| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 7,289 | T→C | 7.9% | N289D (AAC→GAC) ‡ | oxaA ← | membrane protein insertase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 7,289 | 0 | T | C | 7.9% | 172.0 / 5.0 | 63 | N289D (AAC→GAC) ‡ | oxaA | membrane protein insertase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/33); new base C (2/3); total (27/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.40e-01 | |||||||||||
GACAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCTCAGAAGCTGTCCA > NC_002947/7141‑7430 | gACAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgtt > 6:168159/1‑149 (MQ=255)gACAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgtt < 2:311035/149‑1 (MQ=255) aaCTCTTTCAGCTTGGACTTGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCCCTGGTTTCGAACTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTAGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgttgat > 6:233593/1‑147 (MQ=255) aaCTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgttgtt > 6:22950/1‑149 (MQ=255) aaCTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgttgtt > 6:28172/1‑149 (MQ=255) aCTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGttgttg > 5:94327/1‑149 (MQ=255) aCTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGCTTTCGTCCTTGCCGCCAGCCGGTACGCAGATAACCGGGCCCGAGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTTCGGGTCTGGACAACGttgttg > 1:278733/1‑149 (MQ=255) ctctTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTTCAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTtgttgt > 7:216502/1‑149 (MQ=255) ctctTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTtgttgt < 1:128482/149‑1 (MQ=255) tttCATCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCGTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACTACAACGTTGTcca < 6:355374/149‑2 (MQ=255) tttCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACAACGTTGTcca < 8:217125/149‑2 (MQ=255) tttCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACAACGTTGTc > 7:217125/1‑147 (MQ=255) tCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTcc < 2:59800/146‑1 (MQ=255) aGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGTGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTTCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACAACGTTGTccagacc < 1:75896/149‑6 (MQ=255) 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cGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCAGGAATCCAGGCGGTCACGAag > 4:342870/1‑149 (MQ=255) tACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAagta < 5:168159/149‑1 (MQ=255) cagcagGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATACTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGGCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAagtag < 3:72928/148‑1 (MQ=255) agcagGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGc > 8:221830/1‑122 (MQ=255) agcagGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGc < 7:221830/122‑1 (MQ=255) agcagGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGc > 3:145970/1‑134 (MQ=255) agcagGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGc < 4:145970/134‑1 (MQ=255) ggCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGtgc < 7:125043/145‑1 (MQ=255) ggCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGtgc > 8:125043/1‑145 (MQ=255) gCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAg > 8:89911/1‑149 (MQ=255) tGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgttg < 7:327435/98‑1 (MQ=255) tGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACgttg > 8:327435/1‑98 (MQ=255) tGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCg > 6:349559/1‑125 (MQ=255) tGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCg < 5:349559/125‑1 (MQ=255) tGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAg > 1:213723/1‑149 (MQ=255) gTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAgg > 8:122804/1‑121 (MQ=255) gTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAgg < 7:122804/121‑1 (MQ=255) gTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAg < 1:91320/147‑1 (MQ=255) ttGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAgcc > 8:11701/1‑149 (MQ=255) cgccAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGccgccg < 7:290156/149‑1 (MQ=255) gccAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGccgccg > 6:186369/1‑148 (MQ=255) gTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGc < 4:209459/122‑1 (MQ=255) gTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGc > 3:209459/1‑122 (MQ=255) gTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACAttt > 6:76369/1‑149 (MQ=255) gTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACAttt > 8:994/1‑149 (MQ=255) gCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATtttctt < 4:256244/149‑1 (MQ=255) aCCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAAc > 1:54352/1‑148 (MQ=255) tAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGAt < 2:236517/149‑1 (MQ=255) ccGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAgg < 7:283409/73‑1 (MQ=255) ccGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAgg > 8:283409/1‑73 (MQ=255) 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gTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCgaga < 5:22950/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCgaga < 5:28172/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATc < 5:208338/142‑1 (MQ=255) gCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCAAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATc > 6:208338/1‑142 (MQ=255) ccTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCttt < 1:333749/149‑1 (MQ=255) tGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCttttt > 1:227021/1‑149 (MQ=255) gCTATCCTTGCGGGTCTGTACTACGTTGTTGTCAGACTTGGCCGGAATCGAGGAGGTCAGGAAGTAGTGCTGCAGCCAGTCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCttttt < 5:233593/147‑1 (MQ=255) tATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACAtt > 5:239202/1‑100 (MQ=255) tATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACAtt < 6:239202/100‑1 (MQ=255) tCCTTGCGGGTCTTGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAg < 5:76369/148‑1 (MQ=255) tCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAgg < 7:994/149‑1 (MQ=255) tCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAg < 2:213723/148‑1 (MQ=255) cTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGc < 7:89911/148‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCt > 2:328864/1‑148 (MQ=255) gCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCTCa < 2:54352/148‑1 (MQ=255) agtcggACAACAACGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGATCAGAAGc > 6:290107/5‑149 (MQ=255) gACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCTCAGAAGCTGTcc > 6:303972/1‑149 (MQ=255) gACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCTCAGAAGCTGTc < 3:342870/148‑1 (MQ=255) aCAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCTCAGAAGCTGTCca < 7:11701/149‑1 (MQ=255) aaCGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCTCAGAAGCTGTCca > 3:185042/1‑147 (MQ=255) | GACAACTCTTTCAGCTTGGACTGGATCTTCGGGCCGGCGTACAGCAGGGCACTGGTTTCGACCTTGCCGCCAGCCGGTACGCTGATAACCGGGCCGGTGTAGCCGATGATGTAGTTGCCCTGGCTATCCTTGCGGGTCTGGACAACGTTGTTGTCCGACTTGGCCGGAATCCAGGCGGTCACGAAGTAGTGCTGCAGCCAGGCAACCCAGCCGCCGGACACATTTTCTTTCAAACTACCTTTGTCGATGTCCTTCATCGAGACCTTTTTGTAAGGCTCAGAAGCTGTCCA > NC_002947/7141‑7430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |