Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,658,669 | A→G | 6.0% | S242G (AGC→GGC) | sahR → | methionine metabolism transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,658,669 | 0 | A | G | 6.0% | 189.2 / 2.3 | 66 | S242G (AGC→GGC) | sahR | methionine metabolism transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/28); new base G (2/2); total (36/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.54e-01 |
GACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAGGACGACCTGGC > NC_002947/5658522‑5658817 | gACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCa < 7:108668/148‑1 (MQ=255) acaacaGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGc > 3:43864/1‑149 (MQ=255) aGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGTAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGAccc > 1:327771/1‑149 (MQ=255) cccTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCgg < 7:262821/149‑1 (MQ=255) aCCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCt > 7:289595/1‑149 (MQ=255) cATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGGTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTgg > 2:257448/1‑149 (MQ=255) gAGCTTGCGCGCCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTgc < 8:201829/148‑1 (MQ=255) cgcgcCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGTAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTg < 2:327771/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTTGGGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTg > 1:265651/1‑149 (MQ=255) cAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCa > 4:119238/1‑148 (MQ=255) aGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCaaa > 6:97257/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTg > 5:290574/1‑148 (MQ=255) aGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCa < 8:10751/105‑1 (MQ=255) aGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCa > 7:10751/1‑105 (MQ=255) gAAGGGCTCGACAACGGGAACCTGCAGCT‑GGCCGATGCACTGGGCGCAACGGATGCGGCCGCCGACTGCGGTGTGCGGCACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTCCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAaggcagg < 8:176532/149‑1 (MQ=255) aaGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAaggcaggc < 3:119238/149‑1 (MQ=255) ggCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAggcggc > 4:208232/1‑149 (MQ=255) tCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGc > 4:218823/1‑149 (MQ=255) gACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTgc < 1:159046/112‑1 (MQ=255) gACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTgc > 2:159046/1‑112 (MQ=255) gACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGc < 6:290574/147‑1 (MQ=255) cAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCctgc < 6:108796/149‑1 (MQ=255) aaCGGGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCctgct < 4:247274/149‑1 (MQ=255) aCGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCctgctg < 4:13701/149‑1 (MQ=255) aCGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCctgctg < 4:43864/149‑1 (MQ=255) gTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAACCGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGt > 1:333408/1‑149 (MQ=255) aTGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCGGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCAt > 1:201327/1‑149 (MQ=255) aTGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGAc < 3:330732/71‑1 (MQ=255) aTGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGAc > 4:330732/1‑71 (MQ=255) aTGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCAt > 4:162305/1‑149 (MQ=255) aCTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCGATGAc > 6:84262/1‑148 (MQ=255) ggTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAggg > 4:339122/1‑149 (MQ=255) ggTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAg < 7:100254/147‑1 (MQ=255) tGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGt < 3:218823/149‑1 (MQ=255) aaCGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCAc > 1:114065/1‑120 (MQ=255) aaCGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCAc < 2:114065/120‑1 (MQ=255) aaCGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGAc < 4:31320/139‑1 (MQ=255) aaCGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGAc > 3:31320/1‑139 (MQ=255) aaCGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGt < 5:118306/146‑1 (MQ=255) aaCGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGt > 6:118306/1‑146 (MQ=255) aCGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGgc < 3:162305/149‑1 (MQ=255) ggATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGgcgc < 2:201327/149‑1 (MQ=255) gATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATg > 1:140057/1‑133 (MQ=255) gATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATg < 2:140057/133‑1 (MQ=255) gccgccGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGc < 8:289595/149‑1 (MQ=255) gACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGt > 4:96151/1‑130 (MQ=255) gACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGt < 3:96151/130‑1 (MQ=255) tGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGa > 8:73139/1‑149 (MQ=255) ttGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACctc > 6:137594/1‑149 (MQ=255) tgCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGAc < 5:156826/143‑1 (MQ=255) tgCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGAc > 6:156826/1‑143 (MQ=255) gCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAg < 7:307248/105‑1 (MQ=255) gCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAg > 8:307248/1‑105 (MQ=255) cTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTctggct > 8:67460/1‑149 (MQ=255) tGAACATGGTGCTGCACCATTTCGGCGCCCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTgg < 5:10816/119‑1 (MQ=255) tGAACATGGTGCTGCACCATTTCGGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTgg < 5:5661/119‑1 (MQ=255) tGAACATGGTGCTGCACCATTTCGGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTgg > 6:10816/1‑119 (MQ=255) tGAACATGGTGCTGCACCATTTCGGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTgg > 6:5661/1‑119 (MQ=255) gAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTctggctgg < 7:73139/149‑1 (MQ=255) gAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTctggctgg > 2:287132/1‑149 (MQ=255) aaCATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTctggctgg < 6:188573/148‑1 (MQ=255) tGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTc < 3:339122/149‑1 (MQ=255) ctgcACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACa < 1:257448/149‑1 (MQ=255) gcACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAg > 8:40573/1‑148 (MQ=255) gcACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAg > 5:231071/1‑148 (MQ=255) cACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAGga > 3:100088/1‑149 (MQ=255) cACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAGga > 2:87719/1‑149 (MQ=255) tttCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAGGACGAcc > 5:206148/1‑149 (MQ=255) cAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAGGACGACCTgg > 2:299529/1‑149 (MQ=255) aGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAGGACGACCTgg < 5:97257/148‑1 (MQ=255) aGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAGGACGACCTGgc > 8:266121/1‑149 (MQ=255) | GACAACAGCCCTACCATGCTCGAGCTTGCGCGCCAGGTGTGCCAGCGCGAAGGGCTCGACAACGTGAACCTGCAGTT‑GGCCGATGCACTGGGTGCAACGGATGTGGCCGCCGACTGCGTTGTGCTGAACATGGTGCTGCACCATTTCAGCGACCCGGCCCTGGCCTTGCGCCAGCTGGCCAAACGGGTGAAGGCAGGCGGCAGCCTGCTGGTCACCGAACTGTGCAGCCATGACCAGGGGTGGGCGCGCGAAGCCTGCGGCGACCTCTGGCTGGGCTTCGAACAGGACGACCTGGC > NC_002947/5658522‑5658817 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |