New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1695585 = | 45 (0.800) | 6 (0.110) | 4/240 | NT | 13.1% | coding (262/648 nt) | PP_1491 | CheW domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 1695623 = | 38 (0.720) | coding (300/648 nt) | PP_1491 | CheW domain‑containing protein |
GCGCTGGTGCAGGAGCACCAGGCTGCAGCGGTGCAGCCGGATGCGGAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACG > NC_002947/1695480‑1695766 | gcgcTGGTGCAGGAGCACCAGGCTGCAGCGGTGCAGCCGGATGCGGAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGcatt > 8:92746/1‑148 (MQ=255) gTGCAGGAGCACCAGGCTGCAGCGGTGCAGCCGGATGCGGAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGcc < 3:141784/149‑1 (MQ=255) cACCAGGCTGCAGCGGTGCAGCCGGATGCGGAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAgcg > 2:110667/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGCAGCGGTGCAGCCGGATGCGGAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCt < 6:144196/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGCAGCGGTGCAGGCGGATGCGGAAAACGCCGGTCGTTCGATGGTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑c > 6:93101/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGCAGCGGTGCAGCCGGATGCGGAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑c > 7:211246/1‑149 (MQ=255) gCCGGATGCGGAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACgggg > 2:292834/1‑149 (MQ=255) gCCGGATGCGGAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACgggg < 6:281633/149‑1 (MQ=255) ggAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATg > 5:186245/1‑149 (MQ=255) ggTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGc > 6:168908/1‑149 (MQ=255) gATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGgtgc > 3:34502/1‑149 (MQ=255) gATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGgtg < 6:89760/148‑1 (MQ=255) tgctgTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGgtgccgttc < 3:91633/149‑3 (MQ=255) ggctgTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCACCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGgtgccgtgc < 5:117900/148‑1 (MQ=255) ctgTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGgtgccgtgc < 5:93101/147‑1 (MQ=255) ttCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTc > 6:23292/1‑149 (MQ=255) tCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTgg < 5:168908/149‑1 (MQ=255) ggCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCt < 1:110667/147‑1 (MQ=255) ggCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGa > 6:183635/1‑149 (MQ=255) ggCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGa > 3:26582/1‑149 (MQ=255) gAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACtt > 2:207560/1‑149 (MQ=255) ggtggcgctgggTTCCGCCATGCGGGGCGCAATGGCCCCGTTGGATGCGGTGGATTCATTTCCGCACCAGCGGTCCGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCggg < 1:292834/147‑1 (MQ=255) gctggcgctggcTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCgggg > 5:298340/1‑149 (MQ=255) gctggcgctggcTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCggg < 8:213085/148‑1 (MQ=255) tggcgctggcTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTg > 5:360719/1‑149 (MQ=255) tggcgctggcTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTg > 6:131645/1‑149 (MQ=255) ggcgctggcTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTAc < 7:151750/101‑1 (MQ=255) ggcgctggcTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTAc > 8:151750/1‑101 (MQ=255) tACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCt > 5:230599/1‑149 (MQ=255) tACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CACGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCt > 4:207220/1‑149 (MQ=255) accgcctgcaacggggcgatttcggccaggcaggcggtGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGcc < 6:155136‑M2/106‑1 (MQ=255) accgcctgcaacggggcgatttcggccaggcaggcggtGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGcc > 5:155136‑M2/39‑144 (MQ=255) ACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTc < 1:64684‑M1/149‑1 (MQ=255) ACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTc < 7:243547‑M1/149‑1 (MQ=255) ccgcctgcaacggggcgatttcggccaggcaggcggtGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGgtgccgtgc < 8:153024‑M2/73‑1 (MQ=255) ccgcctgcaacggggcgatttcggccaggcaggcggtGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGgtgccgtgc < 8:109341‑M2/73‑1 (MQ=255) ccgcctgcaacggggcgatttcggccaggcaggcggtGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGgtgccgtgc > 7:109341‑M2/38‑110 (MQ=255) ccgcctgcaacggggcgatttcggccaggcaggcggtGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGgtgccgtgc > 7:153024‑M2/38‑110 (MQ=255) CCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTc > 4:26582‑M1/1‑148 (MQ=255) GCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCAc < 5:74069‑M1/149‑1 (MQ=255) CCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGc > 3:62338‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCaa < 5:23292/147‑1 (MQ=255) ccGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGc < 8:211246/149‑1 (MQ=255) cGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCa < 6:230599/149‑1 (MQ=255) aTCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTACTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAgcg > 6:63858/1‑148 (MQ=255) tCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGc < 1:158661/138‑1 (MQ=255) tCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGc > 2:158661/1‑138 (MQ=255) gCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACg > 5:267052/1‑149 (MQ=255) cccGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTg < 6:32446/97‑1 (MQ=255) cccGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTg > 5:32446/1‑97 (MQ=255) ccGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGc > 8:71873/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGAt < 7:92746/149‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGAt < 6:298340/149‑1 (MQ=255) aggcggtGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCa > 6:4805‑M2/8‑149 (MQ=255) ggcggtGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCAc > 8:338799‑M2/7‑149 (MQ=255) gcggtGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACg > 7:72164‑M2/6‑149 (MQ=255) | GCGCTGGTGCAGGAGCACCAGGCTGCAGCGGTGCAGCCGGATGCGGAAAACACCGGTCGTTCGATGCTGCTGTTCCGTCTGGGCGAAGAGTGGCTGGCGCTGGCTACCGCCTGCCTGGCCGAAATCGCCCCGTTGCAGGCGGTGCATTCATTGCCGCACCAGCGCT‑CGCGGCTGCTGCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACG > NC_002947/1695480‑1695766 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |