| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,134,089 | A→T | 7.1% | intergenic (+34/+44) | PP_0995 → / ← gltS | membrane protein/glutamate:sodium symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,134,089 | 0 | A | T | 7.1% | 197.8 / 4.9 | 70 | intergenic (+34/+44) | PP_0995/gltS | membrane protein/glutamate:sodium symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/32); new base T (2/3); total (35/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.10e-01 | |||||||||||
CCTGCATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAGGC > NC_002947/1133944‑1134234 | cctgcATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAacgacgg > 2:148163/1‑148 (MQ=255) tgcATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAacga < 5:167916/144‑1 (MQ=255) tgcATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAacga > 6:167916/1‑144 (MQ=255) aTTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGa < 1:155202/149‑1 (MQ=255) aTTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGa < 3:279684/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGTCGTTCTGag < 1:361473/149‑2 (MQ=255) ggAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGTCGTTCTGagttgcgt < 2:152577/149‑8 (MQ=255) ggAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGAttgcttg > 1:156755/1‑149 (MQ=255) gggCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAacgac > 8:234494/1‑129 (MQ=255) gggCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAacgac < 7:234494/129‑1 (MQ=255) gggCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTgg > 3:80763/1‑149 (MQ=255) gCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTca > 7:117570/1‑148 (MQ=255) gCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCAGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTca > 7:134131/1‑148 (MQ=255) gCCGTTCTGGGGGGGGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTcac < 2:89683/149‑1 (MQ=255) ttCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGAGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGt > 5:37713/1‑149 (MQ=255) gggTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTc < 4:107291/146‑1 (MQ=255) ggTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGa < 2:325368/149‑1 (MQ=255) tgtgGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGTCGTTCTGa < 8:104267/116‑1 (MQ=255) tgtgGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGTCGTTCTGa > 7:104267/1‑116 (MQ=255) tgGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGAGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGc < 6:37713/149‑1 (MQ=255) tATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCtt > 7:193846/1‑148 (MQ=255) tGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAAc < 4:19391/149‑1 (MQ=255) tCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGGCCTCGCTTAAccc > 7:284689/1‑149 (MQ=255) tCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAAccc > 6:60953/1‑149 (MQ=255) cTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCg > 3:296643/1‑148 (MQ=255) ggCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGGTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGcaa < 6:88940/148‑1 (MQ=255) cTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAAcc > 4:54455/1‑148 (MQ=255) tCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAAcc > 5:119195/1‑147 (MQ=255) tCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAAcc > 6:317585/1‑147 (MQ=255) gTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAgg < 4:80763/149‑1 (MQ=255) gTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAgg < 5:317585/149‑1 (MQ=255) gCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGc > 6:300390/1‑148 (MQ=255) cGACGGTACTCAGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAAt < 8:134131/149‑1 (MQ=255) aCGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAATCCAAGGCAAt > 7:84206/1‑147 (MQ=255) aCGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGc < 3:54455/149‑1 (MQ=255) aCGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCAGGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAATCCAAGGCAAt < 8:84206/147‑1 (MQ=255) ggTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGc > 8:143676/1‑147 (MQ=255) gTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAg < 2:221272/149‑1 (MQ=255) aCTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCa < 5:228736/135‑1 (MQ=255) aCTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCa > 6:228736/1‑135 (MQ=255) tCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTa > 1:209883/1‑148 (MQ=255) gTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGc > 3:136739/1‑149 (MQ=255) tGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAAc < 5:51554/116‑1 (MQ=255) tGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAAc > 6:51554/1‑116 (MQ=255) ccTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACAAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTg < 2:156755/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAg < 8:194981/138‑1 (MQ=255) cTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAg > 7:194981/1‑138 (MQ=255) tggtggGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTc > 8:149769/1‑97 (MQ=255) tggtggGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTc < 7:149769/97‑1 (MQ=255) gtggGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGTTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGAt < 1:148163/147‑1 (MQ=255) gCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCGTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGAt > 6:217819/1‑148 (MQ=255) ctgcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATtgatga < 8:117570/148‑1 (MQ=255) tgcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGTTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAAt < 8:139882/113‑1 (MQ=255) tgcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGTTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAAt > 7:139882/1‑113 (MQ=255) tgcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGatgatg > 3:87082/1‑149 (MQ=255) gTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCg < 1:153508/149‑1 (MQ=255) tGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGAt > 1:2113/1‑149 (MQ=255) gTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGa < 8:287905/146‑1 (MQ=255) gTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGa > 7:287905/1‑146 (MQ=255) tAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATgaa < 5:300390/149‑1 (MQ=255) aGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGa > 4:231108/1‑126 (MQ=255) aGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGa < 3:231108/126‑1 (MQ=255) cTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAAc > 3:322124/1‑149 (MQ=255) tGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACg > 5:118704/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGccc < 2:209883/148‑1 (MQ=255) cGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTACCCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGccccc > 7:330142/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCccac < 4:87082/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCccacc < 6:119195/149‑1 (MQ=255) gCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATc < 4:136739/149‑1 (MQ=255) cccACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCgg < 4:296643/149‑1 (MQ=255) ccACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTa < 6:369389/94‑1 (MQ=255) ccACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCGTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTa > 5:369389/1‑94 (MQ=255) cACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGca > 3:340713/1‑149 (MQ=255) gcaatCAGAACGTCGTTCTGATTGCTTGCCCGGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGGACCAACCCAAGGCTATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTAGATGAAGACCGCCCCCACCATCGGcacgac > 6:229294/5‑149 (MQ=255) gAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGACCGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAg > 3:282248/1‑149 (MQ=255) cgacgTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACTTTGATGATGTCGATGAAGACCGCCCCCACCATCGGCACCACCTGGAAGGc > 8:293567/1‑148 (MQ=255) cgacgTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAGGc > 2:332011/1‑148 (MQ=255) | CCTGCATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGATTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAGGC > NC_002947/1133944‑1134234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |