New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4662937 = | 69 (1.220) | 6 (0.110) | 4/244 | NT | 9.2% | coding (1801/2715 nt) | nuoG | NADH‑quinone oxidoreductase subunit G |
? | NC_002947 | 4663024 = | 53 (0.990) | coding (1888/2715 nt) | nuoG | NADH‑quinone oxidoreductase subunit G |
ATCAGCGGCAAAGCCGATGCCATCGTGGTGCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATCCAGATCCACGAAGGCTGGCGCTGGATGCACG > NC_002947/4662793‑4663084 | cggagcggcttcggcgcaggcgctggtgacgtggtccagctgggtccagtcgaccggcttgttcagcagggtggcacgcagggcgtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCt > 5:130274‑M1/145‑149 (MQ=255) ggagcggcttcggcgcaggcgctggtgacgtggtccagctgggtccagtcgaccggcttgttcagcagggtggcacgcagggcgtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCTg < 8:109368‑M1/6‑1 (MQ=255) gagcggcttcggcgcaggcgctggtgacgtggtccagctgggtccagtcgaccggcttgttcagcagggtggcacgcagggcgtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCTg < 1:331259‑M1/6‑1 (MQ=255) agcggcttcggcgcaggcgctggtgacgtggtccagctgggtccagtcgaccggcttgttcagcagggtggcacgcagggcgtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCTgg < 7:225512‑M1/7‑1 (MQ=255) gCGGCAAAGCCGATGCCATCGTGGTGCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGtg < 6:66572/149‑1 (MQ=255) ttcggcgcaggcgctggtgacgtggtccagctgggtccagtcgaccggcttgttcagcagggtggcacgcagggcgtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCTGGTGCTgcc < 2:237491‑M1/14‑1 (MQ=255) ttcggcgcaggcgctggtgacgtggtccagctgggtccagtcgaccggcttgttcagcagggtggcacgcagggcgtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCTGGTGCTgcc < 6:99571‑M1/14‑1 (MQ=255) aaaGCCGATGCCATCGTGGTGCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGAGCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTgcc > 1:326347/1‑149 (MQ=255) atgCCGATGCGATCGTGGTGCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCGTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCAGCTGGTGCTgccg < 8:267565/147‑1 (MQ=255) aaGCCGATGCCATCGTGGTGCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTg < 8:153852/140‑1 (MQ=255) aaGCCGATGCCATCGTGGTGCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTg > 7:153852/1‑140 (MQ=255) aTGCCATCGTGGTGCTGGAAATCGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCGGgccg‑cc < 7:144137/149‑1 (MQ=255) aTGCCATCGTGGTGCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGgccg‑cc < 4:344361/149‑1 (MQ=255) aTCGTGGTGCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGTTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGtt > 6:181181/1‑149 (MQ=255) tggtgCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGcc < 5:289104/149‑1 (MQ=255) gtgCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCg < 7:39640/148‑1 (MQ=255) tgCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCg > 2:52227/1‑147 (MQ=255) aCCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTAcc < 5:73573/149‑1 (MQ=255) tGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTg > 1:346381/1‑149 (MQ=255) tGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTg > 1:104725/1‑149 (MQ=255) gTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGt < 6:313974/108‑1 (MQ=255) gTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGt > 5:313974/1‑108 (MQ=255) gTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTgg > 6:336056/1‑149 (MQ=255) ccGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGcc < 5:5474/149‑1 (MQ=255) ccGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGc > 6:5474/1‑148 (MQ=255) ccGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGc > 6:29755/1‑148 (MQ=255) ccGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGc > 8:194327/1‑148 (MQ=255) gcgTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAg < 2:91827/149‑1 (MQ=255) aCCGGCCGCCCCGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGGGCTCATCGTTCCCGACCACTCCAAACCCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAg < 4:187820/149‑1 (MQ=255) aCCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAg > 4:324168/1‑149 (MQ=255) ccGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCTTTGCCGACCACTCCAAATCCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAgg < 2:236143/149‑1 (MQ=255) ttgttcagcagggtggcacgcagggcgtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGc > 1:237491‑M1/87‑149 (MQ=255) cGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGc > 4:75416/1‑149 (MQ=255) gttcagcagggtggcacgcagggcgtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGc > 5:99571‑M1/85‑147 (MQ=255) gccgccAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCg > 1:104276/1‑149 (MQ=255) ccgccAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGt < 2:104276/149‑1 (MQ=255) cgccAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTg < 5:29755/149‑1 (MQ=255) gccAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGATGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGc < 1:53652/149‑1 (MQ=255) gccAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGc > 3:52418/1‑149 (MQ=255) agcagggtggcacgcagggcgtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGcc < 2:234770‑M1/69‑1 (MQ=255) gTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGcc < 2:311806/130‑1 (MQ=255) gTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGcc > 1:311806/1‑130 (MQ=255) ttgcCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCttcttc < 5:181181/148‑1 (MQ=255) cccTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCa < 4:52418/148‑1 (MQ=255) cccTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAg > 6:216701/1‑149 (MQ=255) cTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGgt < 1:246570/149‑1 (MQ=255) gtgcatccagcgccagccttcgtggatctggatgctgctgtccaggtactgcgggtcgaaCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGtt > 1:234770‑M1/61‑149 (MQ=255) ggCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAgcgc < 3:13370/130‑1 (MQ=255) ggCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAgcgc > 4:13370/1‑130 (MQ=255) gCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGAccc < 7:194327/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCACGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGaa < 4:29436/113‑1 (MQ=255) ccAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCACGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGaa > 3:29436/1‑113 (MQ=255) cAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAACCCGCCAGCTTCGACCGCGCCCACCTTGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTGCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGc < 2:346381/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCg > 7:163121/1‑148 (MQ=255) cAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGc < 2:104725/149‑1 (MQ=255) aaGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCa < 3:324168/149‑1 (MQ=255) tggtgATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTAc < 3:75416/149‑1 (MQ=255) ggtgATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGcttc < 7:212688/124‑1 (MQ=255) ggtgATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGcttc > 8:212688/1‑124 (MQ=255) ttGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGAcag > 3:39868/1‑148 (MQ=255) gCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGAcagca < 1:52227/148‑1 (MQ=255) cACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGAGGGTACCGTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTcc < 4:196112/112‑1 (MQ=255) cTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCg < 6:69404/124‑1 (MQ=255) cTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCg > 5:69404/1‑124 (MQ=255) cTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGc > 4:253330/1‑125 (MQ=255) cTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGc < 3:253330/125‑1 (MQ=255) tCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATc > 6:35555/1‑144 (MQ=255) tCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATc > 4:130914/1‑144 (MQ=255) ccAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGAc < 6:23956/119‑1 (MQ=255) ccAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGAc > 5:23956/1‑119 (MQ=255) cAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGgt > 8:39981/1‑111 (MQ=255) cAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGgt < 7:39981/111‑1 (MQ=255) cAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATCCAGATc < 2:326347/148‑1 (MQ=255) aCCGCCTCCGTCGACCGCGCGCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGATGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTg < 1:254310/126‑1 (MQ=255) aCCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGAGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCAGCAGTACCTg > 2:254310/1‑126 (MQ=255) ccGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATCCAGATCCACGaa < 1:277186/149‑1 (MQ=255) aCCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATCCAGATCCACGAAGGCTg < 5:216701/149‑1 (MQ=255) tCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCGTCCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATCCa > 1:214812/1‑131 (MQ=255) ccGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATCCAGATCCACGAAGGCTGGCGCTGGa > 1:349458/1‑149 (MQ=255) cccACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATCCAGATCCACGAAGGCTGGCGCTGGATGCAc < 8:163121/149‑1 (MQ=255) ccACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATCCAGATCCACGAAGGCTGGCGCTGGATGCACg > 2:112063/1‑149 (MQ=255) | ATCAGCGGCAAAGCCGATGCCATCGTGGTGCTGGAAAACGACCTGTACGCCCGCGTACCGGCCGCCAAGGTCGATGCTGCCCTGGCTGCGGCCAAGGTGGTGATCGTTGCCGACCACTCCAAAACCGCCACCGTCGACCGCGCCCACCTGGTGCTGCCGGCCG‑CCTCGTTCGCCGAAGGCGACGGTACCCTGGTCAGCCAGGAAGGCCGTGCCCAGCGCTTCTTCCAGGTGTTCGACCCGCAGTACCTGGACAGCAGCATCCAGATCCACGAAGGCTGGCGCTGGATGCACG > NC_002947/4662793‑4663084 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |