New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1294685 = | 57 (1.010) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 7.0% | coding (166/465 nt) | slyB | outer membrane lipoprotein |
? | NC_002947 | 1294721 = | 53 (0.990) | coding (202/465 nt) | slyB | outer membrane lipoprotein |
CTGGTGGCGACCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCT > NC_002947/1294538‑1294832 | acgaacggtaatttcgacaccttgggtacgggtcaagccttcttctgctgcggaacccgccaagccactggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatg‑g < 8:285767‑M1/2‑1 (MQ=255) tggtggCGACCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAgg‑g > 5:106720/1‑148 (MQ=255) gtggCCTCCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCGGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGCCAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGGGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCAc < 8:52658/149‑1 (MQ=255) gACCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGa > 3:224600/1‑149 (MQ=255) cTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGAccc > 3:254334/1‑149 (MQ=255) cTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGAccc > 2:75486/1‑149 (MQ=255) ccaccaTGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGAtt < 8:70242/149‑1 (MQ=255) caccaTGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTg < 1:276506/149‑1 (MQ=255) aTGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTggcgg < 4:254334/149‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGcggcgg < 8:338847/149‑1 (MQ=255) ctgctgctgGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGAGc > 8:107131/1‑149 (MQ=255) gtcaagccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGt > 1:73411‑M1/117‑149 (MQ=255) gggggCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTg > 4:350758/1‑130 (MQ=255) gggggCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTg < 3:350758/130‑1 (MQ=255) ccttcttctgctgcggaacccgccaagccaccggccacggcaccgatcacggcagccacgatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATc > 2:45213‑M1/111‑149 (MQ=255) gggCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCg > 7:192534/1‑149 (MQ=255) cTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTgg < 6:106720/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTgg < 8:192534/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTgg < 4:224600/149‑1 (MQ=255) tgCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCg > 1:237884/1‑149 (MQ=255) gCCTCGAGACTGACCGTTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCGGGAGCGTTCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGATTCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCAGCAAGACCCCGATTGGGGGCTGTGCTGGTGCGATCGTggggg < 8:111649/148‑3 (MQ=255) ccTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGGTGCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCg < 1:75486/148‑1 (MQ=255) cTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGgtg > 5:172369/1‑149 (MQ=255) tCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTCCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGgtg > 1:353581/1‑148 (MQ=255) ccTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCgggt > 5:2315/1‑141 (MQ=255) ccTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCgggt < 6:2315/143‑3 (MQ=255) ccTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCg > 6:149079/1‑149 (MQ=255) ccTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCg > 2:82560/1‑149 (MQ=255) ccGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAgc < 8:188254/149‑1 (MQ=255) ggTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAgcgc > 6:154055/1‑149 (MQ=255) cTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGt < 7:107131/148‑1 (MQ=255) tCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTgg > 8:210214/1‑149 (MQ=255) ccGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCg > 5:242651/1‑137 (MQ=255) ccGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCg > 5:237484/1‑137 (MQ=255) ccGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCg < 6:237484/137‑1 (MQ=255) ccGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCg < 6:242651/137‑1 (MQ=255) ccGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGcc > 1:117085/1‑149 (MQ=255) ccGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGGGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGcc > 8:105191/1‑149 (MQ=255) cGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGgca < 2:117085/149‑1 (MQ=255) cgccgcGTGCAAACAGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACAAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGTGCGGTGTAGCCGGCACCGACGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGt > 5:219597/1‑149 (MQ=255) ccgcGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTgg < 1:82560/149‑1 (MQ=255) gatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGcc < 4:91897‑M1/54‑1 (MQ=255) gatgctgccacggccaccgcccacggcgctgccggctacaccgcccacgatG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGcc > 3:91897‑M1/52‑105 (MQ=255) aaCCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGa < 8:10395/149‑1 (MQ=255) aaCCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGa > 8:181672/1‑149 (MQ=255) aaCCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGa < 6:172369/149‑1 (MQ=255) aCCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGgcagca > 1:125268/1‑133 (MQ=255) aCCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGgcagca < 2:125268/133‑1 (MQ=255) gCGTATTGGCACAATCGAATACCTGCGTCCTGTCAAGTTCGAGT‑GCACCTAGACCCCGTTTGGCGTCGGTGCTGGTGCAATCGTTGGAGGTGTAGCCGGAAGCGCCGTGGGCTGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTg < 6:219597/149‑1 (MQ=255) gTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCGAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGcc > 4:38818/1‑149 (MQ=255) tGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGAAGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCCCCGTGGGCGGTTGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGCTGCCGTg > 1:99361/1‑149 (MQ=255) aCCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCgg > 3:350129/1‑149 (MQ=255) cATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTg < 7:105191/149‑1 (MQ=255) cATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTg < 2:31225/149‑1 (MQ=255) aTCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTgg > 6:321843/1‑149 (MQ=255) taccTGCGTCCGGTCAAGATGGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCTGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGc < 2:99361/147‑1 (MQ=255) cccTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCg > 4:250891/1‑149 (MQ=255) cTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCggg < 5:154055/149‑1 (MQ=255) gTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGc > 4:35581/1‑125 (MQ=255) gTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGc < 3:35581/125‑1 (MQ=255) gTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCg > 5:166554/1‑138 (MQ=255) gTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCg < 6:166554/138‑1 (MQ=255) gTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCgcag > 5:231070/1‑148 (MQ=255) aaGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCaga < 4:350129/149‑1 (MQ=255) gAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAgg > 1:271905/1‑149 (MQ=255) aGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGc < 2:237884/149‑1 (MQ=255) gg‑gCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCt > 7:47983/1‑149 (MQ=255) | CTGGTGGCGACCTTTACCACCATGTCGCTGCTGCTGGGGGGCTGTGCCTCGAGCCTGACCGGTGACAGCTACTCCCGTGACGAAGCCCGCCGCGTGCAAACCGTGCGTATGGGCACCATCGAATCCCTGCGTCCGGTCAAGATCGAGG‑GCACCAAGACCCCGATTGGCGGCGGTGCTGGTGCCATCGTGGGCGGTGTAGCCGGCAGCGCCGTGGGCGGTGGCCGTGGCAGCATCGTGGCTGCCGTGATCGGTGCCGTGGCCGGTGGCTTGGCGGGTTCCGCAGCAGAAGAAGGCT > NC_002947/1294538‑1294832 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |