctgtacgaccagctgcgcctgcgcaacgagctgtcctacggcccctccgtgcagcgtgagagctttggcgacaccGGc < 3:196386‑M1/3‑1 (MQ=255) tcgcgctacctggactgggcgctgtacgaccagctgcgcctgcgcaacgagctgtcctacggcccctccgtgcagcgtgagagctttggcgacaccGGc > 4:196386‑M1/97‑99 (MQ=255) gcgctacctggactgggcgctgtacgaccagctgcgcctgcgcaacgagctgtcctacggcccctccgtgcagcgtgagagctttggcgacaccGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCAtt < 7:316872‑M1/54‑1 (MQ=255) cTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCAtt > 1:331772/1‑148 (MQ=255) gggTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGa < 6:146746/147‑1 (MQ=255) gggTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGa < 1:177424/147‑1 (MQ=255) gggTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAgg > 3:132717/1‑149 (MQ=255) gtggCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAgg < 6:177547/145‑1 (MQ=255) ggTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTACAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGc < 4:276599/149‑1 (MQ=255) cTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGa < 4:176658/148‑1 (MQ=255) tCCAGCTTTCCTTGGTGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAg > 6:25932/1‑148 (MQ=255) cAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAg > 8:253967/1‑149 (MQ=255) ggcgctgtacgaccagctgcgcctgcgcaacgagctgtcctacggcccctccgtgcagcgtgagagctttggcgacaccGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGcc > 3:237850‑M1/80‑148 (MQ=255) ggcgctgtacgaccagctgcgcctgcgcaacgagctgtcctacggcccctccgtgcagcgtgagagctttggcgacaccGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCg > 8:316872‑M1/80‑149 (MQ=255) cTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGgtgt > 5:13343/1‑149 (MQ=255) ggCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTTGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCg < 6:1660/148‑1 (MQ=255) ggCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTc < 4:132717/147‑1 (MQ=255) tGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGctc > 2:154482/1‑149 (MQ=255) cTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCa < 7:253967/149‑1 (MQ=255) ccTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCAc < 5:25932/147‑1 (MQ=255) ttGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTg > 4:331014/1‑149 (MQ=255) gATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCa > 4:302274/1‑149 (MQ=255) gCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATCTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGCCTTAGCAGGCCGGAGTCGCCAAAACTATCACGCTGCACGGac > 6:356610/1‑146 (MQ=255) cGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAg > 2:264789/1‑146 (MQ=255) cGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAg < 1:264789/146‑1 (MQ=255) gAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGc > 6:244102/1‑122 (MQ=255) gAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGc < 5:244102/122‑1 (MQ=255) gAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCAGCACCTTGAGAGCCTTGGCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGGCGGCCGGTGTCGCCAACGCTCTCACTCTGCACCGAGgcgc > 6:89472/1‑149 (MQ=255) tgtCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAg < 2:198221/149‑1 (MQ=255) tCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCaaa > 1:344895/1‑119 (MQ=255) tCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCaaa < 2:344895/119‑1 (MQ=255) aGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTCGtt < 2:331772/149‑1 (MQ=255) gCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTCGTTgc > 5:247941/1‑149 (MQ=255) ccttGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTCGTTgcgcag < 2:318753/148‑1 (MQ=255) cttGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTCGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGgtg > 6:245859/1‑94 (MQ=255) cttGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTCGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGgtg < 5:245859/94‑1 (MQ=255) gcAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTCGTTGCGCAGGCGCAGc > 7:81208/1‑149 (MQ=255) ggtggtCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTCGTTGCGCAGGCGCAGCTgg < 1:154482/149‑1 (MQ=255) gtggtCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTTGTTGCGCAGGCGCAGCTGGt > 8:206155/1‑149 (MQ=255) aCAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTCGTTGCGCAGGCGCAGCTGGTCGTACAgc > 8:159374/1‑149 (MQ=255) aCAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTCGTTGCGCAGGCGCAGCTGGTCGTACAgc > 2:215556/1‑149 (MQ=255) | CGTCGGTATAGTCGTTCAGCGCCCCCCAGTAGTAGTCGGCCAAGGCGCTGTTGCCTTGGGTGCTCCAGCTTTCCTTGGCGATGCTGGCTTCCTTGATGCGGGCGAAGGTGTCCGGGTCCAGGCCTTCCTTGCGCAGGTGGTCGAACAGGGCCTGCATCACCTTGACAGCCTTGTCGATGTCATCGCGCTCAAGGTCCGCATTGAGGCTGAGCAGGCCGGTGTCGCCAAAGCTCTCACGCTGCACGGAGGGGCCGTAGGACAGCTCGTTGCGCAGGCGCAGCTGGTCGTACAGC > NC_002947/152436‑152728 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |