| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 699,722 | A→G | 56.6% | intergenic (+115/‑129) | PP_t06 → / → PP_23SD | tRNA‑Ala/23S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 699,722 | 0 | A | G | 56.6% | 20.5 / 87.1 | 76 | intergenic (+115/‑129) | PP_t06/PP_23SD | tRNA‑Ala/23S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (18/15); new base G (24/19); total (42/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.26e-01 | |||||||||||
GAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACGTACGAA > NC_002947/699574‑699799 | gagtTCATCTGTTCGATCCCGCTTGGCTCGACGAATTTCTCCGTACGCATTTTCTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTTATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAATAATTCGGATTTGTGATAGATTTAGa < 7:170388/149‑1 (MQ=11)gaggTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGa < 6:153914/149‑1 (MQ=37) tCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑Tg > 1:361777/1‑148 (MQ=37) gCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAaca > 6:80677/1‑149 (MQ=37) cGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAacac > 3:142546/1‑149 (MQ=37) gATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGaa > 6:62727/1‑140 (MQ=37) gATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGaa < 5:62727/140‑1 (MQ=37) gATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTAAGATAGTTCTTTAAAAATTCTGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGtt > 3:10521/1‑148 (MQ=255) aTCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGttt > 2:84897/1‑148 (MQ=37) aTCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTc < 6:103467/149‑1 (MQ=37) tCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCAAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCa > 8:56551/1‑149 (MQ=255) cccGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCGGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATAGAGGC‑TCAACACCAGTTTCAc > 6:253992/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCAct < 1:325163/149‑1 (MQ=37) cGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCActg > 5:284821/1‑149 (MQ=37) ttGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCActgctg > 4:252273/1‑149 (MQ=37) ttGGCTCCACCACTTTCGCAGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATTGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCActgctg > 8:18359/1‑149 (MQ=255) ttgatCCATCACTTTCGCAGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCActgctg < 4:10521/144‑1 (MQ=255) ggCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCActgctg < 1:20175/147‑1 (MQ=37) gCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑Tg > 8:205654/1‑127 (MQ=38) gCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑Tg < 7:205654/127‑1 (MQ=38) gCTCCACCACTTTCGCCGTAAGGAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTGCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCtggtg < 5:253992/149‑1 (MQ=255) cTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCtggtgg < 2:45172/149‑1 (MQ=37) tCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGa > 5:219833/1‑149 (MQ=37) tCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGa > 1:208926/1‑149 (MQ=37) caccacTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGa < 2:328219/147‑1 (MQ=37) caccacTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGAt > 5:369929/1‑148 (MQ=37) accacTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGAt > 3:102611/1‑147 (MQ=37) accacTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCa < 5:212756/149‑1 (MQ=37) cacTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAg > 5:157304/1‑148 (MQ=37) tttCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCActgctg > 7:230382/1‑136 (MQ=37) tttCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCActgctg < 8:230382/136‑1 (MQ=37) tttCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCt > 7:169235/1‑148 (MQ=37) tCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTaa < 8:131634/148‑1 (MQ=37) tCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAg > 1:218090/1‑149 (MQ=37) cGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGACCTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAg < 8:341580/148‑1 (MQ=255) gCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAgg > 3:37206/1‑148 (MQ=37) tACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTaaaa < 7:210845/149‑1 (MQ=37) gCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAAttt < 4:37206/149‑1 (MQ=37) gCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAAttt < 2:250437/149‑1 (MQ=37) gCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAAttt > 4:233198/1‑149 (MQ=37) 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gTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTtgt > 4:203874/1‑148 (MQ=37) cgtccctGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑ACCTCCAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTtgt < 4:56817/142‑1 (MQ=255) ttACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 7:194240/149‑1 (MQ=25) ttACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 5:343180/149‑1 (MQ=35) tACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 7:161087/148‑1 (MQ=25) aCTTGTCAGAACTTATAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTGTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTTAAAATTCGGATATGTGATAGATATTGGCTTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGa < 1:84897/148‑1 (MQ=11) cTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGtt < 3:81832/149‑1 (MQ=21) cTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGt > 2:17878/1‑148 (MQ=21) tCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGc > 1:233615/1‑149 (MQ=21) tCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGc > 4:105201/1‑149 (MQ=21) tCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGc > 5:359217/1‑149 (MQ=34) tCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGc > 5:132336/1‑149 (MQ=34) tCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTCGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTg < 2:70953/148‑1 (MQ=21) tCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGATGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGATGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCtca > 2:59895/1‑147 (MQ=255) acaaCTTAGAAATCAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCt < 8:120140/146‑1 (MQ=19) 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ttAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGa > 2:152859/1‑146 (MQ=21) ttAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGa > 6:112578/1‑146 (MQ=21) aGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAaga < 3:95415/148‑1 (MQ=21) aTGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCAGTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAAc > 2:301592/1‑149 (MQ=21) aTGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAAc < 6:284821/149‑1 (MQ=34) tcaaCATTCGAGCT‑GAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACg > 1:277815/3‑149 (MQ=2) tGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCTTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCAATGCTGGTGGAGCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGATCTGCTCGAAAGAGCACCg > 8:308999/1‑149 (MQ=11) tGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACg > 2:85244/1‑149 (MQ=34) gAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACg > 4:332800/1‑148 (MQ=21) aTTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGGC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACGTACGa < 3:332800/149‑1 (MQ=21) aTTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAAc < 6:180841/143‑1 (MQ=34) aTTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAAc > 5:180841/1‑143 (MQ=34) ttC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACGTACGaa > 7:132338/1‑149 (MQ=34) | GAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCACTTTCGCCGTACGCAGTTACTTGTCAGAACTTAGAAATGAACATTC‑AGCTCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAC‑TGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGTAAAATTTGTGAGTTCTGCTCGAAAGAGCAACGTACGAA > NC_002947/699574‑699799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |