| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,530,631 | A→G | 5.6% | L113P (CTG→CCG) | braF ← | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,530,631 | 0 | A | G | 5.6% | 208.2 / 2.4 | 71 | L113P (CTG→CCG) | braF | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/35); new base G (2/2); total (34/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.85e-01 | |||||||||||
CATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGGTGTGGCTGCCGCGCACGTTCAGTT > NC_002947/5530488‑5530778 | cATCGCTGTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCAAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCg < 8:154738/149‑1 (MQ=255) aTCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCgg > 2:73132/1‑149 (MQ=255) tCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGgc > 3:250630/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCGGCCTGGcgcgc < 7:338722/148‑2 (MQ=255) ttCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCGGCCTGGcgcg > 8:338722/1‑147 (MQ=255) cGGCCTTGCGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCGGCCTGGcgcgcac < 5:135188/148‑4 (MQ=255) ggCCTTGCGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGa < 4:166528/149‑1 (MQ=255) cGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGt < 7:279558/148‑1 (MQ=255) ggTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTgg > 3:183260/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACGACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGt < 3:226563/131‑1 (MQ=255) cTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGt > 4:226563/1‑131 (MQ=255) cTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTggtacccac < 5:43578/149‑8 (MQ=255) cTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTaccac > 7:180762/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTaccac > 3:253335/1‑149 (MQ=255) tgtTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTaccac > 6:121651/1‑144 (MQ=255) tgtTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTaccac < 5:121651/144‑1 (MQ=255) ttGAGCACCCCGGCCAGTAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGtt < 5:321943/125‑1 (MQ=255) ttGAGCACCCCGGCCAGTAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGtt > 6:321943/1‑125 (MQ=255) ttGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACAt < 8:153075/149‑1 (MQ=255) gAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGCAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATc < 8:192387/148‑1 (MQ=255) gCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTg > 3:142481/1‑149 (MQ=255) accaaggCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTgta < 3:105341/144‑1 (MQ=255) aCCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTgta < 8:180762/149‑1 (MQ=255) aCCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTg > 6:69985/1‑147 (MQ=255) ccccGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTgtag > 4:205853/1‑149 (MQ=255) ccccGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTgtag < 1:73132/149‑1 (MQ=255) cccGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTgtag > 7:128629/1‑148 (MQ=255) cGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTAc < 4:142481/149‑1 (MQ=255) aGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAATATCTTGTAGTACATACGGTTg < 5:343648/149‑1 (MQ=255) gTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTgg < 4:183260/149‑1 (MQ=255) tGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTgta > 3:80804/1‑127 (MQ=255) tGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTgta < 4:80804/127‑1 (MQ=255) acacacaTGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAgcgcg < 8:145673/145‑1 (MQ=255) cccACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCa < 8:128629/149‑1 (MQ=255) ccACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTgg < 5:336382/137‑1 (MQ=255) ccACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTgg > 6:336382/1‑137 (MQ=255) ccACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAg > 7:219842/1‑149 (MQ=255) acaTGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCa > 7:83593/1‑146 (MQ=255) acaTGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCa < 8:83593/146‑1 (MQ=255) tgtgCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGa > 8:158275/1‑148 (MQ=255) caccaGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCgg < 4:250630/149‑1 (MQ=255) gTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGgc > 7:162941/1‑141 (MQ=255) gTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGgc < 8:162941/141‑1 (MQ=255) gTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTgg > 5:119084/1‑148 (MQ=255) gTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTgg > 4:58499/1‑148 (MQ=255) ccaccaCCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCaaa < 2:8338/112‑1 (MQ=255) caccacCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACgg < 1:17641/103‑1 (MQ=255) caccacCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACgg > 2:17641/1‑103 (MQ=255) caccacCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCt > 5:252326/1‑149 (MQ=255) accaccGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTc < 5:69985/149‑1 (MQ=255) accGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGcc > 8:95201/1‑149 (MQ=255) aCATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGag > 7:195126/1‑148 (MQ=255) cATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGagca < 3:205853/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCt > 1:60930/1‑149 (MQ=255) ttCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCt > 3:333990/1‑149 (MQ=255) gCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTgg > 7:11577/1‑149 (MQ=255) gCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTgg > 2:46936/1‑149 (MQ=255) gAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTgg > 7:175416/1‑137 (MQ=255) gAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTgg < 8:175416/137‑1 (MQ=255) aaTGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGgtgt > 4:188124/1‑149 (MQ=255) aaTGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGgtgt < 8:219842/149‑1 (MQ=255) aTGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGGtgtg < 3:263854/149‑1 (MQ=255) tGTTCTGGAAGGGGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGGTGTgg < 8:104657/149‑1 (MQ=255) gTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCt < 1:84299/110‑1 (MQ=255) gTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCt > 2:84299/1‑110 (MQ=255) gAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGGTGTGGCTGCcgc < 2:60930/149‑1 (MQ=255) gTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGGTGTGGCTGCCGCGCAc < 6:119084/149‑1 (MQ=255) ccgcgcCGGCCTGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGGTGTGGCTGCCGCGCACGt > 4:286481/2‑149 (MQ=255) gcCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGGTGTGGCTGCCGCGCACGTTCAg < 8:11577/149‑1 (MQ=255) cNGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCATGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGCTGTGGCTGCCGAGCACGTTCAGtt > 2:33252/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGACGCGCTCGCCGCGCAGCTGGAGGACGTTGGTGTGGCTGCCGCGCAGGTTCAGtt > 4:207712/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGGTGTGGCTGCCGCGCACGTTCAGtt < 7:158275/149‑1 (MQ=255) | CATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGGTGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAGCAGGTTCTCCACCACCGACATTTCCTTGAACAGGCGAATGTTCTGGAAGGTGCGCGCCAGGCCGGCGCGGTTGACCAGGTGGGTACCACCGAACATCTTGTAGTACATACGGTTGGCAAAGCGCGCAGGCGACACGAAGTCGGCCGCCTGGAAGCGCTCGCCGAGCAGCTGGATGACGTTGGTGTGGCTGCCGCGCACGTTCAGTT > NC_002947/5530488‑5530778 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |