| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,994,456 | A→G | 8.5% | T395A (ACC→GCC) | PP_5251 → | transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,994,456 | 0 | A | G | 8.5% | 188.3 / 6.9 | 72 | T395A (ACC→GCC) | PP_5251 | transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/32); new base G (2/4); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.21e-01 | |||||||||||
CGGGCGCGGGCTTTGTCGGTATACATTCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTGATGGTCACCGTCGAGTACCACATCGCCCCCACCAAG > NC_002947/5994309‑5994599 | cGGGCGCGGGCTTTGTCGGTATACATTCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGAc < 7:46039/149‑1 (MQ=255) gggCGCGGGCTTTGTCGGTATACATTCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGAcc > 2:29584/1‑149 (MQ=255) ggCTTTGTCGGTATACATTCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAgg < 4:222241/149‑1 (MQ=255) gCTTTGTCGGTATTCTTTCAGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGGCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCAGGTCAGCAAGGt < 3:97487/149‑1 (MQ=255) cTTTGTCGGTATACATTCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCAGGTCAGCAAGGta < 7:214457/149‑2 (MQ=255) tttGTCGGTATACATTCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTgg > 2:242954/1‑149 (MQ=255) tttGTCGGTATACATTCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGACTGCTGTGTGGCACGCTGGCAAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGAAGGCGGCCAGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGAAAGGTgg > 3:294015/1‑149 (MQ=255) gTCGGTATACATTCTGATTTTCTTCCGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGgcgc > 8:254185/1‑149 (MQ=255) tCGGTATACATTCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTGTGTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGgcg < 1:89628/148‑1 (MQ=255) ttCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCAGGTCAGCAAGGta < 1:359051/134‑2 (MQ=255) ttCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCAGGTCAGCAAGGta > 2:359051/1‑133 (MQ=255) gATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAgg > 2:93531/1‑149 (MQ=255) aTTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGa < 4:256640/146‑1 (MQ=255) ttttCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACGTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCa < 1:29584/149‑1 (MQ=255) tttCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGGCCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAgg > 1:252177/1‑146 (MQ=255) tcttcGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCag > 6:197009/1‑147 (MQ=255) ttcGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGgcg < 3:268885/126‑1 (MQ=255) ttcGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGgcg > 4:268885/1‑126 (MQ=255) cGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCTCGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGTCGATGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAagag < 4:294015/148‑1 (MQ=255) cgcCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGGCCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGa < 2:252177/149‑1 (MQ=255) ccATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACg < 1:242954/149‑1 (MQ=255) cATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGc > 6:240639/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCGCCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTAGCTTGGTGCCCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGATGCAGAAGAGCTGACGcc > 6:243760/1‑149 (MQ=255) ccTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCg < 5:16984/149‑1 (MQ=255) tgtgGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCaa < 5:109393/104‑1 (MQ=255) tgtgGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCaa > 6:109393/1‑104 (MQ=255) gtggCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCAt > 3:25280/1‑149 (MQ=255) tggCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGc > 4:92390/1‑110 (MQ=255) tggCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGc < 3:92390/110‑1 (MQ=255) tggCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCAtt > 3:135251/1‑149 (MQ=255) ggCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGaaa > 7:186767/1‑115 (MQ=255) ggCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGaaa < 8:186767/115‑1 (MQ=255) gctgTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGa < 1:202135/114‑1 (MQ=255) gctgTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGa > 2:202135/1‑114 (MQ=255) ctgTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGgccgg < 6:180301/148‑1 (MQ=255) tgtgGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAAGGCTCACCTTCAGCCTGGTG‑GTGGCGGCAGGCGGCGTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTTGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGgccggtg < 2:348611/149‑1 (MQ=255) gtgGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCCGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCGTGCTGACCTGCACGGTGGCGCTGCCGGAAAGCGAGGCAGCAGAGCTGACGCCGTCGGTGCATTGgcgggtgc > 8:87395/1‑149 (MQ=255) tgGGGCACGCTGGCCAGCCATTCAACTCTCACCTTCAGCCTTCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCTCTGGTTACATAGATGACCTTCAAGGTGGCGCTGCCGGAAAACGAGGCAGAAGAGCTGAATCCGt < 6:129905/130‑1 (MQ=255) tgGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGAGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGt > 5:129905/1‑130 (MQ=255) gggCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGgccggtgccgg > 6:84617/1‑149 (MQ=255) gCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGccggtgccggtg > 5:241480/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGtt > 7:87120/1‑149 (MQ=255) cTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAg < 1:93531/149‑1 (MQ=255) tGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGc > 7:58124/1‑149 (MQ=255) gccagccaTGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAg > 4:276195/1‑146 (MQ=255) gccagccaTGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAg < 3:276195/146‑1 (MQ=255) gccagccaTGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGa > 8:151482/1‑149 (MQ=255) gccagccaTGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGa < 7:254185/149‑1 (MQ=255) ccagccaTGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGAt < 5:240639/149‑1 (MQ=255) agccaTGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGa > 4:114766/1‑149 (MQ=255) gccaTGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGATGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGAt < 1:90835/146‑1 (MQ=255) gccaTGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGATGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGAt > 2:90835/1‑146 (MQ=255) aaCGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGAc > 1:22846/1‑148 (MQ=255) tCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAgg > 3:64578/1‑147 (MQ=255) cACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAg < 4:135251/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGCCCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCAATGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGcc < 8:42742/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCg > 3:201206/1‑149 (MQ=255) ctgctg‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGt < 2:22846/149‑1 (MQ=255) tgctg‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGt > 4:91903/1‑148 (MQ=255) ctg‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTGAt < 6:241480/149‑1 (MQ=255) gtggCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTGATg < 5:84617/147‑1 (MQ=255) gtggCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTGATg < 7:151482/147‑1 (MQ=255) gCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTg < 2:213053/138‑1 (MQ=255) gCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTg > 1:213053/1‑138 (MQ=255) cggcCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTGATGGTCACCGTCGAGt < 4:25280/149‑1 (MQ=255) ggcCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCg < 1:195341/75‑1 (MQ=255) ggcCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGAGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCg > 2:195341/1‑75 (MQ=255) ggTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTGATgg < 5:188074/124‑1 (MQ=255) ggTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTGATgg > 6:188074/1‑124 (MQ=255) ccTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACaa > 4:35902/1‑100 (MQ=255) ccTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACaa < 3:35902/100‑1 (MQ=255) gCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTGATGGTCACCGTCGAGTACCACATCGCCCCCACCAAg < 6:310458/148‑1 (MQ=255) | CGGGCGCGGGCTTTGTCGGTATACATTCTGATTTTCTTCGGCGCCATGGCCTGTGGTGGCCTGCTGTGGGGCACGCTGGCCAGCCATGCAACGCTCACCTTCAGCCTGCTG‑GTGGCCGCAGGCGGCCTGGCGCTGGGTACCTTGCTGACCTGCAAGGTGGCGCTGCCGGAAACCGAGGCAGAAGAGCTGACGCCGTCGCTGCATTGGCCGGTGCCGGTGTTGAGCGATGACATGGACAAGGAAGCCGGACCGGTGATGGTCACCGTCGAGTACCACATCGCCCCCACCAAG > NC_002947/5994309‑5994599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |