New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1216043 = | 51 (0.900) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.7% | coding (916/4305 nt) | PP_1061 | ATP‑dependent DNA helicase |
? | NC_002947 | 1216078 = | 51 (0.940) | coding (881/4305 nt) | PP_1061 | ATP‑dependent DNA helicase |
AATGCCAAGCTCCAGCGATGCGGTCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAG > NC_002947/1215930‑1216226 | aaTGCCAAGCTCCAGCGATGCGGTCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCggg > 7:164757/1‑149 (MQ=255) aaTGCCAAGCTCCAGCGATGCGGTCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCggg > 7:159973/1‑149 (MQ=255) ccAAGCTCCAGCGATGCGGTCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGAt < 7:312384/149‑1 (MQ=255) gccattgatgtctggggcctggtgtatgaccgcttggccacccttgcccgtgaacaccgcaccacgctggtattcgtcaacacccggcgcctggccgaacgtatcacCCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATa > 2:183348‑M1/108‑148 (MQ=255) cAGCGATGCGGTCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCgg < 5:11830/149‑1 (MQ=255) aaGCGATGCGGTCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCgg < 2:241524/148‑1 (MQ=255) cGATGCGGTCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCa < 3:260163/149‑1 (MQ=255) gCGGTCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGTGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGgcg > 1:34818/1‑149 (MQ=255) tCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCgg < 8:341207/149‑1 (MQ=255) gCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGTGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGgt < 2:34818/149‑1 (MQ=255) tACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGgtgt > 6:359216/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAAt < 1:332530/149‑1 (MQ=255) cTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATa > 2:269927/1‑149 (MQ=255) cTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATa < 8:307144/149‑1 (MQ=255) gAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCa > 4:564/1‑149 (MQ=255) gCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCGGCGGTTTGGGCAGGCTGCGATGGGGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCGCAGCCGGTCGGTGAGGGGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CGGGGGGGTGGGGAGTGCGAGCgtgg > 8:334863/1‑149 (MQ=255) gCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCgtgg < 5:359216/149‑1 (MQ=255) cGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCgtggtg > 3:13386/1‑149 (MQ=255) ctctTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCg < 3:564/149‑1 (MQ=255) ttGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGa < 8:275299/130‑1 (MQ=255) ttGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGa > 7:275299/1‑130 (MQ=255) gAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCGTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGgt < 5:258593/146‑1 (MQ=255) aGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCa > 2:58248/1‑133 (MQ=255) aGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCa < 1:58248/133‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCgg < 3:249247/142‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCgg > 4:249247/1‑142 (MQ=255) ctCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGGCAGGCTGCCATGGGGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCaa < 6:248470/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCGCCCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGc < 1:269927/148‑1 (MQ=255) ggCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAg > 7:98264/1‑149 (MQ=255) gcAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCATTGCCCAGCCGGTCGCAGAGGTGGCGGGTGATAAGTTCGGCCAGGCG‑ACGGGTGTTGACGAATAACAGAGTGGTGACGTGTTCAAGGGCAAGGGTGGCCAAGCg > 6:244204/1‑148 (MQ=255) ggccaggctgccaggctgcGCGCCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCGGCGGCGGCGGGTGATACGCTCGGCCAGGCG‑CCGGGCGGTGACGAATCCCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATacac < 8:164757/144‑1 (MQ=255) ggACCGGCCGCCCAGGCGTCCGGCCACCGCCTCCCGGCCCAGCCGGTCGCTGCGGGGGCGGGTGACACGTACCGCCAGGCG‑CCGGGGGTCGCCGACTACCAGCGGGGGGCGGTGCGCCCGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGGCATacac < 8:159973/147‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGc < 5:244204/149‑1 (MQ=255) gCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGc < 7:235673/126‑1 (MQ=255) gCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGccc > 3:39880/1‑148 (MQ=255) gCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGccc > 1:82187/1‑148 (MQ=255) cTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGccc > 1:158709/1‑147 (MQ=255) gCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGa < 4:13386/149‑1 (MQ=255) cATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACa < 8:98264/149‑1 (MQ=255) tatcacccgccacctcagcgaccggctgggcaaggaggcggGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGc > 2:183348‑M2/42‑148 (MQ=255) cGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGATTACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAg < 1:33112/106‑1 (MQ=255) cGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAg > 2:33112/1‑106 (MQ=255) gCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCAt < 7:334863/149‑1 (MQ=255) aCCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCAc > 6:117770/1‑149 (MQ=255) ccgccacctcagcgaccggctgggcaaggaggcggGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGc < 3:270027‑M2/91‑1 (MQ=255) ccgccacctcagcgaccggctgggcaaggaggcggGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGc > 4:270027‑M2/36‑126 (MQ=255) CGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGCCGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCg < 1:244520‑M1/149‑1 (MQ=255) ctTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGcccc > 7:235660/1‑147 (MQ=255) ctTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGcccc > 2:78739/1‑147 (MQ=255) gCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGc < 4:39880/148‑1 (MQ=255) ccAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATAc < 4:225940/61‑1 (MQ=255) ccAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATAc > 3:225940/1‑61 (MQ=255) cAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTa < 1:78739/149‑1 (MQ=255) tCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACcggcgg < 2:82187/149‑1 (MQ=255) tGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACAt < 7:253295/111‑1 (MQ=255) tGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACAt > 8:253295/1‑111 (MQ=255) tGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCg < 5:83024/135‑1 (MQ=255) tGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCg > 6:83024/1‑135 (MQ=255) tGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACt > 6:161109/1‑149 (MQ=255) gTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATAGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAg > 7:269925/1‑149 (MQ=255) | AATGCCAAGCTCCAGCGATGCGGTCGCTACCAGCACCTGGAGCTGGCCGCTCTTGAGCCGCTGCTCCGCATCCAGGCGCAGCGCTTTGGACAGGCTGCCATGGTGTGCGGCAACCGCCTCCTTGCCCAGCCGGTCGCTGAGGTGGCGGGTGATACGTTCGGCCAGGCG‑CCGGGTGTTGACGAATACCAGCGTGGTGCGGTGTTCACGGGCAAGGGTGGCCAAGCGGTCATACACCAGGCCCCAGACATCAATGGCCATCACCGCCCCCAGCGGTACCGGCGGCACTTCGATGGCCAG > NC_002947/1215930‑1216226 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |