| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,643,949 | T→C | 6.2% | K265E (AAG→GAG) | lon‑I ← | DNA‑binding ATP‑dependent protease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,643,949 | 0 | T | C | 6.2% | 235.4 / 4.4 | 80 | K265E (AAG→GAG) | lon‑I | DNA‑binding ATP‑dependent protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/35); new base C (3/2); total (43/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGTTTGCCCATCTCTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAGCA > NC_002947/1643803‑1644092 | cAGTTTGCCCATCTCTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGa < 4:288104/149‑1 (MQ=255) aGTTTGCCCATCTCTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTTCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAg < 1:265890/149‑1 (MQ=255) gCCCATCTCTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGgaag < 8:173004/148‑1 (MQ=255) ccATCTCTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAAc > 3:160701/1‑149 (MQ=255) tctcTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGAGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTcg > 5:254735/1‑149 (MQ=255) ttCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCt > 5:19366/1‑149 (MQ=255) ttCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCt > 2:39358/1‑149 (MQ=255) cATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTCTTCCTCAAGGAACAACTcaagg < 3:163592/146‑5 (MQ=255) aTCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGgt < 2:326851/149‑1 (MQ=255) tCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCTAAGTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCTGACCCAGCTCTTGCTGGATGACGTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTg < 1:254847/146‑1 (MQ=255) tCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGACTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACAGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGACGAAGAACTCCCCCTg > 2:254847/1‑146 (MQ=255) gCGTGCCTGCGGTGGCAGGGGCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGTAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATc < 3:217308/148‑1 (MQ=255) gTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTTCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGc < 5:333056/149‑1 (MQ=255) gCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCg > 3:147340/1‑149 (MQ=255) cGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGtt < 6:19366/147‑1 (MQ=255) gCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTg > 5:104825/1‑121 (MQ=255) gCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTg < 6:104825/121‑1 (MQ=255) aGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCtt > 5:231362/1‑101 (MQ=255) aGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCtt < 6:231362/101‑1 (MQ=255) aGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGtt > 6:177674/1‑140 (MQ=255) aGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGtt < 5:177674/140‑1 (MQ=255) aGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCGGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGc < 1:39358/149‑1 (MQ=255) tCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCgag < 6:270104/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCAGGCGCTGTTCGTACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCGCCAGCTCTTGGTGGATGACCTTGAGTTGTTCGTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTTCCGGTTGACCTCGGCCGAGAtc < 3:74276/148‑1 (MQ=255) gCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTAAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGAtct > 1:146353/1‑149 (MQ=255) ccTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGAtctc < 4:160701/149‑1 (MQ=255) ccTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGAtctc > 5:101884/1‑149 (MQ=255) ccTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGGCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGAtct < 4:252756/148‑1 (MQ=255) ccAGGCGATTTTAGAACTGTTCAAGGTCGTCGCTTCTGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTAGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGtt < 3:39381/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTc < 6:101884/148‑1 (MQ=255) ggCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTg > 8:243225/1‑148 (MQ=255) gcgcTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGc > 5:260085/1‑148 (MQ=255) ttCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAgcgcg > 8:318713/1‑149 (MQ=255) ttCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAgcgcg > 2:118697/1‑149 (MQ=255) ttCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAgcgcg > 3:126694/1‑149 (MQ=255) aaCTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGTCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGAc > 6:30568/1‑149 (MQ=255) aCTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACt > 4:137305/1‑149 (MQ=255) ttCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCt < 1:133226/113‑1 (MQ=255) ttCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCt > 2:133226/1‑113 (MQ=255) ttCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTc < 8:195708/147‑1 (MQ=255) ttCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCa > 8:279058/1‑149 (MQ=255) aaGGTCGGCGCTGCGGTGGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACct > 7:302494/1‑149 (MQ=255) aGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTCTTCCTCAAGGAACAACTcaa < 7:100550/79‑3 (MQ=37) aGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTCTTCCTCAAGGAACAACTcaa > 8:100550/1‑77 (MQ=37) ggTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGtt < 5:242499/124‑1 (MQ=255) ggTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGtt > 6:242499/1‑124 (MQ=255) ggTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTCCCACctct > 4:200169/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTgc < 7:318713/149‑1 (MQ=255) ggTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCAtt < 6:260085/149‑1 (MQ=255) gtcgtcCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTg < 4:147340/149‑1 (MQ=255) tcCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTgg > 8:112926/1‑146 (MQ=255) tcCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCa < 7:112926/148‑1 (MQ=255) ccTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAg > 5:287911/1‑148 (MQ=255) cTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGTCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACtt > 2:41800/1‑122 (MQ=255) cTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGTCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACtt < 1:41800/122‑1 (MQ=255) ttGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTAc > 5:277189/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTAc < 7:243225/147‑1 (MQ=255) ccccAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCgca > 3:115139/1‑128 (MQ=255) ccccAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCgca < 4:115139/128‑1 (MQ=255) ccccAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCa > 5:290767/1‑149 (MQ=255) ccccAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCa > 3:153612/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCtt < 3:163639/142‑1 (MQ=255) ccAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCtt > 4:163639/1‑142 (MQ=255) cAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGc > 7:135462/1‑149 (MQ=255) ctTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGttt > 3:158665/1‑148 (MQ=255) ttGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGttt < 7:279058/147‑1 (MQ=255) gCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTcc < 6:145553/137‑1 (MQ=255) gCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTcc > 5:145553/1‑137 (MQ=255) cTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCAt < 6:140149/138‑1 (MQ=255) cTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCAt > 5:140149/1‑138 (MQ=255) tGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCAt > 8:283472/1‑149 (MQ=255) ccagcgcgAGTTCTTCCTCAAGGAACAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATggg > 7:16471/8‑148 (MQ=255) ccagcgcgAGTTCTTCCTCAAGGAACAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATggg > 1:236204/8‑148 (MQ=255) aCCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCAc < 8:302494/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACg > 3:341481/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCGTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTTAGCAGGGGCACg > 3:271715/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACg > 4:335567/1‑147 (MQ=255) gttgttCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATggg < 6:78503/139‑1 (MQ=255) gttgttCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATggg > 5:78503/1‑139 (MQ=255) ttgttCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGa < 7:283472/149‑1 (MQ=255) gttCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTCCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAg < 3:200169/148‑1 (MQ=255) ttCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAGCa > 7:25695/1‑149 (MQ=255) | CAGTTTGCCCATCTCTTCATCGATGCGCTTGCGTGCCTGCGGTGGCAGGGTCTTGCCTTCCAGGCGCTGTTCGAACTGTTCAAGGTCGGCGCTGCGGTCGTCCTTGGTCAGCCCCAGCTCTTGCTGGATGACCTTGAGTTGTTCCTTGAGGAAGAACTCGCGCTGGTGTTCGCCGATCTGCCGGTTGACCTCGGCCGAGATCTCGTTCTGCAAGCGCGCGACTTCCACCTCTTTGCGCAGCATTGGCAGTACCTTTTCCATGCGTTTGAGCATGGGCACGCAGTCGAGCA > NC_002947/1643803‑1644092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |