New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1129335 = | 37 (0.650) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 9.3% | coding (216/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1129374 = | 42 (0.770) | coding (177/2856 nt) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase |
GCGGCCTTGGGAAATTTCTGGCTGATACGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGT > NC_002947/1129191‑1129482 | atcgcccgtcacataggcccgcgcgccgctgacgaacaggccatgctcactgcactgggcttcgactcgctggacgccatgaccgctgcggtcatccccgacagcatcaaaggtaccagcgtgcttggctcgcacgacggccagAGc < 8:32290‑M1/3‑1 (MQ=255) gcccgcgcgccgctgacgaacaggccatgctcactgcactgggcttcgactcgctggacgccatgaccgctgcggtcatccccgacagcatcaaaggtaccagcgtgcttggctcgcacgacggccagAGCGATGGCCTTGAGCGCagc < 4:329981‑M1/21‑1 (MQ=255) ggCTGATACGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCagcgag > 6:265658/1‑149 (MQ=255) tACGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTc > 2:309047/1‑149 (MQ=255) aCGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCagcgagc > 6:309106/1‑143 (MQ=255) aCGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCagcgagc > 6:134082/1‑143 (MQ=255) aCGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCagcgagc < 5:309106/143‑1 (MQ=255) aCGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCagcgagc < 5:134082/143‑1 (MQ=255) gggTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAg < 8:98228/117‑1 (MQ=255) gggTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAg > 7:98228/1‑117 (MQ=255) aacaggccatgctcactgcactgggcttcgactcgctggacgccatgaccgctgcggtcatccccgacagcatcaaaggtaccagcgtgcttggctcgcacgacggccagAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGct > 3:329981‑M1/111‑149 (MQ=255) gtgtACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGcc < 5:335768/149‑1 (MQ=255) gtgtACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGcc < 5:265658/149‑1 (MQ=255) atgctcactgcactgggcttcgactcgctggacgccatgaccgctgcggtcatccccgacagcatcaaaggtaccagcgtgcttggctcgcacgacggccagAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTgg < 1:43853‑M1/43‑1 (MQ=255) atgctcactgcactgggcttcgactcgctggacgccatgaccgctgcggtcatccccgacagcatcaaaggtaccagcgtgcttggctcgcacgacggccagAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTgg > 2:43853‑M1/103‑145 (MQ=255) ccAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGc > 1:164015/1‑143 (MQ=255) ccAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGc < 2:164015/143‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCcgtcgt > 3:165480/1‑149 (MQ=255) ggTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCTATGTAGCTTTTGAACAGCTGGCTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCa < 3:246367/149‑1 (MQ=255) ttttCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAg > 7:76201/1‑149 (MQ=255) agGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGt < 8:76201/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTAc > 8:57226/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCtt > 6:225522/1‑149 (MQ=255) ccGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCgggg < 1:309047/149‑1 (MQ=255) ggAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGa > 3:319561/1‑113 (MQ=255) ggAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGa < 4:319561/113‑1 (MQ=255) gAGTGTGTGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTTAACAGCTGGGTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCTTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGc < 6:71612/123‑1 (MQ=255) gAGTGGGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGAGATGGCCTTGCGCGCAGCGAGAGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCAAAGCACGc > 5:71612/1‑123 (MQ=255) gtagtaGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCa > 3:231661/1‑149 (MQ=255) tagtagCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCAt > 2:127766/1‑149 (MQ=255) gtagCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATgg > 2:23513/1‑149 (MQ=255) tagCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCt < 2:333996/122‑1 (MQ=255) tagCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCt > 1:333996/1‑122 (MQ=255) tagCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGc > 3:295832/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGt > 7:276375/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCCCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGt > 3:199415/1‑149 (MQ=255) cccTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTc > 7:157519/1‑149 (MQ=255) ccGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGa < 1:61128/149‑1 (MQ=255) gATGTAGCTTTTGAAGAGCTGGTTCTTGGCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGGGAGCGCGTCGGGCTCGCTGTGGCCGTCTTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGGTGTCGGGGATGACCGGAGCGGTCATGGCGTCCAGGGAGt < 4:174592/149‑1 (MQ=255) tAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCCCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGaa < 4:199415/149‑1 (MQ=255) ttttGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATCGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGTCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCACGTACCTATGAACCTGTCGGCAATGACCGCAGCGCACAAGACCTCCAGCGAGACGAAGcc > 7:294540/1‑148 (MQ=255) aaCAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCcagtg < 5:225522/148‑1 (MQ=255) cTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCcagtgcagt > 3:197123/1‑147 (MQ=255) cttCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGc < 1:127766/147‑1 (MQ=255) tGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGcc > 2:283770/1‑149 (MQ=255) cAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGt > 6:66965/1‑149 (MQ=255) AGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCcagtgca < 4:324396‑M1/133‑1 (MQ=255) AGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCcagtgca > 3:324396‑M1/1‑133 (MQ=255) | GCGGCCTTGGGAAATTTCTGGCTGATACGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGT > NC_002947/1129191‑1129482 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |