Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,340,602 | T→C | 5.7% | C151R (TGC→CGC) ‡ | folK → | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,340,602 | 0 | T | C | 5.7% | 207.4 / 2.4 | 70 | C151R (TGC→CGC) ‡ | folK | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/36); new base C (2/2); total (32/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
GTGACCAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCC > NC_002947/5340456‑5340745 | gTGACCAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGc < 6:240141/149‑1 (MQ=255) tGACCAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGCATGcc > 3:42408/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGtt > 5:243433/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGtt > 5:191298/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGtt > 2:331802/1‑149 (MQ=255) tGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtcgtc < 2:165474/149‑1 (MQ=255) gCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtcgtcg > 4:297256/1‑149 (MQ=255) cTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATCCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtcgtcg < 6:24211/148‑1 (MQ=255) tCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtcgtcg > 3:132456/1‑147 (MQ=255) tCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTtcgtcg < 4:132456/147‑1 (MQ=255) gACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCt > 3:180170/1‑149 (MQ=255) ccAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTgg < 8:2300/149‑1 (MQ=255) aGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGaa < 2:228158/149‑1 (MQ=255) gCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAAc > 3:243512/1‑149 (MQ=255) ccACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGAT‑GCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGCACGc > 7:285866/1‑149 (MQ=255) aCGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGcc < 7:114407/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGcc < 4:243512/149‑1 (MQ=255) cGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCt < 2:223127/149‑1 (MQ=255) cGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCt < 1:324763/149‑1 (MQ=255) aaaGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAg < 6:191298/147‑1 (MQ=255) tGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCggg < 2:39545/149‑1 (MQ=255) ccGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTg > 7:119633/1‑138 (MQ=255) ccGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTg < 8:119633/138‑1 (MQ=255) cATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTc < 4:180170/149‑1 (MQ=255) cATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTc > 3:332110/1‑149 (MQ=255) ccACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGcc < 2:252798/149‑1 (MQ=255) ccACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGc > 6:235922/1‑148 (MQ=255) atgcatgcCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCa > 2:37098/1‑149 (MQ=255) catgcCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATc < 2:133720/148‑1 (MQ=255) cccgcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCAc > 2:98901/1‑149 (MQ=255) cgcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCt > 3:225114/1‑149 (MQ=255) cgcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAACGGGCATtcgtc > 7:60552/1‑102 (MQ=255) cgcccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAACGGGCATtcgtc < 8:60552/102‑1 (MQ=255) cccgTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCg < 7:117045/149‑1 (MQ=255) gCTGGATCCGCTGGCCGAACTGGGACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCa < 8:159488/149‑1 (MQ=255) tGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAAc < 6:337639/143‑1 (MQ=255) tGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGATCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAAc > 5:337639/1‑143 (MQ=255) tATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGcc > 6:5235/1‑91 (MQ=255) tATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGcc < 5:5235/91‑1 (MQ=255) aTCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTaag > 5:227721/1‑148 (MQ=255) cGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACAcc < 2:180566/149‑1 (MQ=255) gCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑a < 1:331802/148‑1 (MQ=255) ccGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATc < 1:37098/149‑1 (MQ=255) gAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGt < 3:297256/149‑1 (MQ=255) aaCTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTa < 4:161972/149‑1 (MQ=255) aCTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTaa < 1:186935/149‑1 (MQ=255) gTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGAT‑GCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAAt < 8:285866/148‑1 (MQ=255) aCCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGt < 7:121878/118‑1 (MQ=255) aCCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGt > 8:121878/1‑118 (MQ=255) ttCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAggg > 6:226020/1‑149 (MQ=255) tCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGt > 4:333298/1‑149 (MQ=255) ccTGTCCGATTGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGAtt < 8:128087/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCAGTAACAGGGTGAtt < 4:332110/149‑1 (MQ=255) gCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACt < 4:225114/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTccc < 4:9547/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCca > 4:224458/1‑149 (MQ=255) cccTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGCCCTGGAACGCCAGTAGACCCGGCGGGACACCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑AACATAACAAAGCGGTAAAAGGCTGATTGACTTCCCAAACCtagg > 4:37413/1‑146 (MQ=255) cTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGGTTGACTTCCCACACCTCGCt > 5:225864/1‑148 (MQ=255) tCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGCCCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCa > 1:218171/1‑149 (MQ=255) gCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACCCCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCtaccg > 4:160854/1‑145 (MQ=255) gCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCAc < 5:235922/148‑1 (MQ=255) aCTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACta > 3:14784/1‑148 (MQ=255) cTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGGTTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACtata < 6:225864/149‑1 (MQ=255) gCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAgg > 8:156117/1‑149 (MQ=255) cTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTGCTTCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAg < 1:98901/148‑1 (MQ=255) cTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAg < 3:224458/147‑1 (MQ=255) cgacgaACGGGCATTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGa > 7:49388/1‑139 (MQ=255) cgacgaACGGGCATTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGa < 8:49388/139‑1 (MQ=255) gacgaATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAAAACCCTG‑ATCGTAAAAATGAGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTc > 2:291454/1‑149 (MQ=255) acgaATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCCCTCACGACTATAGGCGTcc > 7:89190/1‑149 (MQ=255) | GTGACCAGGTGCTCGACCAGCCACGCCTGAAAGTGCCGCATTACCACATGCATGCCCGCCCGTTCGTGCTGTATCCGTTGGCCGAACTGGTACCGGGGGATTTCCGCCTGGCCGATGGCCGCGCCCTCGCACAACTGCTCGACGAATGCCCGTTCGTCGGCCTGGAACGCCTGTAGACCGGGCGTTCCAGCCTGCATCGCCACCTCGGTAACGCCAGTAACACCCTG‑ATCGTAACAATGCGGTAACAGGGTGATTGACTTCCCACACCTCGCTCACGACTATAGGCGTCC > NC_002947/5340456‑5340745 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |