New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4119614 | 43 (0.760) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 6.5% | coding (30/1344 nt) | adhB | alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit |
? | NC_002947 | = 4119653 | 44 (0.800) | coding (69/1344 nt) | adhB | alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit |
GCGCAGCTCACTGGCCAGCGCGTGCGCAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGACTGCGTGGCCTGCCATAGCCTGCCGGGTGGCAAACCGTTC > NC_002947/4119507‑4119800 | gcgcAGCTCACTGGCCAGCGCGTGCGCAGTATGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGgc < 2:319797‑M2/149‑3 (MQ=255) aGCTCACTGGCCAGCGCGTGCGCAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTgg < 3:215697/149‑1 (MQ=255) gCTCACTGGCCAGCGCGTGCGCAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTgg > 8:91459/1‑148 (MQ=255) tCACTGGCCAGCGCGTGCGCAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTAt > 8:47236/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCAGCGCGTGCGTAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATg > 4:2603/1‑148 (MQ=255) aCTGGCCAGCGCGTGCGCAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTAt < 7:91459/147‑1 (MQ=255) aGCGCGTGCGGAGTTTGCCATTGAGCCTCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGt < 8:97178/149‑1 (MQ=255) cgcAGTTTGCCATTGAGCCTCCACCCATTCAGCTGAACGCACAACGGACGACTCCTGACCCATCGTTTCGCAACAACCCCTGGCTGGCTGCCGCTGAAGTGCC‑TCGTCGCGGCGGGCCAGCACGCCTGGAATGACACCCGAGAACCCg > 8:229748/1‑148 (MQ=255) cgcAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTAt < 8:24774/132‑1 (MQ=255) cgcAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTAt > 7:24774/1‑132 (MQ=255) gcAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCa < 3:278475/149‑1 (MQ=255) cATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGACTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGttt < 2:241457/149‑1 (MQ=255) aTTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGACCCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCCCCCGTGAACCCGCCTCGCCGttgt > 5:93429/1‑147 (MQ=255) aTTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTg < 4:169857/149‑1 (MQ=255) gAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGcc > 4:321828/1‑148 (MQ=255) agccACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGc < 7:229748/148‑1 (MQ=255) ccACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGca > 2:167856/1‑148 (MQ=255) acacCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAg < 3:2603/149‑1 (MQ=255) acacCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAg > 3:60121/1‑149 (MQ=255) cTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCa > 2:145613/1‑149 (MQ=255) cTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCa > 4:255431/1‑149 (MQ=255) tGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACtgctgc > 2:19892/1‑149 (MQ=255) acaAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCCGGGGTACCGGCGGGCCAGCTGGCCTGGTATGTCCCCCGTGAACCCCCAACCCCGTTTGCCGACCCACAGGCCACTGCTGCCGAccc > 1:107342/1‑149 (MQ=255) gggACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGgcgc > 5:31055/1‑149 (MQ=255) gACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCcgcg > 3:57649/1‑149 (MQ=255) ccATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCgcggc > 6:121151/1‑148 (MQ=255) cATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGa < 4:60121/149‑1 (MQ=255) aTCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGaa < 1:306805/149‑1 (MQ=255) aTCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGaa > 7:185/1‑149 (MQ=255) tttCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACg > 3:289835/1‑149 (MQ=255) ttCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGcac < 8:30559/103‑1 (MQ=255) ttCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGcac > 7:30559/1‑103 (MQ=255) aaGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGccc > 2:207698/1‑149 (MQ=255) aGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCg < 2:107342/149‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGc < 1:19892/149‑1 (MQ=255) ctggctggctggCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGt < 1:319797/149‑1 (MQ=255) tggctggctggcGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGgccagcggttcttgcgaaacgatgggtcatgaggcgtcccttgtgcgatcagctgaaggtgtggcggctcaatggcaaactgcgcacgcgctggccagtgagctgc < 2:314398‑M2/149‑107 (MQ=255) ggctggctggcGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGgccagcgggttcttgcgaaacgatgggtcatgaggcgtcccttgtgcgatcagctgaaggtgtggcggctcaatggcaaactgcgcacgcgctggccagtgagctgc < 1:265086‑M2/149‑108 (MQ=255) gctggctggcGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGAc < 6:31055/149‑1 (MQ=255) gctggcGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGACTGc < 4:57649/148‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGACTGCGTgg < 4:289835/148‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGACTGCGTg < 7:47236/147‑1 (MQ=255) cgcTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGgccagcggttcttgcgaaacgatgggtcatgaggcgtcccttgtgcgatcagctgaaggtgtggcggctcaatggcaaactgcgcacgcgctggccagtgagctgcgcgaccgcgtt > 1:314398‑M2/1‑32 (MQ=255) ccGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGACTGCGTGGCCTGcc < 5:121151/148‑1 (MQ=255) gTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGt > 7:65812/1‑130 (MQ=255) gTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGt < 8:65812/130‑1 (MQ=255) gTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGACTGCGTGGCCTGCCa > 1:338931/1‑147 (MQ=255) cc‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTc < 6:367454/124‑1 (MQ=255) cc‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTc > 5:367454/1‑124 (MQ=255) cggcggGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGACTGCGTGGCCTGCCATAGCCTGCCGGGt < 1:167856/149‑1 (MQ=255) tgGCCTGGTATGTCGCCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGACTGCGTGGCCTGCCATAGCCTGCCGGGTGGCAAACCGTTc > 2:330417/1‑149 (MQ=255) | GCGCAGCTCACTGGCCAGCGCGTGCGCAGTTTGCCATTGAGCCGCCACACCTTCAGCTGATCGCACAAGGGACGCCTCATGACCCATCGTTTCGCAAGAACCGCTGGCTGGCTGGCGCTGCCGTGCC‑TGGTCGCGGCGGGCCTGCTGGCCTGGTATGTCACCCGTGAACCCGCATCGCCGTTTGCCGACGCACAGGCCACTGCTGCCGACCCGGCGCTGGTCAGCCGCGGCGAATACGTCGCCCGGCTCAGTGACTGCGTGGCCTGCCATAGCCTGCCGGGTGGCAAACCGTTC > NC_002947/4119507‑4119800 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |