Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 903,026 | T→G | 10.5% | N158T (AAC→ACC) | nadC ← | quinolinate phosphoribosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 903,026 | 0 | T | G | 10.5% | 100.1 / 4.3 | 38 | N158T (AAC→ACC) | nadC | quinolinate phosphoribosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/17); new base G (2/2); total (19/19) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 |
TTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCACGGGTGGCGACCCCTGACAGCAGCTG > NC_002947/902884‑903171 | ttCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGCCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTGTGCGGTGGTTGTCg > 3:184315/1‑148 (MQ=255) gTCCAGGCTGTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGcac < 6:307058/148‑1 (MQ=255) ggCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCg < 4:246073/149‑1 (MQ=255) tttCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCg > 3:139266/1‑146 (MQ=255) tCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCa < 4:139266/146‑1 (MQ=255) cGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGt < 3:305867/148‑1 (MQ=255) tCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGGTGCGACAACCACCGCata > 4:294831/1‑140 (MQ=255) tCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGGTGCGACAACCACCGCata < 3:294831/142‑3 (MQ=255) ccGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGgcgc < 4:58667/149‑1 (MQ=255) gcgcAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCAGCCAGCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAgg < 2:76474/149‑1 (MQ=255) ggTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGtt < 3:46025/94‑1 (MQ=255) ggTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGtt > 4:46025/1‑94 (MQ=255) ctgcGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATCTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGtttt < 5:314131/148‑1 (MQ=255) tgcGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGc > 1:156631/1‑149 (MQ=255) cGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCgg < 6:23478/149‑1 (MQ=255) cGGCCACCGCCTCAGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCgg < 8:32326/149‑1 (MQ=255) gCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGgt < 6:166952/149‑1 (MQ=255) gCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCcag > 8:193568/1‑149 (MQ=255) tCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCcagcag > 1:81689/1‑149 (MQ=255) cTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGgcgc < 2:81689/149‑1 (MQ=255) tACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCa > 3:249993/1‑149 (MQ=255) gccgccgcTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGc > 7:310200/1‑128 (MQ=255) gccgccgcTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGc < 8:310200/128‑1 (MQ=255) gccgccgcTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCt > 1:125685/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTgg < 7:193568/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGc > 4:769/1‑147 (MQ=255) cTTGATCAGGAAGGCGTAGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGACGGCTACCAGGTCGGCgaga > 3:242284/1‑148 (MQ=255) ttGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCgaga > 4:114608/1‑147 (MQ=255) tCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAgcgc < 4:249993/149‑1 (MQ=255) tCAGGAAGGAGTCGTACAGGCCTAGGCGGTGGTGGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAgcgc < 4:42799/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGAGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAgcgcg > 1:55917/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCAc > 6:144475/1‑149 (MQ=255) gtcgtACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGaaa < 2:113654/135‑1 (MQ=255) gtcgtACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGaaa > 1:113654/1‑135 (MQ=255) tACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCACGGGTGGCGAc > 3:113096/1‑149 (MQ=255) aGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGAGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGTGTGACGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCACGGGTGGCGAcacc > 7:140267/1‑149 (MQ=255) ccTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCACGGGTGGCGACCCCTGa > 1:43306/1‑149 (MQ=255) tGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCACGGGTGGCGACCCCTGAca < 1:26005/147‑1 (MQ=255) gCGGTGGGTGCGACAACCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTa > 3:114591/1‑104 (MQ=255) gCGGTGGGTGCGACAACCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTa < 4:114591/104‑1 (MQ=255) tggtTGTCGCACCCACCGGAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGACGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCACGGGTGGCGACCCCTGACAGCAGCTg < 4:242284/149‑1 (MQ=255) tggtTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCACGGGTGGCGACCCCTGACAGCAGCTg < 3:114608/149‑1 (MQ=255) gtTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCACGGGTGGCGACCCCTGACAGCAGCTg > 1:217670/1‑147 (MQ=255) | TTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCCGGCAGGGTTTTGCGGGTGTCCAGCAGGCGCACCTGGGTGCCGGCTACCAGGTCGGCGAGAAAGCGCGCACGGGTGGCGACCCCTGACAGCAGCTG > NC_002947/902884‑903171 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |