| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,687,581 | T→G | 9.6% | K462T (AAG→ACG) ‡ | pilJ ← | twitching motility protein PilJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,687,581 | 0 | T | G | 9.6% | 207.9 / 13.6 | 73 | K462T (AAG→ACG) ‡ | pilJ | twitching motility protein PilJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/30); new base G (5/2); total (41/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.09e-01 | |||||||||||
GCCGATTTCCTGTGAGGACTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTCCTGCACGGCGG > NC_002947/5687436‑5687728 | gCCGATTTCCTGTGAGGACTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTgg < 7:49500/149‑1 (MQ=255) cTGTGAGGACTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATATGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCg > 4:293021/1‑148 (MQ=255) tgAGGACTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTa < 4:305394/147‑1 (MQ=255) tgAGGACTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTa < 3:74600/147‑1 (MQ=255) tgAGGACTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAg < 4:64634/148‑1 (MQ=255) cagcaCTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTAGGCGCAGTCCTCGATCACCAAGCGAATCTAGTCCATGCCGTTGATGGTCTTGTCCACAACCTCCTTGCCCTTGTTGGCAATCGCCACCGAACCATAGGACACATTCGCCCATTCGTacg > 4:335253/5‑146 (MQ=255) aGGACTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCAAGGTGGCCGagcgttcg < 5:282589/146‑8 (MQ=255) aGGACTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCAAGGTGGCCGagcgttcg > 6:282589/1‑139 (MQ=255) tCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATgcgc > 3:186457/1‑149 (MQ=255) gCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGcc > 3:321332/1‑148 (MQ=255) cAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGc < 6:39361/126‑1 (MQ=255) cAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGc > 5:39361/1‑126 (MQ=255) gACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGGCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAAcc < 8:326786/149‑1 (MQ=255) cGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGTAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCg > 7:327491/1‑149 (MQ=255) tGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCAAGGTGGCCGag > 2:187662/1‑121 (MQ=255) aTCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGtcga‑t > 6:142157/1‑149 (MQ=255) aTCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGtcga‑t < 4:186457/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑tcgac < 6:310533/149‑1 (MQ=255) ggCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑tcgact < 7:18859/146‑1 (MQ=255) ggCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑tcgact > 8:18859/1‑146 (MQ=255) tCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGAGTCGA‑TCGAccgggt < 2:158671/148‑5 (MQ=255) gATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTcaccca > 8:96183/1‑149 (MQ=255) gcgAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCgg < 5:142157/149‑1 (MQ=255) gAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAg < 3:293021/149‑1 (MQ=255) gAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAg > 8:145174/1‑149 (MQ=255) ttgtCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTc > 2:33095/1‑149 (MQ=255) gtCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCg > 7:64849/1‑139 (MQ=255) gtCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCg < 8:64849/139‑1 (MQ=255) tCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTccc > 1:263590/1‑146 (MQ=255) tCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGc < 7:96183/148‑1 (MQ=255) tCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGc < 2:263590/148‑1 (MQ=255) cATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCg < 6:110250/145‑1 (MQ=255) cATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCg > 5:110250/1‑145 (MQ=255) cATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTg > 6:304726/1‑148 (MQ=255) cGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCtgt < 7:145174/149‑1 (MQ=255) cGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCCTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCtgt > 8:91468/1‑149 (MQ=255) gTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCtgtg > 7:180694/1‑149 (MQ=255) gTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCtgtg < 3:335253/149‑1 (MQ=255) gTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCtgtg > 2:331058/1‑149 (MQ=255) gATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAAcct < 4:69933/92‑2 (MQ=255) gATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAAcca > 3:69933/1‑91 (MQ=255) ttgtGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGTAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTg < 8:327491/149‑1 (MQ=255) caccacCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGCCTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGCGGCCACCCAGATCTGTGCAGCCAGGTGCTCg > 4:100191/1‑148 (MQ=255) accaccTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCg > 7:198719/1‑147 (MQ=255) accaccTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACCCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCg > 3:289873/1‑147 (MQ=255) ccaccTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCGTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAg < 1:33095/149‑1 (MQ=255) caccTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCt > 4:88446/1‑110 (MQ=255) caccTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAgg > 4:44122/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGc > 6:91411/1‑147 (MQ=255) cTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGtt > 5:327616/1‑149 (MQ=255) cTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGtt > 7:20383/1‑149 (MQ=255) cTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGtt < 1:331058/149‑1 (MQ=255) ttgttgGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTg > 4:300856/1‑149 (MQ=255) gttgGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTg > 8:160543/1‑109 (MQ=255) gttgGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTg < 7:160543/109‑1 (MQ=255) ttgGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGcc < 2:36915/148‑1 (MQ=255) ccACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTc > 3:27180/1‑149 (MQ=255) aCCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTg < 6:327616/149‑1 (MQ=255) ctacgaatCGGCCAAGGTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCg > 8:330921/8‑149 (MQ=255) aaCGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCgtg < 3:300856/149‑1 (MQ=255) aaCGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCgtg < 3:44122/149‑1 (MQ=255) cGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCGCGCTGATCTGTGCAGCCGGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTc < 4:27180/149‑1 (MQ=255) aatCGGCCAAGGTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTcc > 3:123085/3‑149 (MQ=255) cTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAATCCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTCGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTCCt < 5:304726/149‑1 (MQ=255) atCGGCCAAGGTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAg < 1:281877/111‑1 (MQ=255) atCGGCCAAGGTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAg > 2:281877/2‑112 (MQ=255) ggCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTCCTGCa > 3:201213/1‑149 (MQ=255) gCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGAGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCATCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTCATGCAc > 2:250745/1‑149 (MQ=255) cACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTCCTGCAcgg > 3:250557/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTCCTGCAcggcgg > 6:136882/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTCCTGCAcggcgg > 5:293759/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCAAGGcctccga < 8:157987/117‑6 (MQ=255) cTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCAAGGcctccga > 7:157987/1‑112 (MQ=255) | GCCGATTTCCTGTGAGGACTCGCCCAGACGCTTGATCCGCTTGGCGGTGTCCTGGATCTGCTCGCGAATGTTGTCCATGCCGTTGATGGTGTTGTGCACCACCTCGTTGCCCTTGTTGGCAATGGCCACCGAACGCTCGGCCACCTTGGCCGATTCGTAGGCATGCGCCGAAACCCGGTCGA‑TCGACTCGACCATGTCACCCACCGCCTCGGAGGCCTCGCTGATCTGTGCAGCCTGGTGCTCGGAGGCCTTGGCCAGTTGCCGCGCAGTGTTCTGCGTGTCCTGCACGGCGG > NC_002947/5687436‑5687728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |