New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 776702 = | 44 (0.780) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 6.0% | coding (808/966 nt) | PP_0668 | transmembrane sensor |
? | NC_002947 | 776792 = | 53 (1.000) | coding (898/966 nt) | PP_0668 | transmembrane sensor |
AGCCGGGCAAATGATGGTGTTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCAT > NC_002947/776557‑776847 | gcaaagaggatgaagtagcgtcatcccaccaagcgaatgagcgtcgcaaaaccggaaaaagaattttgaaaaaacttcagaccgcctcgatggagacccaccaaggcaaggtacgcacaacccggatgggcaacgcacgctcgagCATg > 2:243351‑M1/146‑149 (MQ=255) ggCAAATGATGGTGTTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCAc < 2:174099/149‑1 (MQ=255) aaTGATGGTGTTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTgg < 4:158729/149‑1 (MQ=255) tgatgGTGTTCGACGCGCGGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGc < 3:248211/149‑1 (MQ=255) atgGTGTTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCAt < 8:239443/149‑1 (MQ=255) gcgtcatcccaccaagcgaatgagcgtcgcaaaaccggaaaaagaattttgaaaaaacttcagaccgcctcgatggagacccaccaaggcaaggtacgcacaacccggatgggcaacgcacgctcgagCAt > 4:191283‑M1/129‑131 (MQ=255) gcgtcatcccaccaagcgaatgagcgtcgcaaaaccggaaaaagaattttgaaaaaacttcagaccgcctcgatggagacccaccaaggcaaggtacgcacaacccggatgggcaacgcacgctcgagCAt < 3:191283‑M1/3‑1 (MQ=255) gtTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCAc > 4:147530/1‑136 (MQ=255) gtTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCAc < 3:147530/136‑1 (MQ=255) cagcaAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCa > 7:268958/1‑141 (MQ=255) cagcaAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCa < 8:268958/141‑1 (MQ=255) gaatgagcgtcgcaaaaccggagaaagaattttgaaaaaacttcagaccgcctcgatggagacccaccaaggcaaggtacgcacaacccggatgggcaacgcacgctcgagCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCt < 3:140715‑M1/38‑1 (MQ=255) gTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCt > 3:49519/1‑149 (MQ=255) aaCGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCg > 3:333356/1‑149 (MQ=255) gcgAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGa > 7:195961/1‑148 (MQ=255) gAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATac > 2:138476/1‑149 (MQ=255) gATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATaccga < 8:195961/149‑1 (MQ=255) gAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAg < 6:185137/95‑1 (MQ=255) gAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTg > 1:251059/1‑149 (MQ=255) gCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCg > 8:117700/1‑149 (MQ=255) ccGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGt < 4:49519/149‑1 (MQ=255) ccGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGt > 7:35450/1‑149 (MQ=255) gcgGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTg > 7:320067/1‑149 (MQ=255) gtgtTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCAt < 3:250283/149‑1 (MQ=255) ttGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCt > 6:216184/1‑149 (MQ=255) gatggagacccaccaaggcaaggtacgcacaacccggatgggcaacgcacgctcgagCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGc > 2:136869‑M1/58‑148 (MQ=255) gagacccaccaaggcaaggtacgcacaacccggatgggcaacgcacgctcgagCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGa > 4:140715‑M1/54‑148 (MQ=255) cATGCCGCTGGTTCTGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGGACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGc < 1:302652/149‑1 (MQ=255) cATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGc > 3:186232/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGcc > 3:165806/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGcc > 7:231808/1‑149 (MQ=255) gCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATcc < 6:311498/149‑1 (MQ=255) gCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATcc < 1:138476/149‑1 (MQ=255) gTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTgg > 2:272100/1‑118 (MQ=255) gTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTgg < 1:272100/118‑1 (MQ=255) ttCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATa > 8:312880/1‑102 (MQ=255) ttCAGATGATCGACATTCTGCGAGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATa < 7:312880/102‑1 (MQ=255) cAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTtgt > 5:278562/1‑149 (MQ=255) aGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTtgt < 6:278562/148‑1 (MQ=255) aGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTtgt < 8:231808/148‑1 (MQ=255) tgatCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGt < 7:117700/149‑1 (MQ=255) tCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAg < 4:250696/119‑1 (MQ=255) tCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAg > 3:250696/1‑119 (MQ=255) gACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGTGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTAcctt > 5:141106/1‑149 (MQ=255) gACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTAcctt < 2:286381/149‑1 (MQ=255) gACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTAc > 2:150495/1‑146 (MQ=255) gACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTAc < 1:150495/146‑1 (MQ=255) cgcgATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTtgg < 2:251059/147‑1 (MQ=255) aTTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGtc < 4:165806/149‑1 (MQ=255) ttACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGtct > 4:340400/1‑149 (MQ=255) cGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCAt > 6:345851/1‑149 (MQ=255) | AGCCGGGCAAATGATGGTGTTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCAT > NC_002947/776557‑776847 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |