New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 158823 | 49 (0.870) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.2% | coding (1566/1956 nt) | PP_0149 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 158900 | 64 (1.210) | coding (1489/1956 nt) | PP_0149 | hypothetical protein |
CGGGCGGCTGAGAAAACCGCTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGT > NC_002947/158676‑158971 | cGGGCGGCTGAGAAAACCGCTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCt < 1:317270/149‑1 (MQ=255) cggcTGAGAAAACCGCTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTc < 5:135347/149‑1 (MQ=255) agaAAACCGCTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCaagc < 6:38660/147‑1 (MQ=255) ggCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCgcgc > 7:224993/1‑149 (MQ=255) aaGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTgg > 4:258317/1‑149 (MQ=255) ttGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCTGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTc < 4:242502/116‑1 (MQ=255) ttGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTc > 3:242502/1‑116 (MQ=255) ttGAGCGTGGCATCGGATTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCATGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCTCGCTGGTGCGCAGGt > 4:251157/1‑148 (MQ=255) ggCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCTTTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCTGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTgg < 1:194181/149‑1 (MQ=255) aTCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCg > 6:47552/1‑148 (MQ=255) gCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAAc > 3:8307/1‑147 (MQ=255) tttGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGc > 6:53206/1‑149 (MQ=255) tgcCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCgctgc > 2:153101/1‑149 (MQ=255) gcCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGaa > 6:235240/1‑132 (MQ=255) gcCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGaa < 5:235240/132‑1 (MQ=255) aTCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTCCTCgg < 7:326440/149‑1 (MQ=255) cTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCa < 5:53206/148‑1 (MQ=255) ttCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCAtt > 3:318769/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCAtt > 2:357477/1‑148 (MQ=255) aaGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTAAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCCCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAg > 7:223647/1‑149 (MQ=255) aGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGg > 3:258317‑M2/1‑148 (MQ=255) cGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCGAGCAGAAGCTGCCTGCGCAGGCTGGCCctcaatgccgagcagcgccgtagctggttcgccaaggctgacctgcgcaccagcgcggcactgcttctgcttgaacaggcca < 3:198679‑M1/147‑83 (MQ=255) gCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGgccagcca < 1:153101/149‑1 (MQ=255) ttCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACgg < 2:7046/120‑1 (MQ=255) ttCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACgg > 1:7046/1‑120 (MQ=255) aGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCtt < 5:47552/148‑1 (MQ=255) aGGCAACGCTCCTTGACGGCCTCCTGGGCCAGGAGTAGCTGCCTGCGCAGGCTGGCCGGTTCAAGCTGAAGCAGTGGCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCTAACCAGCTACGGCGGTGCTCGGCTTTGAGGGCCATCCAGTCTTc < 8:223647/149‑1 (MQ=255) aaCGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAAc > 2:317702/1‑148 (MQ=255) cGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAAc > 4:165279/1‑146 (MQ=255) gctgctTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCctcaatgccgagcagcgccgtagctggttcgccaaggctgacctgcgcaccagcgcggcactgcttctgcttgaacaggccagc < 8:328996‑M1/134‑85 (MQ=255) gctgctTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCctcaatgccgagcagcgccgtagctggttcgccaaggctgacctgcgcaccagcgcggcactgcttctgcttgaacaggccagc > 7:328996‑M1/1‑50 (MQ=255) ctgctTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTAGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCagag > 1:214254/1‑149 (MQ=255) gctTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAgct > 2:306933/1‑149 (MQ=255) gACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAgcttg < 3:165279/147‑1 (MQ=255) aCCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGGGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAgcttgct < 7:111679/148‑1 (MQ=255) aCCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAgcttgct < 6:212346/148‑1 (MQ=255) cTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGc < 5:123830/111‑1 (MQ=255) cTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGc > 6:123830/1‑111 (MQ=255) tCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGAt > 6:27809/1‑149 (MQ=255) gTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGAtt < 1:306933/148‑1 (MQ=255) gTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTCGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGAt < 2:214254/147‑1 (MQ=255) gggCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCt > 4:38220/1‑122 (MQ=255) gcagAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCttt < 4:318769/149‑1 (MQ=255) cagAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTtc > 2:287629/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCa > 6:212998/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCAc > 8:179600/1‑148 (MQ=255) ccGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCttt < 6:207140/139‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCttt > 5:207140/1‑139 (MQ=255) ccGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCAc < 1:317702/147‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCg > 2:154032/1‑148 (MQ=255) gcgcAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCg > 4:331223/1‑148 (MQ=255) gcAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGggccag > 8:109616‑M2/1‑88 (MQ=255) gcAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGggccag < 7:109616‑M2/94‑7 (MQ=255) gcAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGt > 8:316567/1‑125 (MQ=255) gcAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGt < 7:316567/125‑1 (MQ=255) aGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTgg > 8:329849/1‑122 (MQ=255) gCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTTAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATg < 3:251157/148‑1 (MQ=255) gCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGggccagcctgcgccggcagcttctgctggcccaggacgaggtcaagcagc > 7:328996‑M2/1‑84 (MQ=255) gCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGggccagcctgcgccggcagcttctgctggcccaggacgaggtcaagcagc < 8:328996‑M2/134‑51 (MQ=255) gCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTtc < 2:98098/131‑1 (MQ=255) gCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTtc > 1:98098/1‑131 (MQ=255) cTGGCCctcaatgccgagcagcgccgtagctggttcgccaaggctgacctgcgcaccagcgcggcactgcttctgcttgaacaggccagcctgc < 7:109616‑M1/94‑89 (MQ=255) cTGGCCctcaatgccgagcagcgccgtagctggttcgccaaggctgacctgcgcaccagcgcggcactgcttctgcttgaacaggccagcctgc > 8:109616‑M1/1‑6 (MQ=255) tGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGggccagcctgcgcaggcagcttctgctcgcccaggacgaggtcaagcagcgttacctgaatgccg < 3:198679‑M2/147‑66 (MQ=255) cctcaatgccgagcagcgccgtagctggttcgccaaggctgacctgcgcaccagcgcggcactgcttctgcttgaacaggccagcctgcgccggcagcttctgctggcccaggacgaggtcaagcagcgttacctgaatgccgcagcct > 3:258317‑M1/1‑1 (MQ=255) cTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTgg > 1:162123/1‑148 (MQ=255) | CGGGCGGCTGAGAAAACCGCTGTTGGCAAGCATTTGCTTGAGCGTGGCATCGGCTTTGTTGATGCTGCCATCCTTCAAGGCTGCGGCATTCAGGTAACGCTGCTTGACCTCGTCCTGGGCCAGCAGAAGCTGCCGGCGCAGGCTGGCCTGTTCAAGCAGAAGCAGTGCCGCGCTGGTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGT > NC_002947/158676‑158971 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |