New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 192172 | 51 (0.900) | 5 (0.100) | 4/240 | NT | 9.0% | coding (1346/2157 nt) | paxB | toxin secretion ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 192235 | 54 (1.030) | coding (1283/2157 nt) | paxB | toxin secretion ATP‑binding protein |
GTTCTGCTGGTTCGGATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTT > NC_002947/192024‑192319 | gTTCTGCTGGTTCGGATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑T < 5:138681‑M1/149‑1 (MQ=255) gTTCTGCTGGTTCGGATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCCTGC‑‑‑T < 2:263478‑M1/149‑1 (MQ=255) ttCTGCTGGTTCGGATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑Tg < 8:101281/149‑1 (MQ=255) ctgGTTCGGATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAg < 1:196547/148‑1 (MQ=255) gTTCGGATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCggg > 3:272837/1‑149 (MQ=255) gTTCGGATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCggg > 7:59847/1‑149 (MQ=255) gATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑Tacatgctcagcggc > 2:234024‑M1/1‑135 (MQ=255) gATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCcag > 2:23921/1‑148 (MQ=255) tAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCcagcag < 2:132099/149‑1 (MQ=255) aaGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCGTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGtt > 7:228545/1‑149 (MQ=255) tCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGA‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAg > 5:41074/1‑149 (MQ=255) agACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTg > 4:245075/2‑146 (MQ=255) agACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTg < 3:245075/145‑1 (MQ=255) gACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGc < 8:302062/148‑1 (MQ=255) aCCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTg < 8:59847/149‑1 (MQ=255) cccGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGc > 6:52716/1‑149 (MQ=255) cccGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGc < 7:172366/149‑1 (MQ=255) gcgGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGccc > 2:90575/1‑148 (MQ=255) cgGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCaa > 5:269380/1‑149 (MQ=255) cgGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCaa > 8:295333/1‑149 (MQ=255) gACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCg > 7:339076/1‑114 (MQ=255) gACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCg < 8:339076/114‑1 (MQ=255) gCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCAc < 7:295333/149‑1 (MQ=255) gCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCAc < 5:52716/149‑1 (MQ=255) cccTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTagcgggccagcggccgtgccctcggcccgttgggccagctcaacgg < 7:247624‑M1/149‑47 (MQ=255) gcagcaCCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCg > 5:46864/1‑149 (MQ=255) agcaCCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCt > 2:205567/1‑149 (MQ=255) gcaCCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑Tacatgctcagcggccgtgccctcggcccgttgggccagctcaacggcctgctggcc > 2:188217‑M1/1‑93 (MQ=255) ccTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGGGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGc < 7:322863/149‑1 (MQ=255) cTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGGCCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCa > 5:299239/1‑149 (MQ=255) gCGGCTCAGCTGGCTTTCTTCGAAGGTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGGCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATg < 6:41074/148‑1 (MQ=255) ggCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTag > 1:23921‑M2/1‑147 (MQ=255) cGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑Tacatgctcagcggccgtgccctcggcccgttgggccagctcaacggcctgctggcccgctaccagcaagcca < 1:188217‑M1/149‑73 (MQ=255) gggCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGccac < 4:272837/149‑1 (MQ=255) ttcttcGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGGCCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGgc < 6:299239/149‑1 (MQ=255) ttcGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGgccgc > 1:344593/1‑149 (MQ=255) cGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑Tacatgctcagcggccgtgccctcggcccgttgggccagctcaacggcctgctggcccgctaccagcaagccaaggtgacc < 1:234024‑M1/146‑81 (MQ=255) ttGCGCTCTTGCGGTATATACATCATGTTGTCGGTGGAGAACATGGTAACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTATAGGGCCATCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGTCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGACACAAGGCCGCCCATGc > 4:174071/1‑148 (MQ=255) gcTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAgg < 8:80873/149‑1 (MQ=255) tctTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGtt > 3:173025/1‑149 (MQ=255) gCGGTAGATCCATCATGTTGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTTATCTGGCCCAACTGGCCGAGTGCACGTCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGt < 3:174071/144‑1 (MQ=255) gCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCg > 2:84894/1‑149 (MQ=255) cttcttgtgTTCGGTGGAGACCATGGTCACGTTGTCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCATCGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGc < 4:115216/123‑1 (MQ=255) catcatGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGc > 3:115216/1‑128 (MQ=255) catcatGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCgatgat > 1:141764/1‑147 (MQ=255) tgGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTacac < 2:302205/149‑1 (MQ=255) ggAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTg < 4:42385/121‑1 (MQ=255) ggAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTg > 3:42385/1‑121 (MQ=255) aCCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGa < 3:132560/148‑1 (MQ=255) aCCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGa > 4:132560/1‑148 (MQ=255) aCCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGAt < 1:84894/149‑1 (MQ=255) cATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCa > 8:91901/1‑149 (MQ=255) tGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCAtt < 2:344593/149‑1 (MQ=255) ggTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTagcaagccaaggtgaccatggtctccaccgaccacatgatggatctaccgcaagagcgcaacttcg < 1:234024‑M2/146‑67 (MQ=255) gTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGAATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACTCAGATCATTg < 1:205567/148‑1 (MQ=255) cACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCa > 3:236495/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTa < 4:290144/124‑1 (MQ=255) ccTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTa > 3:290144/1‑124 (MQ=255) cTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACg < 6:171615/133‑1 (MQ=255) cTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACg > 5:171615/1‑133 (MQ=255) tGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTagcaagccaaggtgaccatggtctccaccgaccacatgatggatctaccgcaagagcgcaacttcgaagaacgcccg < 1:188217‑M2/149‑78 (MQ=255) cTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGt > 8:29048/1‑117 (MQ=255) cTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGt < 7:29048/117‑1 (MQ=255) gC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAg < 6:269380/148‑1 (MQ=255) gC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGt > 6:161692/1‑149 (MQ=255) c‑‑‑Tacatgctcagcggccgtgccctcggcccgttgggccagctcaacggcctgctggcccgctaccagcaagccaaggtgaccatggtctccaccgaccacatgatggatctaccgcaagagcgcaacttcgaagaacgcccgctgagcc > 1:23921‑M1/1‑2 (MQ=255) | GTTCTGCTGGTTCGGATAAGTGAAGTCGACCCCGCGGAACTCGACGCTGCCCTGCAGCACCTTGCGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGC‑‑‑TGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTT > NC_002947/192024‑192319 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |