| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3547076 = | 58 (1.030) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.7% | coding (21/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter |
| ? | NC_002947 | 3547143 = | 56 (1.020) | coding (88/1377 nt) | PP_3132 | polysaccharide transporter | |||||
ACGATCAACGCACGAAAATGTTCAGGCATCGGCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCGGGGTGATGGTCATCGC > NC_002947/3546932‑3547222 | tctggatgatgttctggcgcaggccgacatcggaaagcaaatgcagcagtatcgaaacagtggtggcgatgaccatcaccccgaacatttccggcagcagcaagcgggccatgatcagattgccgcccaggcgcatcacctgtgaAgc < 5:209486‑M1/3‑1 (MQ=255) tCAACGCACGAAAATGTTCAGGCATCGGCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCcgccgc < 5:56962/149‑1 (MQ=255) aaCGCACGAAAATGTTCAGGCATCGGCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGa < 1:2185/149‑1 (MQ=255) aaCGCACGAAAATGTTCAGGCATCGGCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGa < 2:103393/149‑1 (MQ=255) gttctggcgcaggccgacatcggaaagcaaatgcagcagtatcgaaacagtggtggcgatgaccatcaccccgaacatttccggcagcagcaagcgggccatgatcagattgccgcccaggcgcatcacctgtgaa < 8:27907‑M1/1‑1 (MQ=255) gttctggcgcaggccgacatcggaaagcaaatgcagcagtatcgaaacagtggtggcgatgaccatcaccccgaacatttccggcagcagcaagcgggccatgatcagattgccgcccaggcgcatcacctgtgaa > 7:27907‑M1/136‑136 (MQ=255) tCAGGCATCGGATATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCggg > 4:140749/1‑149 (MQ=255) ggCATCGGCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGTGGGCCt > 4:260838/1‑149 (MQ=255) aTCGGCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGa < 2:329837/149‑1 (MQ=255) aTCGGCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCAGCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGa < 2:104724/149‑1 (MQ=255) ggCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATTCAGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAgg < 2:214856/148‑1 (MQ=255) gCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGc > 5:303171/1‑149 (MQ=255) tATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTGTTAGCCAATCAGTCGGTGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCg > 7:232281/1‑149 (MQ=255) tGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCg < 5:22574/147‑1 (MQ=255) gTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGt > 4:156189/1‑149 (MQ=255) tACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTc > 4:217105/1‑149 (MQ=255) tACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAACCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTc > 1:106762/1‑149 (MQ=255) ctgcTTTCCCTTGGTGGGCAAGGGCTAGCATGGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGGCTATCAGTCAGAGATTGAT‑GTCATGCCGTCGTTTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCtt < 2:278544/146‑1 (MQ=255) cacCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCtt < 3:156189/149‑1 (MQ=255) acCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTg > 2:323348/1‑149 (MQ=255) ccTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCt < 5:287378/148‑1 (MQ=255) ccTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTg > 4:121165/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTgg > 7:121746/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTgg > 6:302780/1‑149 (MQ=255) aaCGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGt < 8:232281/149‑1 (MQ=255) gCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGTGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTca < 3:260838/148‑1 (MQ=255) gCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTca < 1:323348/148‑1 (MQ=255) tCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGGCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAgg < 5:302780/149‑1 (MQ=255) gTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGt < 8:121746/148‑1 (MQ=255) tGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGa > 2:202851/1‑149 (MQ=255) aaTTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAACTTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCAGCGAGACTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGcctg > 1:259691/1‑105 (MQ=255) ccccgaacatttccggcagcagcaagcgggccatgatcagattgccgcccaggcgcatcacctgtgaAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAg < 4:151566‑M1/73‑1 (MQ=255) ccccgaacatttccggcagcagcaagcgggccatgatcagattgccgcccaggcgcatcacctgtgaAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAg > 3:151566‑M1/68‑140 (MQ=255) ttGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCt > 8:336332/1‑149 (MQ=255) aaaCTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAg < 3:31314/135‑1 (MQ=255) aaaCTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAg > 4:31314/1‑135 (MQ=255) gTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATc < 3:121165/149‑1 (MQ=255) gcagcagcaagcgggccatgatcagattgccgcccaggcgcatcacctgtgaAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGc > 1:313957‑M1/53‑111 (MQ=255) gcagcagcaagcgggccatgatcagattgccgcccaggcgcatcacctgtgaAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGc < 2:313957‑M1/59‑1 (MQ=255) aCTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCg > 7:213561/1‑109 (MQ=255) aCTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCg < 8:213561/109‑1 (MQ=255) aCTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGa < 7:336332/149‑1 (MQ=255) ttttAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGAt > 2:332531/1‑148 (MQ=255) gCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGc > 3:300597/1‑149 (MQ=255) aTCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTgc < 4:93826/57‑1 (MQ=255) aTCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTgc > 3:93826/1‑57 (MQ=255) aTCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGa < 8:236793/138‑1 (MQ=255) aTCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGa > 7:236793/1‑138 (MQ=255) agtcagAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGTGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTtg < 6:116478/149‑1 (MQ=255) tcagAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAgg < 4:160727/109‑1 (MQ=255) tcagAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAgg > 3:160727/1‑109 (MQ=255) gaTTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTtgctgctgc < 1:332531/149‑1 (MQ=255) ccGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGaaa < 6:368212/142‑1 (MQ=255) ccGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAAtagatag > 5:368212/1‑143 (MQ=255) ccGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCgg < 6:303171/149‑1 (MQ=255) ccGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCgg < 6:335801/149‑1 (MQ=255) ccGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCgg > 5:335801/1‑149 (MQ=255) ccGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCCGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAAt > 1:46130/1‑143 (MQ=255) ccGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCCGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAAt < 2:46130/143‑1 (MQ=255) gATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCGGGGTg < 3:217105/148‑1 (MQ=255) gATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCGGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCGGGGTGa < 2:106762/149‑1 (MQ=255) aTTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCa > 7:268867/1‑112 (MQ=255) aTTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCa < 8:268867/112‑1 (MQ=255) aTTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCGGGGTGAt > 5:169638/1‑149 (MQ=255) tgtgTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAAGGTTCGGGGTGATGGTCa > 7:240890/1‑149 (MQ=255) gtCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCGGGGTGATGGTCATCg > 6:240919/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCGGGGTGATGGTCATc < 6:167543/147‑1 (MQ=255) tCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCGGGGTGATGGTCATc > 5:167543/1‑147 (MQ=255) tCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCGGGGTGATGGTCATCGc > 4:148935/1‑149 (MQ=255) | ACGATCAACGCACGAAAATGTTCAGGCATCGGCTATGTACACCTTTCCCTTGGTGGGCAACGGCTAGCATCGTGGCTAATTGAAACTATAGTGACTTTTAGCCAATCAGTCAGAGATTGAA‑GTCATGCCGTCGATTGATGTGTCAGCCGCCGCGAGCCTGCGCAAGCGGGCCTTGAGGGCCGGGTCTTGGAACCTGGTCTCGCAGGTGGCTTCACAGGTGATGCGCCTGGGCGGCAATCTGATCATGGCCCGCTTGCTGCTGCCGGAAATGTTCGGGGTGATGGTCATCGC > NC_002947/3546932‑3547222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |