New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4637861 | 45 (0.800) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 6.3% | coding (577/1617 nt) | PP_4103 | low‑affinity inorganic phosphate transporter |
? | NC_002947 | = 4637911 | 45 (0.820) | coding (627/1617 nt) | PP_4103 | low‑affinity inorganic phosphate transporter |
CTTGGCACTTGGTGGCTGGGCCTGCCGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGCCACCGTGGTGGATCCGCAGCCTACTGATT > NC_002947/4637765‑4638055 | cTTGGCACTTGGTGGCTGGGCCTGCCGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATgc < 2:215578‑M2/149‑3 (MQ=255) cTTGGCACTTGGTGGCTGGGCCTGCCGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATgc < 3:248710‑M2/149‑3 (MQ=255) aCTTGGTGGCTGGGCCTGCCGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCctgct < 5:218315/149‑1 (MQ=255) tggCTGGGCCTGCCGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTtct > 2:298068/1‑148 (MQ=255) gCTGGGCCTGCCGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCAc > 6:315063/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGa < 1:298068/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGa < 3:169648/149‑1 (MQ=255) ccGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTgg < 1:215578/149‑1 (MQ=255) cATCGTCCTCGCACACCCTCATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGGCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGtttt < 2:305950/149‑1 (MQ=255) cTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTttgcttgc < 7:236240/148‑1 (MQ=255) cTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTgcg > 2:39696/1‑149 (MQ=255) acCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCt < 3:8835/149‑1 (MQ=255) ccTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTttgcttgc > 8:221499/1‑139 (MQ=255) ccTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTttgcttgc < 7:221499/139‑1 (MQ=255) ccTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGt > 4:29688/1‑149 (MQ=255) gCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGctgctg > 8:82641/1‑149 (MQ=255) gATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGcc < 5:315063/148‑1 (MQ=255) catcGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTgc < 4:116452/149‑1 (MQ=255) tgggcgtggCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTg < 4:248710/149‑1 (MQ=255) gggcgtggCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTgg > 5:117414/1‑149 (MQ=255) gcgtggCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTc < 3:103534/149‑1 (MQ=255) ggCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAAc > 5:150389/1‑149 (MQ=255) gCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTgcg < 8:13985/109‑1 (MQ=255) gCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTgcg > 7:13985/1‑109 (MQ=255) aaTGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGc > 2:48400/1‑147 (MQ=255) aaTGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGc > 2:214481/1‑147 (MQ=255) cATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCa < 6:117414/149‑1 (MQ=255) aTGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATgcccatgcatcagcgcattggccacgcccacgccgatgatcgagccaatcagggtgtgcgaggacgatgccggcaggcccagccaccaagtgc < 6:157797‑M2/149‑94 (MQ=255) tGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCa < 2:76305/147‑1 (MQ=255) tGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCa > 1:76305/1‑147 (MQ=255) ggCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGc < 1:39696/148‑1 (MQ=255) gTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATgcccatgcatcagcgcattggccacgcccacgccgatgatcgagccaatcagggtgtgcgaggacgatgccggcaggcccagccaccaagtgccaaggt < 6:321028‑M2/149‑100 (MQ=255) gCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGc < 7:82641/149‑1 (MQ=255) gCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGc > 5:74601/1‑149 (MQ=255) cACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATgcccatgcatcagcgcattggccacgcccacgccgatgatcgagccaatcagggtgtgcgaggacgatgccggcaggcccagccaccaagtgccaaggttccagat > 5:321028‑M2/1‑43 (MQ=255) cACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGc > 3:34954/1‑148 (MQ=255) aCCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCa > 7:191470/1‑149 (MQ=255) aCCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGATGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCa < 4:258342/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTACGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGa > 6:66296/1‑149 (MQ=255) cggcgTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGacac < 1:48400/149‑1 (MQ=255) cgTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGc < 1:214481/149‑1 (MQ=255) gTGGACTGGG‑‑CAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGCCAc > 4:46965/1‑149 (MQ=255) tGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGCCa > 8:38634/1‑149 (MQ=255) aCTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCa > 2:255756/1‑136 (MQ=255) aCTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCa < 1:255756/136‑1 (MQ=255) tGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAg < 7:338167/108‑1 (MQ=255) tGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAg > 8:338167/1‑108 (MQ=255) ggCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGCCACCgtggt < 3:29688/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGCCACCGTGGTGGa > 1:23655/1‑149 (MQ=255) gCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGCCACCGTGGTGGATCCg > 4:91770/1‑149 (MQ=255) cAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGCCACCGTGGTGGATCCg > 2:41725/1‑147 (MQ=255) gTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGCCACCGTGGTGGATCCGCAGCCTACTGAtt < 7:38634/149‑1 (MQ=255) ttATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAgg < 6:68898/98‑1 (MQ=255) ttATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAgg > 5:68898/1‑98 (MQ=255) | CTTGGCACTTGGTGGCTGGGCCTGCCGGCATCGTCCTCGCACACCCTGATTGGCTCGATCATCGGCGTGGGCGTGGCCAATGCGCTGATGCATGGGCGTGACGGCACCAGCGGCGTGGACTGGGCCCAGGCCAGCAAGGTGGGTTATGCCCTGCTGTTCTCACCGCTGATTGGTTTTGCTTGCGCAGCCCTGTTGCTGCTGGCCCTGCGCGCGCTGGTCAAACGCAAGGCGCTGTACCAGGCACCGGAAGGCCAGACACCGCCACCGTGGTGGATCCGCAGCCTACTGATT > NC_002947/4637765‑4638055 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |