New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2546228 = | 52 (0.920) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 7.6% | coding (1329/1902 nt) | PP_2238 | metallopeptidase |
? | NC_002947 | 2546260 = | 48 (0.900) | coding (1361/1902 nt) | PP_2238 | metallopeptidase |
TCGTGTCACTGAGCTTTTCTACCATTGCCGCCTTCAATGGCAATGGCGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGTTGCTCGACGCCATTGCCCGGG > NC_002947/2546083‑2546376 | atagtcgacctggtcagcccagatcggcgcccgggcaatggcgtcgagcaacggcgacagtacccctcgcgggaacgtggcacgcgacaaggcaatcatgcccttgagtacacgggtgcagtcctgcttctgagcctggctggggtTAc > 3:154036‑M1/147‑149 (MQ=255) tagtcgacctgggcagcccagatcggcgcccgggcattggcgtcgagcaacggcgacagtacccctcgcgggaaggtggcccgcgacaaggcaatcaggccgttgagtacacgggtgcagtcctgctgctgagcctggctggggtTAcc < 5:93403‑M1/4‑1 (MQ=255) ttttCTACCATTGCCGCCTTCAATGGCAATGGCGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCAt > 2:116547/1‑149 (MQ=255) agcccagatcggcgcccgggcaatggcgtcgagcaacggcgacagtacccctcgcgggaacgtggcacgcgacaaggcaatcatgcccttgagtacacgggtgcagtcctgcttctgagcctggctggggtTa > 4:59584‑M1/132‑133 (MQ=255) agcccagatcggcgcccgggcaatggcgtcgagcaacggcgacagtacccctcgcgggaacgtggcacgcgacaaggcaatcatgcccttgagtacacgggtgcagtcctgcttctgagcctggctggggtTa < 3:59584‑M1/2‑1 (MQ=255) tACCATTGCCGCCTTCAATGGCAATGGCGCGATGCCACACTACCGCGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGc > 8:177996/1‑149 (MQ=255) ccATTGCCGCCTTCAATGGCAATGGCGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCcg > 7:60373/1‑149 (MQ=255) cATTGCCGCCTTCAATGGCAATGGCGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCcgg > 7:18826/1‑149 (MQ=255) ccgccTTCAATGGCAATGGCGCGATGTCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCcggtcgg > 6:141297/1‑148 (MQ=255) gccTTCAATGGCAAAGGCGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCGGGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGACAATACCTCGGCGGCACTACAGACATCACCCGCATGGTGCCGGGCGGTaa > 6:95173/1‑149 (MQ=255) ccgggcaatggcgtcgagcaacggcgacagtacccctcgcgggaacgtggcacgcgacaaggcaatcatgcccttgagtacacgggtgcagtcctgcttctgagcctggctggggtTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTaa > 2:201473‑M1/117‑149 (MQ=255) caatggcaatggCGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATTGTGCCGGTCGGTAAcccc < 4:183972/148‑1 (MQ=255) aatggcaatggcGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCcggt > 8:269884/1‑137 (MQ=255) aatggcaatggcGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCcggt < 7:269884/137‑1 (MQ=255) aatggcaatggcGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCccag > 5:97704/1‑149 (MQ=255) atggcGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCt > 7:181297/1‑149 (MQ=255) gcgcGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAAc > 6:93018/1‑134 (MQ=255) gcgcGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAAc < 5:93018/134‑1 (MQ=255) gcgATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGCGTTGGAGCCGCCTCTATTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGa < 1:116547/149‑1 (MQ=255) caacggcgacagtacccctcgcgggaacgtggcacgcgacaaggcaatcatgcccttgagtacacgggtgcagtcctgcttctgagcctggctggggtTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAAcc > 6:182051‑M1/99‑133 (MQ=255) caacggcgacagtacccctcgcgggaacgtggcacgcgacaaggcaatcatgcccttgagtacacgggtgcagtcctgcttctgagcctggctggggtTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAAcc < 5:182051‑M1/35‑1 (MQ=255) caacggcgacagtacccctcgcgggaacgtggcacgcgacaaggcaatcatgcccttgagtacacgggtgcagtcctgcttctgagcctggctggggtTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGaa > 7:63955‑M1/99‑149 (MQ=255) gATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAg > 2:269889/1‑148 (MQ=255) aTGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCa < 6:353609/149‑1 (MQ=255) aTGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCa < 8:18826/149‑1 (MQ=255) tgtcacaCTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGctg < 5:141297/146‑3 (MQ=255) cacaCTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGAc > 6:265141/1‑149 (MQ=255) tACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCAc > 8:184717/1‑149 (MQ=255) aCCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTAc > 7:75390/1‑148 (MQ=255) aGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAg > 7:41054/1‑149 (MQ=255) aGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAg < 6:43480/149‑1 (MQ=255) gCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAgg < 7:184717/149‑1 (MQ=255) gCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAgg < 7:177996/149‑1 (MQ=255) gCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATg < 8:60373/148‑1 (MQ=255) aTGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCgt > 5:90265/1‑131 (MQ=255) aTGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCgt < 6:90265/131‑1 (MQ=255) tCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGaa > 5:319678/1‑109 (MQ=255) tCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGaa < 6:319678/109‑1 (MQ=255) gAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTcgcg > 5:152676/1‑149 (MQ=255) tgctg‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCcgc > 4:260349/1‑147 (MQ=255) tgctg‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCcgc > 4:225151/1‑147 (MQ=255) gctg‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCTGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGc < 1:318923/97‑1 (MQ=255) gctg‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGc > 2:318923/1‑97 (MQ=255) g‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAgggg > 6:93403/1‑149 (MQ=255) aTCGACTCTGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAgggg < 5:265141/148‑1 (MQ=255) aTCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGt < 5:95173/149‑1 (MQ=255) cGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCCCCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCCCCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTAc > 8:250981/1‑149 (MQ=255) aCTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCt > 6:328581/1‑117 (MQ=255) aCTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCt < 5:328581/117‑1 (MQ=255) aCTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTg > 4:172129/1‑149 (MQ=255) tCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTc > 4:4011/1‑149 (MQ=255) tCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGAACTCAAGGGCATGAT‑TTCATTGTCGCTTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTc > 4:289811/1‑149 (MQ=255) ggTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGtt < 6:152676/149‑1 (MQ=255) ggTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGtt < 8:181297/149‑1 (MQ=255) tCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGTTGc > 7:273634/1‑149 (MQ=255) aaTACCTGGGCGGCAGTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGTTGCTc < 3:289811/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGGCACTACCGACATCCCCCGCATGGTGCCGGTCGGGAACCCCAGCCAGGCGCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGTTGCTCGAc < 4:65094/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGATATGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGTTGCTCGAc < 1:269889/149‑1 (MQ=255) tGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGTTGCTCGACGc > 4:236839/1‑148 (MQ=255) ggcggcACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGTTGCTCGACGCCAt > 4:226524/1‑149 (MQ=255) cTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGTGGTACTGTCGCCGTTGCTCGACGCCATTGCCCgg < 3:225151/149‑1 (MQ=255) TACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGTTGCTCGACGCCATTGCCCggg < 4:298318‑M1/149‑1 (MQ=255) | TCGTGTCACTGAGCTTTTCTACCATTGCCGCCTTCAATGGCAATGGCGCGATGCCACACTACCGGGCCACCGAGCAGTCGCATGCGCTCATCGAGGGTAATGGCTTGCTGCTG‑ATCGACTCGGGCGGTCAATACCTGGGCGGCACTACCGACATCACCCGCATGGTGCCGGTCGGTAACCCCAGCCAGGCTCAGAAGCAGGACTGCACCCGTGTACTCAAGGGCATGAT‑TGCCTTGTCGCGTGCCACGTTCCCGCGAGGGGTACTGTCGCCGTTGCTCGACGCCATTGCCCGGG > NC_002947/2546083‑2546376 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |