| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 163,722 | G→C | 6.8% | R38G (CGC→GGC) | scpC ← | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 163,722 | 0 | G | C | 6.8% | 222.7 / 6.2 | 73 | R38G (CGC→GGC) | scpC | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/38); new base C (2/3); total (32/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.63e-01 | |||||||||||
CGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAACTACT > NC_002947/163580‑163863 | cggcggGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGa < 6:61067/148‑1 (MQ=255) gggCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGAGTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCg > 8:18880/1‑149 (MQ=255) gCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCt < 7:93239/149‑1 (MQ=255) gCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCACCCGCGCCGGCGAAGccaag < 6:32683/149‑4 (MQ=255) gCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCACCCGCGCCGGCGAAGccaag < 4:210521/149‑4 (MQ=255) ccAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTc < 7:47568/149‑1 (MQ=255) cAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGGTGCGCCGGCGCGGGTGAGGCCGCTCa > 2:122614/1‑149 (MQ=255) aaCACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCAt < 1:197788/149‑1 (MQ=255) aaCACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCAt > 3:116880/1‑149 (MQ=255) cacccCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGGCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCGGATTTTCAGGGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGc < 1:122614/149‑1 (MQ=255) acCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGa > 7:294204/1‑149 (MQ=255) acCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGa > 5:79566/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATg < 8:187560/149‑1 (MQ=255) aGTTGTATGTCGAGGTCTTTGCCCAGGCTGTCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCTGTGGCGTTTGGTTGGGAGGTTCGGCCATTGCATGCGGTAGGGGCTTGGCTTGGCCGGGGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACTGTCATGCCGTc < 4:71001/149‑1 (MQ=255) ttgtttgtCCAGGTCATTGCACAGGCTGGCTCCGGTCATCAGGCTGATTTGCAGTGGCGATTGCTTGTCACGTTCGGCCAATGCATGCGTTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACATTCATGCAGTCCt < 7:155079/149‑1 (MQ=255) gtttgtCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTc > 5:134080/1‑148 (MQ=255) cAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGa < 4:116880/148‑1 (MQ=255) cAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGAc > 1:18433/1‑149 (MQ=255) aGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGAc > 1:338914/1‑148 (MQ=255) ggTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGAc > 5:178652/1‑147 (MQ=255) gTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAg > 6:242579/1‑149 (MQ=255) aTTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCg < 6:134080/148‑1 (MQ=255) gCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCACCCGCGCCGGCGAAGccaa > 2:105122/1‑105 (MQ=255) gCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCACCCGCGCCGGCGAAGccaa < 1:105122/107‑3 (MQ=255) cccAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCg > 6:355854/1‑144 (MQ=255) cccAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCg < 5:355854/144‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGAc < 3:228253/137‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGAc > 4:228253/1‑137 (MQ=255) aGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGc < 5:124227/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGcc < 2:338914/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCa > 2:321763/1‑148 (MQ=255) gcgcCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCa < 8:56569/147‑1 (MQ=255) cGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCAtt < 1:321763/149‑1 (MQ=255) gTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTAc < 5:242579/149‑1 (MQ=255) aTTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGc < 2:207386/147‑1 (MQ=255) aTTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAg > 2:34225/1‑149 (MQ=255) tttCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAgg > 1:316981/1‑148 (MQ=255) ttCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAggg < 7:18880/148‑1 (MQ=255) ttCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAggg < 6:178652/148‑1 (MQ=255) tCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGgga < 5:182851/148‑1 (MQ=255) gCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCAc > 5:118599/1‑120 (MQ=255) gCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCAc < 6:118599/120‑1 (MQ=255) gCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGAt > 3:96835/1‑148 (MQ=255) aCGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGggag < 1:41615/130‑1 (MQ=255) aCGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGggag > 2:41615/1‑130 (MQ=255) cGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACg < 7:222837/149‑1 (MQ=255) ttCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGt < 2:18433/149‑1 (MQ=255) cGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCTTGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTa < 6:79566/148‑1 (MQ=255) ggCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTAc < 1:34225/148‑1 (MQ=255) gCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACAt < 3:105579/149‑1 (MQ=255) gCCAATGCATGCGGTACGACCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACAt < 4:235130/149‑1 (MQ=255) cAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGAATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGTACAAGCGGATACGATCACGGTACATg > 5:254454/1‑148 (MQ=255) aaTGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGCTCACGGTACATGGa > 4:272599/1‑149 (MQ=255) gcatgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGc > 3:18306/1‑124 (MQ=255) gcatgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGc < 4:18306/124‑1 (MQ=255) catgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAATCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGt > 1:275589/1‑149 (MQ=255) atgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCAt < 6:209145/96‑1 (MQ=255) atgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCAt > 5:209145/1‑96 (MQ=255) atgcGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGt > 4:305986/1‑148 (MQ=255) gTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTAtctc < 4:96835/149‑1 (MQ=255) tACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCg < 3:305986/149‑1 (MQ=255) cGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCgg < 5:23839/148‑1 (MQ=255) gagcggCTTCACCCGCGCCGGCGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTa > 6:68527/5‑149 (MQ=255) gCTTCGCCTGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACAt < 6:251805/125‑1 (MQ=255) gCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACAt > 5:251805/1‑125 (MQ=255) tttCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGaaa < 7:261971/148‑1 (MQ=255) ttCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAac > 8:150974/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGGCGCGGGAGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAac > 7:306900/1‑149 (MQ=255) tCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGaaa > 8:261971/1‑147 (MQ=255) gCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAactac > 5:63508/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAactact < 8:294204/149‑1 (MQ=255) cGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAg > 3:92139/1‑88 (MQ=255) cGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAg < 4:92139/88‑1 (MQ=255) | CGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGTCCAGGTCATTGCCCAGGCTGGCGCCGGTCATCAGGCTGATTTTCAGTGGCGATTGCTTGGCACGTTCGGCCAATGCATGCGGTACGGCCTTGGCTTCGCCGGCGCGGGTGAAGCCGCTCATGCCGACAGTCATGCCGTCCTCGATCAGACCAGCGGCATCAGCCGCACTCATTACCTTGCTGTGCAGGGAGGACAAGCGGATACGATCACGGTACATGGATTGTTATCTCGGGCTACTGAAACTACT > NC_002947/163580‑163863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |