New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2684792 | 49 (0.870) | 4 (0.080) | 3/236 | NT | 7.5% | coding (91/243 nt) | PP_5520 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2684822 | 54 (1.040) | coding (61/243 nt) | PP_5520 | hypothetical protein |
ACTTCACCGCCAGGCGACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTGTGTTGAAGCGAGGCGGGCGGAAACCGA > NC_002947/2684675‑2684967 | aCTTCACCGCCAGGCGACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACGCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGc < 5:308921‑M2/149‑2 (MQ=255) ttCACCGCCAGGCGACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGctg < 5:235751‑M2/149‑4 (MQ=255) ccGCCAGGCGACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGctgctgg > 8:295933‑M2/1‑142 (MQ=255) ccGCCAGGCGACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGctgctg < 8:122937‑M2/148‑7 (MQ=255) cGCCAGGCGACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGctgctgga < 2:223304‑M2/149‑9 (MQ=255) cGCCAGGCGACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGctgctgga > 2:192910‑M2/1‑141 (MQ=255) ggCGACGTTCCTTGAGGTGGCGCATGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑tt < 6:164707/149‑1 (MQ=255) cGACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTc < 8:271774/149‑1 (MQ=255) gACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTcg > 8:164066/1‑149 (MQ=255) aCGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTcgc < 6:235751/149‑1 (MQ=255) cTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑Cggg > 3:247829/1‑148 (MQ=255) gAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGTG‑CGGGTa < 5:181313/147‑1 (MQ=255) ggTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTg > 5:262021/1‑148 (MQ=255) ggTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTg > 5:270814/1‑148 (MQ=255) tGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAg < 2:3804/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGt > 5:79356/1‑149 (MQ=255) gcAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTcc > 8:204621/1‑149 (MQ=255) gtcgACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAgg < 7:164066/148‑1 (MQ=255) gacgaAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGt > 3:84287/1‑149 (MQ=255) gaAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTgag < 7:122937/149‑1 (MQ=255) aCCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACa < 4:84287/148‑1 (MQ=255) ccGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATg < 6:313000/149‑1 (MQ=255) atatCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATgggg < 6:270814/149‑1 (MQ=255) tctCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGTTGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATtggg < 6:308921/146‑1 (MQ=255) gATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGtcct > 8:195672/1‑148 (MQ=255) aTTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGtcctcc > 1:360047/1‑149 (MQ=255) ttCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTcctcct < 3:51353/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGGCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGTCATGGGGTCCTCCTTg < 6:262021/148‑1 (MQ=255) gCAGCCTGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTGGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGATGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGTTAGAGGTCGTgag < 3:296538/124‑1 (MQ=255) gCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGTTCGGGGAGGTTCGCGAGGGGTAGTGAAGGTCAAGTTAAAGGGCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCGTCCTTg > 1:296736/1‑149 (MQ=255) gCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCAACCACGCGATCCAGCGCCTTGACCTGCTGGCGGCCCAGCTGGAAGA‑TTACGCG‑CGGGTAGTGCAGGTACAGGTAGAGGTCGTgag > 4:296538/1‑124 (MQ=255) cagcACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTGCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTga > 7:175348/1‑118 (MQ=255) cagcACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTGCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTga < 8:175348/118‑1 (MQ=255) cACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTcaatgcaa < 5:10575/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTcaatgcaat > 8:64530/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATgg > 8:8854/1‑149 (MQ=255) tCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTAc < 7:64530/148‑1 (MQ=255) tCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTg > 2:337692/1‑149 (MQ=255) cACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTgg > 5:142525/1‑148 (MQ=255) tCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCg > 4:175518/1‑148 (MQ=255) gTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGctgctggacgagtacgtggacatcgacaaccaggtgctggctgccgaatcgatatcggccggtaacttcgtcgacgaagacctgcgccacctcaaggaacgtcgcctggc < 3:208719‑M2/149‑111 (MQ=255) gTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGctgctggacgagtacgtggacatcgacaaccaggtgctggctgccgaatcgatatcggccggtaacttcgtcgacgaagacctgcgccacctcaaggaacgtcgcctggc < 7:160376‑M2/149‑111 (MQ=255) gTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATg > 6:45717/1‑100 (MQ=255) gTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGaa > 4:342461/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCAGGCGATCCAGAGCCTTGTCGTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGaa > 6:10709/1‑149 (MQ=255) cagcagGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGctgctggacgagtacgtggacatcgacaaccaggtgctggctgccgaatcgatatcggccggtaacttc < 4:280647‑M2/105‑70 (MQ=255) cagcagGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGctgctggacgagtacgtggacatcgacaaccaggtgctggctgccgaatcgatatcggccggtaacttc > 3:280647‑M2/1‑36 (MQ=255) agcagGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTcaatgcaat < 5:315749/119‑1 (MQ=255) agcagGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTcaatgcaat > 6:315749/1‑119 (MQ=255) agcagGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCg < 7:295582/149‑1 (MQ=255) agGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGGATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGAtt < 2:296736/149‑1 (MQ=255) agGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGAtt < 7:101775/149‑1 (MQ=255) agGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGAtt < 4:247829/149‑1 (MQ=255) ggCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTGGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATtg > 1:252259/1‑149 (MQ=255) gCGATCCATCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGATGGACGA‑TTTTGCG‑CGGGTTGTTCATTTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCTTCCTTTGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAATTGTGGAATGTGATtgt < 8:53662/149‑1 (MQ=255) cGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTTGTAAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATtgtg < 7:195672/149‑1 (MQ=255) cGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATtgtg < 6:79356/149‑1 (MQ=255) gATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTgtgt < 2:252259/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCGGATTGGAAGTGCGGAATGCGAGTGGGTTg > 2:329676/1‑148 (MQ=255) gcgcCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTGTGTTGAAGc < 4:245124/149‑1 (MQ=255) cgcCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCATGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTGTGTTGAAGCg < 1:198345/149‑1 (MQ=255) gTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTGTGTTGAAGCGAggc < 6:142525/147‑1 (MQ=255) ctgctgGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTGTGTTGAAGCGAggcgggc < 2:360047/148‑1 (MQ=255) cagcggcgCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTGTGTTGAAGCGAGGCGGGCGGaaa > 5:195914/3‑149 (MQ=255) gcggcgCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATggg > 2:121365/1‑69 (MQ=255) gcggcgCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATggg < 1:121365/69‑1 (MQ=255) gcggcgCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTGTGTTGAAGCGAGGCGGGCGGAAAc < 7:204621/148‑1 (MQ=255) ggcgCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTGTGTTGAAGCGAGGCGGGCGGAAACCga < 1:337692/149‑1 (MQ=255) gctgctGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTcaa > 8:338569/1‑79 (MQ=255) gctgctGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTcaa < 7:338569/79‑1 (MQ=255) | ACTTCACCGCCAGGCGACGTTCCTTGAGGTGGCGCAGGTCTTCGTCGACGAAGTTACCGGCCGATATCGATTCGGCAGCCAGCACCTGGTTGTCGATGTCCACGTACTCGTCCAGCAGGCGATCCAGCGCCTTGTCCTGCTGGCGGCGCTGCTGGACGA‑TTTCGCG‑CGGGTAGTGCAGGTCCTGGTAGAGGTCGTGAGAGACAGGCATGGGGTCCTCCTTGGTCAATGCAATGGGCTTACCTGATTGGAAGTGCGGAATGCGATTGTGTTGAAGCGAGGCGGGCGGAAACCGA > NC_002947/2684675‑2684967 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |