New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2396941 | 57 (1.010) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.3% | coding (2716/3636 nt) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
? | NC_002947 | = 2396980 | 53 (0.990) | coding (2677/3636 nt) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
TGCTCGGGCAGCGGTTTGGGCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGTGTGCTGGTTCCGTCATC > NC_002947/2396796‑2397088 | tgctCGGGCAGCGGTTTGGGCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAg > 2:162279/1‑149 (MQ=255) gggCAGCGGTTTGGGCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCg < 5:322019/148‑1 (MQ=255) gCAGCGGTTTGGGCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTa > 8:258135/1‑149 (MQ=255) cAGCGGTTTGGGCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTAc > 6:212531/1‑149 (MQ=255) aGCGGTTTGGGCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTAcc > 1:238541/1‑149 (MQ=255) cGGTTTGGGCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCgg > 8:337993/1‑143 (MQ=255) cGGTTTGGGCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCgg < 7:337993/143‑1 (MQ=255) gggCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑gg < 7:258135/148‑1 (MQ=255) ggCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGCTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGgc < 5:146153/149‑1 (MQ=255) cgcCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCt < 6:64021/148‑1 (MQ=255) cACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCggg < 5:108089/148‑1 (MQ=255) ccGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCAGCCGCCCATCATTTCCCACAGGTTGCGCCAGATAGCCACGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑CGGCCCCCTGGCTGTGCgcgaagg > 3:172863/1‑143 (MQ=255) cAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCaacccgcacagccagggcgcccgcgccggtaccgggctgggcctgg < 3:34489‑M1/148‑47 (MQ=255) cAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGa < 2:2958/149‑1 (MQ=255) ttCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCGTGGATGAACGGGtt > 6:35198/1‑149 (MQ=255) ttCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGtt > 8:216496/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGtt < 2:153275/147‑1 (MQ=255) aGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCTTGGATGAACGGGTTGaa < 5:35198/149‑1 (MQ=255) gcACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTT‑ATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGgc < 1:302513/149‑1 (MQ=255) cACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGgc < 7:305675/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCaacccgcacagccagggcgcccgcgccggtaccgggctgg > 5:233322‑M1/1‑83 (MQ=255) aCCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCaacccgcacagccagggcgcccgcgccggtaccgggctgg < 6:233322‑M1/123‑41 (MQ=255) cGACATCCTCCAGGCTCTTCATGAACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGgtcg > 3:117912/1‑149 (MQ=255) ctccAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCg‑ggg < 7:216496/148‑1 (MQ=255) ccAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTg > 3:230852/1‑148 (MQ=255) gCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGgatgc > 7:141547/1‑149 (MQ=255) ctctTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGgatgcc < 2:238541/149‑1 (MQ=255) cATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGgatgccgat < 6:36154/147‑1 (MQ=255) cATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGgatgccgat < 4:173043/147‑1 (MQ=255) aTGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGgatgccgatgc < 1:162279/148‑1 (MQ=255) aTGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGgatgccgatgc < 1:110759/148‑1 (MQ=255) tGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGAt > 6:250764/1‑100 (MQ=255) tGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGAt < 5:250764/100‑1 (MQ=255) gACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACt < 4:230852/149‑1 (MQ=255) aGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTc > 3:94243/1‑149 (MQ=255) gCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTcgc > 3:249057/1‑149 (MQ=255) ccgccCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCAc < 5:212531/149‑1 (MQ=255) cgccCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCAcc < 4:249057/149‑1 (MQ=255) gccCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACct > 1:33251/1‑149 (MQ=255) ccAGCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGGCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACctc < 7:55584/148‑1 (MQ=255) catcatTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACTGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCAACTGTAGCGCACctcca > 5:210232/1‑149 (MQ=255) catcatTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACctc > 7:12129/1‑147 (MQ=255) tttCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGgatgccgatgc > 6:329507/1‑126 (MQ=255) tttCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGgatgccgatgc < 5:329507/126‑1 (MQ=255) cacaGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTAc > 8:41199/1‑149 (MQ=255) acaGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTggcct > 1:331070‑M2/1‑64 (MQ=255) acaGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTggcct < 2:331070‑M2/69‑6 (MQ=255) acaGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCGCGGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTa < 1:68849/148‑1 (MQ=255) acaGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACctc > 5:253757/1‑136 (MQ=255) acaGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACctc < 6:253757/136‑1 (MQ=255) acaGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTa > 2:68849/1‑147 (MQ=255) acaGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACg < 2:33251/149‑1 (MQ=255) ggCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGgatgccgat > 2:52574/1‑109 (MQ=255) ggCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGtgtg > 7:311851/1‑149 (MQ=255) ggCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTAACGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTTCGCGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCCCTGCAGGACGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCAAATTAGCGCACCTCCAGCTACAGTACGGCTGGtgtg > 2:289302/1‑149 (MQ=255) gCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGTGTGc < 4:94243/149‑1 (MQ=255) gCAGATGACCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGCGGGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCGTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGtgtg > 1:235397/1‑149 (MQ=255) aGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGTGTGCTg < 4:117912/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTggcctggccatctgccgcaacctgtgcgaaatgatgggcggcagcctgtccatgaagagcctggaggatgtcggtacccaggtgcgcctgaagatgccgctg < 3:34489‑M2/148‑103 (MQ=255) ccAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACctccagc < 3:331602/122‑1 (MQ=255) ccAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACctccagc > 4:331602/1‑122 (MQ=255) ccAGGCCCAGCACGGTACCGGAGC‑GTGCGCCCTGGCTGTGCGGGATGGCCTGGATGAACGGGGTGAACAGGCGATTCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGCTGCCAGTGTCGCGCACCTCCAGCACCAGTACGGCTGGGGTGCTGGTTACg > 6:342730/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGTGTGCTGGTTCCGt > 3:288112/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACAGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGTGAGCTGGTTCCGt > 8:184722/1‑149 (MQ=255) aggccaacccgcacagccagggcgcccgcgccggtaccgggctgggcctggccatctgccgcaacctgt < 2:331070‑M1/69‑65 (MQ=255) aggccaacccgcacagccagggcgcccgcgccggtaccgggctgggcctggccatctgccgcaacctgt > 1:331070‑M1/1‑5 (MQ=255) gCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGTGTGCTGGTTCCGTCAt > 2:47487/1‑149 (MQ=255) cccAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGTGTGCTGGTTCCGTCATc < 8:141547/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTggcctggccatctgccgcaacctgtgcgaaatgatgggcggcagcctgtccatgaagagcctggaggatgtcggtacccaggt < 6:233322‑M2/123‑84 (MQ=255) ccAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTggcctggccatctgccgcaacctgtgcgaaatgatgggcggcagcctgtccatgaagagcctggaggatgtcggtacccaggt > 5:233322‑M2/1‑40 (MQ=255) ccAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGTGTGCTGGTTCCGTCATc > 3:264122/1‑148 (MQ=255) | TGCTCGGGCAGCGGTTTGGGCTGCTCTGCGCCATCCACCCGTTGCAGCGGCATCTTCAGGCGCACCTGGGTACCGACATCCTCCAGGCTCTTCATGGACAGGCTGCCGCCCATCATTTCGCACAGGTTGCGGCAGATGGCCAGGCCCAGCCCGGTACCGGCGC‑GGGCGCCCTGGCTGTGCGGGTTGGCCTGGATGAACGGGTTGAACAGGCGCTGCAGGTCGTCG‑GGGTGGATGCCGATGCCACTGTCGCGCACCTCCAGCTCCAGTACGGCTGGTGTGCTGGTTCCGTCATC > NC_002947/2396796‑2397088 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |