New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2651703 = | 43 (0.760) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 7.0% | coding (715/1113 nt) | aroF‑I | tyr‑sensitive phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
? | NC_002947 | 2651786 = | 65 (1.210) | coding (632/1113 nt) | aroF‑I | tyr‑sensitive phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
CCTTGTTGGAGTTGGCATGGCTGCAGTCGACCATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGAC > NC_002947/2651556‑2651842 | gccgcagtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcaaacacaccgcgagatggcctcgggcctgtcctcggcggtgggtttcaagaacggtaccgatggcggcctgaccgttgccatcaat > 1:100381‑M1/148‑148 (MQ=255) ttgttgGAGTTGGCATGGCTGCAGTCGACCATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGcc > 4:166674/1‑149 (MQ=255) cgcagtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcaaacacaccgcgagatggcctcgggcctgtcctcggcggtgggtttcaagaacggtaccgatggcggcctgaccgttgccatcaaTGcc > 3:235807‑M1/146‑149 (MQ=255) gttgGAGTTGGCATGGCTGCAGTCGACCATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCt > 6:299175/1‑149 (MQ=255) gtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcaaacacaccgcgagatggcctcgggcctgtcctcggcggtgggtttcaagaacggtaccgatggcggcctgaccgttgccatcaaTGcc < 1:264682‑M1/4‑1 (MQ=255) gtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcaaacacaccgcgagatggcctcgggcctgtcctcggcggtgggtttcaagaacggtaccgatggcggcctgaccgttgccatcaaTGcc > 2:264682‑M1/142‑145 (MQ=255) gTTGGCATGGCTGCAGTCGACCATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTtggtgg < 4:330379/149‑1 (MQ=255) ttGGCATGGCTGCAGTCGACCATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTggtggt < 6:345061/149‑1 (MQ=255) gCATGGCTGCAGTCGACCATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGa < 8:286330/148‑1 (MQ=255) acctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcaaacacaccgcgagatggcctcgggcctgtcctcggcggtgggtttcaagaacggtaccgatggcggcctgaccgttgccatcaaTGCCCTTGGTGGTGACGAt < 1:229311‑M1/19‑1 (MQ=255) cAGTCGACCATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGacac < 5:299175/149‑1 (MQ=255) aacATGATGTTGGCCTTGATCTTGCCCTTGGCCAGGTCCAGATCGAACAGGTAGACCCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCAATTGCCGCCCCGCAGAACCACGTGTCCGTATGGGATGCCATTGGTGGAGAGGATCGACACgccgcc > 1:325517/3‑149 (MQ=255) cATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTtggtg < 3:104555/127‑1 (MQ=255) cATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCtt > 6:76436/1‑149 (MQ=255) aatgatgTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTtggtg > 4:104555/2‑127 (MQ=255) gCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGAt < 7:238709/149‑1 (MQ=255) cTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGc < 5:131439/149‑1 (MQ=255) cTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGc > 1:163246/1‑149 (MQ=255) cTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGCGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGc > 3:142021/1‑149 (MQ=255) ttGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGcc > 3:147754/1‑149 (MQ=255) tCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCACTTGGTGGTGAAGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAg > 4:249244/1‑148 (MQ=255) gccttggccAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGCCGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGGTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCg < 2:293072/149‑1 (MQ=255) ggccAGGTCCTGTTCGCACAGCGCGACGCTCACCGAGTCTTAGTTCGGCTTTCCATTGCCGGCTGGGAGTTCCACGTGTGCGTTTGGGTTGCCCTTGGTGGTTACCATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATTCCCAGTAAGCGGTg < 2:325517/147‑1 (MQ=255) gccAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCgg > 6:333957/1‑149 (MQ=255) cgcaaacacaccgcgagatggcctcgggcctgtcctcggcggtgggtttcaagaacggtaccgatggcggcctgaccgttgccatcaaTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCgg < 8:190766‑M1/61‑1 (MQ=255) ggTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTg < 5:333957/149‑1 (MQ=255) gTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTg > 6:13056/1‑148 (MQ=255) acaGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTg > 5:122500/1‑148 (MQ=255) caGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCa < 6:122500/149‑1 (MQ=255) ggcctgtcctcggcggtgggtttcaagaacggtaccgatggcggcctgaccgttgccatcaaTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGa > 2:229311‑M1/63‑149 (MQ=255) cTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGAt < 2:163246/149‑1 (MQ=255) cctgtcctcggcggtgggtttcaagaacggtaccgatggcggcctgaccgttgccatcaaTGTCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATg > 7:190766‑M1/61‑149 (MQ=255) aCCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATgg < 2:95615/148‑1 (MQ=255) aCCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATgg > 1:110551/1‑148 (MQ=255) aCCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGCGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATgg < 4:142021/148‑1 (MQ=255) ttCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACAGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGgcc > 8:323052/1‑149 (MQ=255) ttCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCGTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGgcc > 1:90213/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGacac < 8:552/113‑1 (MQ=255) gCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCa > 8:149406/1‑149 (MQ=255) cATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTa > 2:204080/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTAcc > 1:223569/1‑149 (MQ=255) gcAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGaaa < 3:166674/149‑1 (MQ=255) ccACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACTGTTCTTGaaa < 6:275573/143‑1 (MQ=255) ccACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACGGTTCTTGaaa > 5:275573/1‑143 (MQ=255) cACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCAt < 4:191640/125‑1 (MQ=255) cACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCAt > 3:191640/1‑125 (MQ=255) cACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCAccg > 1:136275/1‑149 (MQ=255) cACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCAccg > 3:298609/1‑149 (MQ=255) ggCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAg > 1:178003/1‑149 (MQ=255) ccGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGa < 5:76436/149‑1 (MQ=255) cGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGAc < 2:110551/149‑1 (MQ=255) gTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGa > 4:292728/1‑147 (MQ=255) ggTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCAt < 6:96186/111‑1 (MQ=255) ggTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCAt > 5:96186/1‑111 (MQ=255) ggTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGaaa > 6:204024/1‑128 (MQ=255) ggTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGaaa < 5:204024/128‑1 (MQ=255) | CCTTGTTGGAGTTGGCATGGCTGCAGTCGACCATGATGTTGGCCTTGATCTTGGCCTTGGCCAGGTCCTGTTCGCACAGGGCGACGCTGACCGAGTCGTAGTTCGGCTTGCCATTGCCGCCGCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGAC > NC_002947/2651556‑2651842 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |