Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,023,926 | A→T | 6.8% | Y407* (TAT→TAA) ‡ | opdP ← | glycine‑glutamate dipeptide porin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,023,926 | 0 | A | T | 6.8% | 217.9 / 5.2 | 74 | Y407* (TAT→TAA) ‡ | opdP | glycine‑glutamate dipeptide porin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/39); new base T (2/3); total (32/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.81e-01 |
CGGAATGGTGGTGACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGCACATAGGAAAG > NC_002947/1023782‑1024069 | cGGAACGGGGGTGACCACGCGGAACTCACCCAGGCTGCCAGCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGCGGTGTAGGTGGCGCGGACGCCGGTGTCCTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGt < 8:227305/149‑1 (MQ=255) ggAATGGTGGTGACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTg < 5:171429/149‑1 (MQ=255) cgactggtgtTCACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGAGGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTg < 8:195249/145‑1 (MQ=255) gAATGGTGGTGACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTgg < 6:66353/149‑1 (MQ=255) ggtggtGACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGttt > 4:96907/1‑149 (MQ=255) gtggtgACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTc < 2:207248/149‑1 (MQ=255) gtggtgACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTATGAGTggggtat < 3:216213/149‑5 (MQ=255) gtggtgACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGGCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTc < 7:298471/149‑1 (MQ=255) gtgACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGcc < 6:202269/149‑1 (MQ=255) cACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATc > 7:277869/1‑147 (MQ=255) cgcgGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTATGAGTgggg < 1:61872/136‑2 (MQ=255) cgcgGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTATGAGTgggg > 2:61872/1‑135 (MQ=255) gcgGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGc > 2:40310/1‑149 (MQ=255) ggAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCAATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGTAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGt > 5:162836/1‑129 (MQ=255) ggAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCAATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGTAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGt < 6:162836/129‑1 (MQ=255) tCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACTCGTAGCTGGTGCCTATACCCCACTATGAGTggggta < 5:331532/130‑4 (MQ=255) tCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCAc > 8:23397/1‑149 (MQ=255) tCATACAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAAAGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTATGAGTggggta > 6:331532/1‑127 (MQ=255) aTCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCAc < 4:19378/147‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCAcgtcg > 2:298201/1‑148 (MQ=255) ggCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAg > 3:72799/1‑149 (MQ=255) gCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTggg > 4:197057/1‑119 (MQ=255) gCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTggg < 3:197057/119‑1 (MQ=255) ccATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGGTAGTGTCTTTCTGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAg < 1:115579/148‑1 (MQ=255) aTCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGc > 3:329701/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCTGGGACTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGc > 3:259638/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGATTCGCCAACCAGCCCATACACGTCGAAGGCAGTGcc > 2:285903/1‑149 (MQ=255) cccTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCAcgtcgt < 4:36225/136‑1 (MQ=255) cccTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCAcgtcgt > 3:36225/1‑136 (MQ=255) ggCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGt < 4:272816/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTg < 1:298201/149‑1 (MQ=255) ccTTGCTTGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCGTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTgg < 4:324525/149‑1 (MQ=255) ccTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTgg < 5:354818/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTgg > 1:158169/1‑96 (MQ=255) cTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTgg < 2:158169/96‑1 (MQ=255) cgcgATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTc > 2:205677/1‑148 (MQ=255) gATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGGCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATa < 2:269775/149‑1 (MQ=255) ggtggtGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATAcccc < 1:76454/149‑1 (MQ=255) ggtggtGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATAccc > 3:268058/1‑148 (MQ=255) gtgtAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGcc > 4:185768/1‑149 (MQ=255) gtAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATATCCCAGCcgc < 4:128188/149‑1 (MQ=255) gTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCAt < 8:297639/70‑1 (MQ=255) gTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCAt > 7:297639/1‑70 (MQ=255) gcgcGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGtt < 1:285903/149‑1 (MQ=255) cgcgGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTg < 3:96907/149‑1 (MQ=255) cgcgGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTg < 7:23397/149‑1 (MQ=255) gtgtCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGcc > 1:99701/1‑113 (MQ=255) gtgtCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGcc < 2:99701/113‑1 (MQ=255) tttCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACtt > 4:326671/1‑147 (MQ=255) tttCAGCGGCCCCCTCTGCACCGCGTAGCAGGTCCCCATACCCAACTCATAGTGGGTTTCGCCAACCAGGCCATTCACCTCGTAGGAAGAGCCGCGCTAGACGCTGCCGTCGATACCAAAGCCCCGGGCGATGTACAGGTTGAACtt > 4:274275/1‑147 (MQ=255) tCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTca < 3:185768/147‑1 (MQ=255) aGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCAATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTcaggc > 8:185328/1‑148 (MQ=255) cGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTcaggccag > 3:272990/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGAt < 4:10811/106‑1 (MQ=255) gCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGAt > 3:10811/1‑106 (MQ=255) gCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTcaggccaggc < 4:268058/149‑1 (MQ=255) gCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTcaggccagg > 4:108626/1‑148 (MQ=255) cGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGTCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACg > 1:335536/1‑149 (MQ=255) cAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAgg > 7:127441/1‑149 (MQ=255) aaCGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAggg > 7:324502/1‑149 (MQ=255) gTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTg < 1:83046/118‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTg > 2:83046/1‑118 (MQ=255) cTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGtt < 3:108626/149‑1 (MQ=255) gTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCCCGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTc < 3:274275/147‑1 (MQ=255) gTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTAGAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCa < 1:205677/148‑1 (MQ=255) gTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCa < 5:99331/148‑1 (MQ=255) tGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGTCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGc < 2:335536/149‑1 (MQ=255) tGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGc < 1:40310/149‑1 (MQ=255) gCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGca > 5:68358/1‑149 (MQ=255) aTACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGCACATa < 8:277869/149‑1 (MQ=255) aTACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGCACATa < 3:326671/149‑1 (MQ=255) ccccACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGCACATAGGa < 8:324502/149‑1 (MQ=255) cccACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGCACATAGGa > 8:191366/1‑148 (MQ=255) cACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGCACATAGGAAAg < 8:127441/149‑1 (MQ=255) aTAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGcc > 6:168970/1‑124 (MQ=255) aTAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGcc < 5:168970/124‑1 (MQ=255) | CGGAATGGTGGTGACCACGCGGAACTCATCCAGGCTGCCATCGCCCTGGGCCTTGCTGGCGCGATGGGTGGTGTAGGTGGCGCGGATGCTGGTGTCTTTCAGCGGCCCGCTCTGCAACGCGTAGCTGGTGCCGATACCCCACTCATAGTGGGTTTCGCCATCCAGGCCATTCACGTCGTAGGCAGTGCCGCGGTAGTGGGTGCCGTCGATACCCCAGCCGCGGGCGTTGTACAGGTTGAACTTCAGGCCAGGCACGCCATAGGGCGCCATGTTCAGCACATAGGAAAG > NC_002947/1023782‑1024069 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |