New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2824669 | 50 (0.880) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 7.9% | coding (282/2193 nt) | PP_2478 | isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit beta |
? | NC_002947 | = 2824719 | 46 (0.860) | coding (332/2193 nt) | PP_2478 | isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit beta |
TCCGCATTGGCCCCGATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAGGCGGCTGCTCTGCAATGGCGCGT > NC_002947/2824575‑2824863 | tCCGCATTGGCCACGCTGGCGGGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCCGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCAGTAGGGGCGCCGAGGAGCGGTCAGGGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAActcg > 5:98404‑M2/1‑145 (MQ=255) ccGCATTGGCCCCGATGGCGTGGTCACGGTGAACTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGCGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAActcgg < 5:202231‑M2/149‑6 (MQ=255) cGCATTGGCCCCGATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAActcggc > 7:287163‑M2/1‑143 (MQ=255) aTTGGCCCCGATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCt < 4:39666/149‑1 (MQ=255) ttGGCCCCGATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACGGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTg < 2:294219/149‑1 (MQ=255) ttGGCCCCGATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTg < 8:146118/149‑1 (MQ=255) ccccGATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGCTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGtata > 2:8760/1‑149 (MQ=255) cGATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAActcg < 2:76803‑M2/136‑5 (MQ=255) cGATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAActcg > 1:76803‑M2/1‑132 (MQ=255) cGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGcc > 5:317824/1‑149 (MQ=255) cACGGGGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATg > 8:202414/1‑148 (MQ=255) aCGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATg > 3:216817/1‑147 (MQ=255) cGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAg < 8:83889/149‑1 (MQ=255) gTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGtt > 7:17999/1‑149 (MQ=255) aTCTCGCCTAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTTTTGCCATGATGGTCGCAGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGACACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTc < 2:316428/148‑1 (MQ=255) ctcGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCGGGAGCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCCCCGAACTCGGCGCTGTATACCGCCAGCCTGATGCAGTGTCAgg > 4:65070/1‑149 (MQ=255) ccGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTTGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑c > 6:106751/1‑149 (MQ=255) cGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑cc > 2:250037/1‑149 (MQ=255) aaaTGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTc < 1:8760/148‑1 (MQ=255) aaaTGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTc > 1:299356/1‑148 (MQ=255) aaTGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGa > 3:84600/1‑149 (MQ=255) tGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACt < 6:317824/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTAc > 5:180366/1‑149 (MQ=255) aCCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTg < 6:180366/149‑1 (MQ=255) ccGGTATTGCCATGATGGTTGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTgg < 5:106751/149‑1 (MQ=255) ggTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGa < 4:216817/149‑1 (MQ=255) gCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCt > 8:278577/1‑149 (MQ=255) cATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGc < 7:278577/149‑1 (MQ=255) cATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGc > 1:91540/1‑149 (MQ=255) tgatgGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCgtgt > 3:2961/1‑130 (MQ=255) tgatgGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCgtgt < 4:2961/130‑1 (MQ=255) gatgGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTc > 1:349588/1‑149 (MQ=255) atgGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCACCCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTc < 1:250037/149‑1 (MQ=255) atgGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTCGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTCAAGAACTTTCAGGCCA‑CCGCTGGTTCGACTTCTACTCGTGATACCTGGGAGCCGCTGCGTcg > 1:146900/1‑149 (MQ=255) gTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTcgggc > 7:4589/1‑149 (MQ=255) cGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAActcggcgaccatcatggcaataccggtttgcgcaccctggcccatttcaattttcggcgagatcaccgtgac > 6:351667‑M2/1‑57 (MQ=255) cGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAActcggcgaccatcatggcaataccggtttgcgcaccctggcccatttcaattttcggcgagatcaccgtgac < 5:351667‑M2/129‑73 (MQ=255) cGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTcgggcgg > 2:155650/1‑149 (MQ=255) gCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAActcggcgaccatcatggcaataccggtttgcgcaccctggcccatttcaattttcggcgagatcaccgtgaccacgccatcggggccaatgcg < 5:97251‑M2/149‑94 (MQ=255) cTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCTGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGgc > 2:298614/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCAACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGgc > 2:179740/1‑149 (MQ=255) gAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGgcgc < 2:91540/148‑1 (MQ=255) aaGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGgcgcgc < 3:132724/149‑1 (MQ=255) ccccTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCt < 2:349588/149‑1 (MQ=255) cccTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCTGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTg < 1:298614/149‑1 (MQ=255) gATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTg < 1:155650/147‑1 (MQ=255) ggtggtGATCCAGGAAGCGCCACCGAActcggcgaccatcatggcaataccggtttgcgcaccctggcccatttcaattttcggcgagatcaccgtgaccacgccatcggggccaatgcggacaaaggcaccgtaaccctccgcggagt > 6:97251‑M2/1‑27 (MQ=255) ggtggtGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAgg < 8:4589/149‑1 (MQ=255) gtggtgATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGa < 3:180175/142‑1 (MQ=255) gtggtgATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAggc > 1:348279/1‑149 (MQ=255) gtggtgATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAggc < 4:84600/149‑1 (MQ=255) tggtgATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAggcg < 8:17999/149‑1 (MQ=255) ggtgATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCt > 1:312842/1‑105 (MQ=255) ggtgATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCt < 2:312842/105‑1 (MQ=255) gATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAGGCGgctg > 6:326880/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAGGCGGCTGctct > 2:39810/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAGGCGGCTGctct < 2:348279/149‑1 (MQ=255) cACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAGGCGGCTGCTCTGCAATGgcgc > 5:321016/1‑149 (MQ=255) ccGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAGGCGGCTGCTCTGCAATGGCGCGt < 7:202414/149‑1 (MQ=255) | TCCGCATTGGCCCCGATGGCGTGGTCACGGTGATCTCGCCGAAAATTGAAATGGGCCAGGGTGCGCAAACCGGTATTGCCATGATGGTCGCCGAGGAGCTGGAAGTGCCCCTGGATCAGGTGGTGATCCAGGAAGCGCCACCGAACTCGGCGCTGTATACCGACAGCCTGATGCAGTTTCAGGCCA‑CCGGTGGTTCGACTTCTACTCGTGTTACCTGGGAGCCGCTGCGTCGGGCGGGCGCTACGGCGCGCATCCTGTTGATCCAGGCGGCTGCTCTGCAATGGCGCGT > NC_002947/2824575‑2824863 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |