Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 680,671 | C→T | 6.5% | P64L (CCG→CTG) | PP_0583 → | AraC family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 680,671 | 0 | C | T | 6.5% | 227.9 / 3.6 | 77 | P64L (CCG→CTG) | PP_0583 | AraC family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/37); new base T (3/2); total (38/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
CTGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGG > NC_002947/680526‑680814 | cTGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCg > 5:226479/1‑147 (MQ=255) tGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑Ag > 6:355510/1‑149 (MQ=255) ccccTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGgt < 1:78030/149‑1 (MQ=255) cccTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCCCTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGgtg > 1:71410/1‑149 (MQ=255) cccTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACTGC‑GGTggggcaaa < 6:305498/149‑5 (MQ=255) ccTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTGGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGgtgt < 7:202703/149‑1 (MQ=255) ctctACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGtgtg > 6:116316/1‑149 (MQ=255) ctctACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGtgtg > 3:235190/1‑149 (MQ=255) tACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCCCTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTgg < 2:71410/147‑1 (MQ=255) cGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCccgc > 7:82931/1‑149 (MQ=255) gTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCccgcc > 1:214450/1‑149 (MQ=255) cGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATg > 6:331834/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGAGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAg > 3:57031/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACTGC‑GGTggggca > 8:186351/1‑123 (MQ=255) ccTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACTGC‑GGTggggca < 7:186351/125‑3 (MQ=255) cTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGgtgt < 6:150248/127‑1 (MQ=255) cTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGgtgt > 5:150248/1‑127 (MQ=255) gcgcCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCTTGaa < 6:226479/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGaa < 4:235190/149‑1 (MQ=255) cgcCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAg < 3:163310/149‑1 (MQ=255) gcCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGt > 4:240839/1‑149 (MQ=255) ccGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTg < 4:166996/149‑1 (MQ=255) gTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCAcc < 8:82931/148‑1 (MQ=255) tGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGaa > 2:241563/1‑138 (MQ=255) tGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGaa < 1:241563/138‑1 (MQ=255) tGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTc > 7:77978/1‑149 (MQ=255) ggACAACTCGCCACCAGCACGACTGGGTCCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTTCCACACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTc > 7:143230/1‑148 (MQ=255) aCCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGAt < 7:734/149‑1 (MQ=255) cACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATg > 1:91302/1‑148 (MQ=255) cTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑Caa < 7:299100/149‑1 (MQ=255) ccaccaGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCg < 7:318448/149‑1 (MQ=255) caccaGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCga < 5:331834/149‑1 (MQ=255) accaGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACTGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCgag < 5:195102/149‑1 (MQ=255) gCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATgc < 2:214450/149‑1 (MQ=255) aCGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCACCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATgcgc < 2:72033/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGcc > 3:141556/1‑149 (MQ=255) gggTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTAGACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTg > 1:69539/1‑149 (MQ=255) gggTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTg > 5:104502/1‑149 (MQ=255) ggTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTg > 3:1984/1‑148 (MQ=255) tGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTAc < 4:141556/149‑1 (MQ=255) aaTTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGAt > 6:83557/1‑121 (MQ=255) aaTTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGAt < 5:83557/121‑1 (MQ=255) aaTTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTg > 4:132302/1‑149 (MQ=255) tcCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGc > 6:342040/1‑97 (MQ=255) tcCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGc < 5:342040/97‑1 (MQ=255) ccTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGcc < 6:2658/135‑1 (MQ=255) ccTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGACGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGcc > 5:2658/1‑135 (MQ=255) cTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGcgccgc > 4:103712/1‑148 (MQ=255) tACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAg < 4:316298/100‑1 (MQ=255) tACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAg > 3:316298/1‑100 (MQ=255) gCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGAtgc > 6:70462/1‑149 (MQ=255) gcgTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATGCCAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATg < 1:259953/149‑1 (MQ=255) cgTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATggg > 2:179689/1‑149 (MQ=255) tCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCg < 3:240839/149‑1 (MQ=255) ggCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCg < 1:179689/147‑1 (MQ=255) gCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCGCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGaa < 8:143230/149‑1 (MQ=255) gCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGaa < 2:91302/149‑1 (MQ=255) acacacGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGc > 6:68116/1‑149 (MQ=255) cacacGCGACGGCATTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGTATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGc < 5:355510/148‑1 (MQ=255) cacGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCgg < 5:116316/149‑1 (MQ=255) gcgACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGCGAGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGa > 1:15973/1‑116 (MQ=255) gcgACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGa < 2:15973/115‑1 (MQ=255) cAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTg < 3:191145/142‑1 (MQ=255) cAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTg > 4:191145/1‑142 (MQ=255) aGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGt < 6:104502/149‑1 (MQ=255) aGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGt < 2:69539/149‑1 (MQ=255) gTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCgg < 8:276959/137‑1 (MQ=255) gTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCgg > 7:276959/1‑137 (MQ=255) aCTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGaa < 2:173673/125‑1 (MQ=255) aCTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGaa > 1:173673/1‑125 (MQ=255) acaccccccACTGC‑GGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGAcgc > 1:359136/6‑149 (MQ=255) cccccACTGC‑GGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACTTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGAGCCGGAACATTGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCt > 7:207190/2‑149 (MQ=255) ccccACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTg < 8:77978/149‑1 (MQ=255) cccACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTgg > 4:157880/1‑149 (MQ=255) cccACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTgg > 3:301012/1‑149 (MQ=255) ccACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCggg > 6:67726/1‑127 (MQ=255) ccACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCggg < 5:67726/127‑1 (MQ=255) | CTGCCCAGACCCCTCTACGCCCGTGCCGAAAGCCTTGGCGCCGGATCGTGGACCACTCGCCACCAGCACGACTGGGTGCAATTCTCCTACGCCATCAGCGGCGTACTCGGCGTGTACACACGCGACGGCAGTTACTTTGCCCCACCGC‑AGTGGGGGGTGTGGATCCCCGCCGATGCCGAGCATGAAGTGGTCACCTCGATG‑CAAGCCGAGATGCGCAGCCTGTACGTGCGCCGCGATGCCTGCCCATGGGCGCCGGAACAATGCCGGGTGCTGGAAGTGACGCCGCTGG > NC_002947/680526‑680814 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |