New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 323100 | 42 (0.740) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 9.9% | coding (1141/2070 nt) | PP_0267 | ferric siderophore receptor |
? | NC_002947 | = 323156 | 33 (0.620) | coding (1085/2070 nt) | PP_0267 | ferric siderophore receptor |
ATAAACCCCGCGGCTGTCGACCACGGTGTGGTTGTTGCTCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGCGTTGGCGGGTCAAGGTATTGGTGCCGGCGTTGTAGCCCGTGA > NC_002947/323011‑323300 | aTAAACCCCGCGGCTGTCGACCACGGTGTGGTTGTTGCTCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTcca > 7:76567‑M2/1‑146 (MQ=255) aCGGTGTGGTTGTTGCTCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGtt > 8:25278/1‑148 (MQ=255) tgtgGTTGTTGCTCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAgg < 2:91511/149‑1 (MQ=255) tgGTTGTTGCTCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGcc > 3:118764/1‑149 (MQ=255) gttgCTCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAg < 4:118764/148‑1 (MQ=255) cTCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTtgtg > 7:205462/1‑131 (MQ=255) cTCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTtgtg < 8:205462/131‑1 (MQ=255) tCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTc > 4:21675/1‑148 (MQ=255) gATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGaa < 3:21675/149‑1 (MQ=255) cGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGc > 1:360085/1‑149 (MQ=255) aaCGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTc < 6:72896/149‑1 (MQ=255) ggctggctGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGgttgtt < 5:281809/149‑1 (MQ=255) gctggGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGaa < 4:311738/147‑1 (MQ=255) ggTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAgg < 7:25278/147‑1 (MQ=255) gTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCACTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTg > 4:42897/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCggg > 4:147248/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCgg < 5:272278/148‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCACTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCgg < 3:42897/148‑1 (MQ=255) cccAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGgt > 7:223965/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTccaggcctgggcaaacccagccagccgcacaatggtacgttggcggtatcgagcaacaaccacaccgtggtcgacagccgcggg < 6:89260‑M2/149‑85 (MQ=255) cAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGgtgt > 4:157299/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCg < 5:149621/103‑1 (MQ=255) gCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCg > 6:149621/1‑103 (MQ=255) ccTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAg < 8:223965/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAgg > 3:152969/1‑149 (MQ=255) aGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTccaggcctgggcaaacccagccagccgcacaatggtacgtgggcggtatcgagcaacaaccacaccgtggtcgacagccgcggggtttatctg < 5:367773‑M2/148‑94 (MQ=255) tGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTccaggcctgggcaaacccagccagccgcacaatggtacgttggcggtatcgagcaacaaccacaccgtggtcgacagccgcggggtttatctgcagga > 5:89260‑M2/1‑49 (MQ=255) gCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGc > 6:217021/1‑149 (MQ=255) cgcTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGCGTTGGCgg < 5:217021/149‑1 (MQ=255) tGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAAt < 7:209643/107‑1 (MQ=255) tGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAAt > 8:209643/1‑107 (MQ=255) gTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGCGTTGGCGGGTc > 1:13218/1‑148 (MQ=255) taGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTAGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCACGGCCTCAAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCGAGCGTTGGCGGGtacagg > 4:288137/1‑144 (MQ=255) gcGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGCGTTGGCGGGTCAAGGTATTg < 2:360085/149‑1 (MQ=255) gccgcTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGCGTTGGc > 4:265375/1‑126 (MQ=255) gccgcTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGCGTTGGc < 3:265375/126‑1 (MQ=255) ccgcTGGTTGCCGAACTccaggcctgggcaaacccagccagccgcacaatggtacgttggcggtatcgagcaacaaccacaccgtggtcgacagccgcggggtttatctgcaggaccagattcgcctgaacgatcagtggcaggttctc > 6:367773‑M2/1‑17 (MQ=255) ccGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGCGTTGGCGGGTCAAGGTAt < 8:38512/127‑1 (MQ=255) gAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGCGTTGGCGGGTCAAGGTATTGGTGCCGGCGTTGTAGCCCGTGa > 2:121638/1‑149 (MQ=255) | ATAAACCCCGCGGCTGTCGACCACGGTGTGGTTGTTGCTCGATACCGCCAACGTACCATTGTGCGGCTGGCTGGGTTTGCCCAGGCCTGGCAGGCTCTGGCTGCCGGCGCTGTATAGCAGCGGATCGCGCCGCTGGTTGCCGAACTCCAGGCCCAGCAGCAGCTTGTGTTCAAGGCCCAAGGTGTCGAAGTCGCCCTCGGCCTCCAGGTTGTTGAATAGGTTGCGGGTGTTCAGGTCCTGCTGCCAGCGTTGGCGGGTCAAGGTATTGGTGCCGGCGTTGTAGCCCGTGA > NC_002947/323011‑323300 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |