| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 784,329 | G→T | 5.7% | R533S (CGC→AGC) | PP_0672 ← | sensory box protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 784,329 | 0 | G | T | 5.7% | 224.3 / 2.5 | 70 | R533S (CGC→AGC) | PP_0672 | sensory box protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/33); new base T (2/2); total (35/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 | |||||||||||
TAGCGTTGCTCGCTGTCACGTAGCGACTGGCTGGCCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCAGCAGCAGCTCCCAGAAGCGGTCGCCCATCTGTGCCAGCTCGGTGCGGTC > NC_002947/784181‑784476 | tAGCGTTGCTCGCTGTCACGTAGCGACTGGCTGGCCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACAAGGCCTTCGGCTTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTcgcg > 7:277681/1‑149 (MQ=255) gCGTTGCTCGCTGTCACGTAGCGACTGGCTGGCCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCgg < 4:76166/148‑1 (MQ=255) ttGCTCGCTGTCACGTAGCGACTGGCTGGCCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGc < 1:147186/149‑1 (MQ=255) cTCGCTGTCACGTAGCGACTGGCTGGCCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGa < 7:127419/149‑1 (MQ=255) gCTGTCACGTAGCGACTGGCTGGCCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAg < 7:247035/148‑1 (MQ=255) tAGCGACTGGCTGGCCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGc < 3:25539/149‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGCCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGc < 1:231456/149‑1 (MQ=255) tggctggcCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAg > 2:108996/1‑149 (MQ=255) gctggcCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCg > 5:54293/1‑149 (MQ=255) gctggcCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCg > 6:332720/1‑149 (MQ=255) cTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGt > 8:43167/1‑149 (MQ=255) cTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGt > 1:312810/1‑149 (MQ=255) tCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCCTACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTgg > 1:16427/1‑148 (MQ=255) tCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGt > 6:271859/1‑148 (MQ=255) tCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGt > 3:317186/1‑148 (MQ=255) gATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCa < 6:324355/148‑1 (MQ=255) aaCGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGa < 7:312943/145‑1 (MQ=255) aaCGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAg < 5:271859/148‑1 (MQ=255) aCGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCAt < 2:183788/142‑1 (MQ=255) aCGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCAt > 1:183788/1‑142 (MQ=255) acaTCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGtagctcgg > 5:332290/1‑142 (MQ=255) cTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGTTGGCTGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACATTTGTCGCGCTGtt < 8:277681/149‑1 (MQ=255) cTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGtt < 2:16427/149‑1 (MQ=255) cc‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTggcgg > 6:351417/1‑149 (MQ=255) gatgatGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTg < 7:224439/99‑1 (MQ=255) gatgatGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTg > 8:224439/1‑99 (MQ=255) gatgatGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTg > 6:187228/1‑149 (MQ=255) gatgCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGt > 7:74112/1‑113 (MQ=255) gatgCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGt < 8:74112/113‑1 (MQ=255) tgCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTgg < 6:54293/149‑1 (MQ=255) cgcgTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTa < 3:184822/149‑1 (MQ=255) cgcgTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTa < 4:317186/149‑1 (MQ=255) tCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAgtgt < 5:332720/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGGCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTgc < 7:73971/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTgcg > 5:321889/1‑149 (MQ=255) ggCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTgcggcg > 1:195158/1‑149 (MQ=255) ggCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTgcggcg > 3:94391/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACa < 1:276589/103‑1 (MQ=255) cTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACa > 2:276589/1‑103 (MQ=255) cTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTcc > 4:345870/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGa > 5:181396/1‑100 (MQ=255) ttCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGa < 6:181396/100‑1 (MQ=255) ttCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCt > 5:369543/1‑149 (MQ=255) gCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCggg < 1:108996/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCggg < 4:94391/149‑1 (MQ=255) gTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGt < 5:85162/109‑1 (MQ=255) gTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGt > 6:85162/1‑109 (MQ=255) gTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGt < 7:43167/149‑1 (MQ=255) cctggTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTg > 8:195620/4‑108 (MQ=255) cctggTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTg < 7:195620/105‑1 (MQ=255) aGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTgcggc < 7:295996/128‑1 (MQ=255) aGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTgcggc > 8:295996/1‑128 (MQ=255) aCCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCAGCAGCAGCTc > 7:10438/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCTGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCggg < 6:83773/133‑1 (MQ=255) ccTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCTGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCggg < 6:88736/133‑1 (MQ=255) ccTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCTGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCggg > 5:83773/1‑133 (MQ=255) ccTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCTGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCggg > 5:88736/1‑133 (MQ=255) ccTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCAGCAGCAGCTcc < 2:195158/149‑1 (MQ=255) cTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTg < 5:311577/93‑1 (MQ=255) cTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTg > 6:311577/1‑93 (MQ=255) gcgGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCagcagcagc > 5:107282/1‑139 (MQ=255) gcgGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCagcagcagc < 6:107282/139‑1 (MQ=255) gcgGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCAGCAGCAGCTCCCAGAAGc > 6:315246/1‑149 (MQ=255) cgGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCAGCAGCAGCTCCCAGAAGCg < 5:315246/149‑1 (MQ=255) 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cTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCAGCAGCAGCTCCCAGAAGCGGTCg < 1:341410/132‑1 (MQ=255) cTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCAGCAGCAGCTCCCAGAAGCGGTCg > 2:341410/1‑132 (MQ=255) cgGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCAGCAGCAGCTCCCAGAAGCGGTCGCCCATCTGTGCCAGCTCGGTGCGGTc > 1:6047/1‑149 (MQ=255) | TAGCGTTGCTCGCTGTCACGTAGCGACTGGCTGGCCTCGATCTGAACGGTCACATCCTTGCCC‑ACACCGATGATGCGCGTCACCAGGCCTTCGGCGTTGCGGGTCAGCACCTGCTCGCGGATGTCGTAGCAGCGCCAGCTTCCGTCGCGGTGGCGGAAGCGCAGCTGGCAGTGCAGCGGTTGGTCATGACAGTTGTCGCGCTGTTGGCGGCGCAGTGCCTGGTAGTGTGCGGCGTCCTCGGGGTGCAGCAGCAGCTCCCAGAAGCGGTCGCCCATCTGTGCCAGCTCGGTGCGGTC > NC_002947/784181‑784476 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |