Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 949,316 | T→A | 5.8% | F53Y (TTC→TAC) | dsbB → | disulfide bond formation protein B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 949,316 | 0 | T | A | 5.8% | 208.8 / 2.9 | 69 | F53Y (TTC→TAC) | dsbB | disulfide bond formation protein B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/33); new base A (2/2); total (34/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.69e-01 |
AAACATCGCGCCTGAATCGGGAACGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTT > NC_002947/949169‑949462 | aaacaTCGCGCCTGAATCGGGAACGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGtt > 4:76516/1‑148 (MQ=255) acaTCGCGCCTGATTCGGGAACGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCAt > 7:274804/1‑149 (MQ=255) gtaCGGCGCTTTCTGGTGGTGCTGGGGCTGATCTGGCTTTCTCTGATCGGCGGCGCGCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATGCTGGAGCGTTTTGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCAt < 7:268569/147‑1 (MQ=255) aCGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCg < 7:318203/149‑1 (MQ=255) tttCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTgcggc > 8:115077/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGc > 6:147753/1‑149 (MQ=255) gctgctGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCAt > 8:222899/1‑132 (MQ=255) gctgctGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCAt < 7:222899/132‑1 (MQ=255) gctgGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGgc > 3:44264/1‑149 (MQ=255) gggCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGcgccg > 2:83264/1‑149 (MQ=255) ggCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGcgccg > 4:108438/1‑148 (MQ=255) cTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAg > 3:64787/1‑149 (MQ=255) aTCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGAt > 4:230082/1‑131 (MQ=255) aTCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGAt < 3:230082/131‑1 (MQ=255) aTCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGc < 8:40614/147‑1 (MQ=255) cTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTgcgg < 2:27013/125‑1 (MQ=255) ccTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGAc < 6:95675/147‑1 (MQ=255) tttCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACcttc > 3:231418/1‑149 (MQ=255) tCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACcttc < 1:83264/147‑1 (MQ=255) cACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACcttctt < 5:147753/148‑1 (MQ=255) cACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGATGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCttcttc > 8:73294/1‑149 (MQ=255) aCTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGAt < 4:196181/120‑1 (MQ=255) aCTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCttcttc > 5:322643/1‑148 (MQ=255) aCTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCttcttc < 6:231030/148‑1 (MQ=255) aCTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCttcttc > 5:231030/1‑148 (MQ=255) cTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGa < 8:232528/149‑1 (MQ=255) tGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGcgcc > 3:271202/1‑129 (MQ=255) tGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGcgcc < 4:271202/129‑1 (MQ=255) tGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAg > 5:54278/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTACATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGa < 8:185560/146‑1 (MQ=255) aTCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTACATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGa > 7:185560/1‑146 (MQ=255) aTCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTACATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGa > 7:180435/1‑146 (MQ=255) aTCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTACATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGa < 8:180435/146‑1 (MQ=255) cggcggCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGt > 6:160475/1‑149 (MQ=255) cggcgCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTtgg < 3:316410/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTtggtg < 3:76516/149‑1 (MQ=255) ctctACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCt > 4:42498/1‑149 (MQ=255) ctctACATGAAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTCCCTTCAACGCTGCGGCGATGTCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGATGAGTTGGTGGTGCt > 7:136811/1‑149 (MQ=255) aTGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGc > 3:181957/1‑149 (MQ=255) gCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCg < 3:248983/86‑1 (MQ=255) gCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCg > 4:248983/1‑86 (MQ=255) cAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCa < 4:231418/148‑1 (MQ=255) cAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCAt > 5:217522/1‑149 (MQ=255) aGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCAtt > 4:345763/1‑149 (MQ=255) tggtgCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGc < 3:42498/149‑1 (MQ=255) gtgCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCg < 1:50701/148‑1 (MQ=255) gtgCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCg < 5:160475/148‑1 (MQ=255) tgCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCgg > 2:229661/1‑148 (MQ=255) cTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAAt > 4:331196/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATc < 6:217522/147‑1 (MQ=255) aCCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGCCCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGcggcgg > 8:19536/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCACCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCg > 6:180911/1‑132 (MQ=255) ccTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCACCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCg < 5:180911/132‑1 (MQ=255) cgctcggCATCCTGCAGCGTGTTCCGATCCTGTTGATGGCCGGCTGTGCCGTCCTCGCTGCGTCGCAGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGCTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGACTCGTTGCGGCGGGCAACCAt < 8:69875/143‑1 (MQ=255) cGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCAt > 5:255429/1‑149 (MQ=255) cGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCAt < 6:322643/149‑1 (MQ=255) cGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGCTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCAt < 6:54278/149‑1 (MQ=255) gCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGcggcgg > 8:171106/1‑135 (MQ=255) gCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGcggcgg < 7:171106/135‑1 (MQ=255) aTCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGAAGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATctg > 2:149239/1‑123 (MQ=255) ccTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGAGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATAc > 5:268607/1‑149 (MQ=255) cttcAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATAc < 6:253993/145‑1 (MQ=255) ctgCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGc < 1:127292/147‑1 (MQ=255) cAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTTTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGTCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGTTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGc < 8:136811/149‑1 (MQ=255) cAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTc < 4:44264/147‑1 (MQ=255) ttATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAAcc < 4:64787/149‑1 (MQ=255) ttATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAAcc > 4:106792/1‑149 (MQ=255) tATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAAccc > 3:168833/1‑149 (MQ=255) cGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATg < 4:181957/149‑1 (MQ=255) ttGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGt < 6:255429/149‑1 (MQ=255) ttCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGtt < 6:268607/148‑1 (MQ=255) | AAACATCGCGCCTGAATCGGGAACGGCGCTTTCTGGTGCTGCTGGGGCTGATCTGCCTTTCACTGATCGGCGGCGCCCTCTACATGCAGGTGGTGCTCGGCGAGGCACCCTGCCCGCTGTGCATCCTGCAGCGTTATGCGTTGCTGTTCATTGCCGTGTTTGCCTTCATCGCTGCGGCGATGCCCGGGCGCCGCAGCCTGACCTTCTTCGAGGCGTTGGTGGTGCTCAGTGCCATTGGCGGAATCGTTGCGGCGGGCAACCATGTGTATATACTCGCCAACCCCATGGTCAGTT > NC_002947/949169‑949462 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |